RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489639.1

MFSD1-217, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene MFSD1, Length 447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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MFSD1-217ENST00000489639 GTF3C6Q969F1 213 aa7.42□□□□□ -1.22
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MFSD1-217ENST00000489639 GBP4Q96PP9 640 aa7.42□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
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