RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489495.5

FUBP1-211, Transcript of far upstream element binding protein 1, human

TSL 2

Gene FUBP1, Length 2,156 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FUBP1-211	ENST00000489495	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	IQGAP2	Q13576	1575 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	NR1I2	O75469	434 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	KIAA0754	O94854	1291 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	ARHGAP25	P42331	645 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	FNTA	P49354	379 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	4.17	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	SLC8A3	P57103	927 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	CHMP4BP1	P59074	171 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	CASP8	Q14790	479 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	OCLN	Q16625	522 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	CEP85	Q6P2H3	762 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	RUFY3	Q7L099	469 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	OGFOD1	Q8N543	542 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	FOXJ1	Q92949	421 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	XAGE2	Q96GT9	111 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	USP32	Q8NFA0	1604 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	NSD2	O96028	1365 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	COQ9	O75208	318 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	DKK1	O94907	266 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	MYBL2	P10244	700 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	PRPH	P41219	470 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	CCT5	P48643	541 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	MMP16	P51512	607 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	GNG11	P61952	73 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	PLCB4	Q15147	1175 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	TCP11	Q8WWU5	503 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	ABCB6	Q9NP58	842 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	BATF3	Q9NR55	127 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	SEPT3	Q9UH03	358 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	MYO6	Q9UM54	1294 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	UNC13B	O14795	1591 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	TOPBP1	Q92547	1522 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	ARHGAP6	O43182	974 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	CBFA2T2	O43439	604 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	CUTA	O60888	179 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	MCM3	P25205	808 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	GCK	P35557	465 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	IRAK1	P51617	712 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	SMTN	P53814	917 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	RAB15	P59190	212 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	MTA1	Q13330	715 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	COL19A1	Q14993	1142 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	MSS51	Q4VC12	460 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	CCDC181	Q5TID7	509 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	ISM2	Q6H9L7	571 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FUBP1-211	ENST00000489495	BAP1	Q92560	729 aa		4.16	□□□□□ -1.74

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