RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 FAM221BA6H8Z2 402 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRC-212ENST00000491302 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa11.3□□□□□ -0.6
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PTPRC-212ENST00000491302 NCLP19338 710 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
PTPRC-212ENST00000491302 UNC5AQ6ZN44 842 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRC-212ENST00000491302 DYMQ7RTS9 669 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRC-212ENST00000491302 FAM178BQ8IXR5 827 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM87BQ96K49 555 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRC-212ENST00000491302 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
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PTPRC-212ENST00000491302 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
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PTPRC-212ENST00000491302 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
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PTPRC-212ENST00000491302 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa11.24□□□□□ -0.61
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PTPRC-212ENST00000491302 LTBP3Q9NS15 1303 aa11.24□□□□□ -0.61
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PTPRC-212ENST00000491302 USP21Q9UK80 565 aa11.23□□□□□ -0.61
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PTPRC-212ENST00000491302 NKG7Q16617 165 aa11.22□□□□□ -0.61
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PTPRC-212ENST00000491302 C9orf172C9J069 976 aa11.21□□□□□ -0.61
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PTPRC-212ENST00000491302 FAM86C2PA6NEL3 165 aa11.2□□□□□ -0.62
PTPRC-212ENST00000491302 GAS2O43903 313 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
PTPRC-212ENST00000491302 NAT2P11245 290 aa11.2□□□□□ -0.62
PTPRC-212ENST00000491302 USP11P51784 963 aa11.2□□□□□ -0.62
PTPRC-212ENST00000491302 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa11.2□□□□□ -0.62
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