RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493601.5

PTPRU-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRU, Length 695 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-208ENST00000493601 MIGA1Q8NAN2 632 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRU-208ENST00000493601 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PTPRU-208ENST00000493601 INHAP05111 366 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRU-208ENST00000493601 ELNP15502 786 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRU-208ENST00000493601 USP5P45974 858 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRU-208ENST00000493601 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PTPRU-208ENST00000493601 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PTPRU-208ENST00000493601 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRU-208ENST00000493601 NAV1Q8NEY1 1877 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRU-208ENST00000493601 DOCK3Q8IZD9 2030 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRU-208ENST00000493601 C19orf81C9J6K1 198 aa20.23■□□□□ 0.83
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PTPRU-208ENST00000493601 UNC93B1Q9H1C4 597 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRU-208ENST00000493601 TAOK2Q9UL54 1235 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRU-208ENST00000493601 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRU-208ENST00000493601 USP17L10C9JJH3 530 aa20.22■□□□□ 0.83
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PTPRU-208ENST00000493601 JAG1P78504 1218 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRU-208ENST00000493601 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
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PTPRU-208ENST00000493601 ANTXR1Q9H6X2 564 aa20.22■□□□□ 0.83
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PTPRU-208ENST00000493601 CEP290O15078 2479 aa20.22■□□□□ 0.83
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PTPRU-208ENST00000493601 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
PTPRU-208ENST00000493601 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRU-208ENST00000493601 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
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PTPRU-208ENST00000493601 EHD4Q9H223 541 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRU-208ENST00000493601 MORF4L1Q9UBU8 362 aa20.21■□□□□ 0.83
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PTPRU-208ENST00000493601 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
PTPRU-208ENST00000493601 HTATIP2Q9BUP3 242 aa20.2■□□□□ 0.82
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PTPRU-208ENST00000493601 H0YGN5 161 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRU-208ENST00000493601 SGPL1O95470 568 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRU-208ENST00000493601 TTC6Q86TZ1 520 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRU-208ENST00000493601 DPF3Q92784 378 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRU-208ENST00000493601 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
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PTPRU-208ENST00000493601 HERVK_113P62684 666 aa20.18■□□□□ 0.82
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PTPRU-208ENST00000493601 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
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PTPRU-208ENST00000493601 GOLIM4O00461 696 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRU-208ENST00000493601 RAB11FIP3O75154 756 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRU-208ENST00000493601 ABCB5Q2M3G0 1257 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRU-208ENST00000493601 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PTPRU-208ENST00000493601 SIRT2Q8IXJ6 389 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRU-208ENST00000493601 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.82
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PTPRU-208ENST00000493601 MAPK4P31152 587 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 USP14P54578 494 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 PDE3AQ14432 1141 aa20.14■□□□□ 0.81
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PTPRU-208ENST00000493601 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 C12orf42Q96LP6 360 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 TXNRD2Q9NNW7 524 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 CABP5Q9NP86 173 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 MYH7P12883 1935 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 ZNF532Q9HCE3 1301 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 SHMT1P34896 483 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 ERVK-9P63128 1117 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 ERVK-24P63145 666 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 NUDT12Q9BQG2 462 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 NR2E3Q9Y5X4 410 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 RPTORQ8N122 1335 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 USP17L15C9J2P7 530 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRU-208ENST00000493601 USP17L13C9JLJ4 530 aa20.12■□□□□ 0.81
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