RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 UPK3BL1B0FP48 263 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 UPK3BL2E5RIL1 263 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 NKAPLQ5M9Q1 402 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM201Q5SNT2 666 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 PRR23CQ6ZRP0 262 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 HID1Q8IV36 788 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 KCT2Q8NC54 265 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM13CQ8NE31 585 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 GMLQ99445 158 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP5.18□□□□□ -1.585e-30■□□□□ 9.5
RABGGTB-211ENST00000489450 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 TANGO6Q9C0B7 1094 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 ADAM30Q9UKF2 790 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 RAXQ9Y2V3 346 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 CDK5R2Q13319 367 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 MAP7Q14244 749 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 OVOS1Q6IE37 1185 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 PAOXQ6QHF9 649 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 ARMCX6Q7L4S7 300 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 CLEC10AQ8IUN9 316 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 XAGE3Q8WTP9 111 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 CPLX3Q8WVH0 158 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM87BQ96K49 555 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM83CQ9BQN1 747 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 C7orf69Q9H7B7 122 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 MRVI1Q9Y6F6 885 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC22A31A6NKX4 558 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 CST3P01034 146 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 EIF6P56537 245 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 MLECQ14165 292 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC6A19Q695T7 634 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 ANAPC16Q96DE5 110 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 SHDQ96IW2 340 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 FOXQ1Q9C009 403 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 C1GALT1Q9NS00 363 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 GMIPQ9P107 970 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 STOML1Q9UBI4 398 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 STRIP2Q9ULQ0 834 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-211ENST00000489450 MEIS3P2A8K0S8 358 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 LRIG2O94898 1065 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 IMPDH2P12268 514 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 ADMP35318 185 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 CAP2P40123 477 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 GIPRP48546 466 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 ARSHQ5FYA8 562 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 RUFY4Q6ZNE9 571 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 SHISA5Q8N114 240 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 TOP6BLQ8N6T0 577 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM40Q8WWA1 233 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 ATG4CQ96DT6 458 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 CRBNQ96SW2 442 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 DYRK3O43781 588 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 LEFTY1O75610 366 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 ATP2B1P20020 1258 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 ETFBP38117 255 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 YARSP54577 528 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 NLRC3Q7RTR2 1065 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 PHACTR4Q8IZ21 702 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM169BQ8N8A8 192 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 GATA6Q92908 595 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 MFSD14AQ96MC6 490 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 TBC1D32Q96NH3 1257 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 MIPEPQ99797 713 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 CNNM2Q9H8M5 875 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF408Q9H9D4 720 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM86C2PA6NEL3 165 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 SLITRK5O94991 958 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 H2AFB1P0C5Y9 115 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 H2AFB2P0C5Z0 115 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM87AP0C7U9 286 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 NME1P15531 152 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 RAG1P15918 1043 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 CDCP2Q5VXM1 449 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 RNF43Q68DV7 783 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 ZAR1Q86SH2 424 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 SLFN12Q8IYM2 578 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 FBXL6Q8N531 539 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 MFSD2AQ8NA29 543 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 RIN3Q8TB24 985 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 KIF2CQ99661 725 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-211ENST00000489450 PRDM10Q9NQV6 1147 aa5.13□□□□□ -1.59
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