RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491952.1

TTC3-222, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 5

Gene TTC3, Length 247 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-222	ENST00000491952	GIPC1	O14908	333 aa		6.06	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	6.06	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		6.06	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		6.06	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		6.06	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		6.06	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	RIN3	Q8TB24	985 aa		6.06	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	CD320	Q9NPF0	282 aa		6.06	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	CELA3A	P09093	270 aa		6.05	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		6.05	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	SP110	Q9HB58	689 aa		6.05	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		6.05	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952		H3BS24	57 aa		6.04	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	FBXO24	O75426	580 aa		6.04	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	ESR1	P03372	595 aa		6.04	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	SRF	P11831	508 aa		6.04	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	LILRA6	Q6PI73	481 aa		6.04	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		6.04	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	CCDC120	Q96HB5	630 aa		6.04	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		6.04	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	NCAN	O14594	1321 aa		6.03	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	GFRA2	O00451	464 aa		6.03	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	FGD1	P98174	961 aa		6.03	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		6.03	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	RETREG2	Q8NC44	543 aa		6.03	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		6.03	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	SETDB2	Q96T68	719 aa		6.03	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	MIPEP	Q99797	713 aa		6.03	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		6.03	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	6.02	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	PRRG2	O14669	202 aa		6.02	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	GLDC	P23378	1020 aa		6.02	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	KIR3DL1	P43629	444 aa		6.02	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	CDK8	P49336	464 aa		6.02	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	TNK2	Q07912	1038 aa		6.02	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		6.02	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		6.02	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	SV2B	Q7L1I2	683 aa		6.02	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	HID1	Q8IV36	788 aa		6.02	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		6.02	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	PICK1	Q9NRD5	415 aa		6.02	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	NFIB	O00712	420 aa		6.01	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	HPX	P02790	462 aa		6.01	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	GAB4	Q2WGN9	574 aa		6.01	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	HDX	Q7Z353	690 aa		6.01	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	UBE2F	Q969M7	185 aa		6.01	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	KCNK12	Q9HB15	430 aa		6.01	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		6	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		6	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		6	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		6	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	6	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		6	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	DIRC2	Q96SL1	478 aa		6	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	6	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	C12orf49	Q9H741	205 aa		6	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		6	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		5.99	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	ERVFC1	P60507	584 aa		5.99	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	KCNA10	Q16322	511 aa		5.99	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		5.99	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	ABHD4	Q8TB40	342 aa		5.99	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952		Q96M66	194 aa		5.99	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		5.99	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		5.99	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	PDE4C	Q08493	712 aa		5.98	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		5.98	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	TTC6	Q86TZ1	520 aa		5.98	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		5.98	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		5.98	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		5.98	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	CBX7	O95931	251 aa		5.97	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	USP17L7	P0C7H9	530 aa		5.97	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	MAPK1	P28482	360 aa		5.97	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	GRK4	P32298	578 aa		5.97	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	ASB16	Q96NS5	453 aa		5.97	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	5.97	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		5.97	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		5.97	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
TTC3-222	ENST00000491952	WASH4P	A8MWX3	477 aa		5.96	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952		B8ZZF3	427 aa		5.96	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	TMEM253	P0C7T8	217 aa		5.96	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	CYP7A1	P22680	504 aa		5.96	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	CDH24	Q86UP0	819 aa		5.96	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		5.96	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	MYLIP	Q8WY64	445 aa		5.96	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	C20orf173	Q96LM9	149 aa		5.96	□□□□□ -1.46

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