RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484908.1

ATP6AP1-208, Transcript of ATPase H+ transporting accessory protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene ATP6AP1, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1-208ENST00000484908 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
ATP6AP1-208ENST00000484908 MIGA1Q8NAN2 632 aa21.84■■□□□ 1.09
ATP6AP1-208ENST00000484908 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
ATP6AP1-208ENST00000484908 ANTXR1Q9H6X2 564 aa21.84■■□□□ 1.09
ATP6AP1-208ENST00000484908 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa21.84■■□□□ 1.09
ATP6AP1-208ENST00000484908 DDX19BQ9UMR2 479 aa21.84■■□□□ 1.09
ATP6AP1-208ENST00000484908 C19orf81C9J6K1 198 aa21.83■■□□□ 1.09
ATP6AP1-208ENST00000484908 GDF11O95390 407 aa21.83■■□□□ 1.09
ATP6AP1-208ENST00000484908 USP5P45974 858 aa21.83■■□□□ 1.09
ATP6AP1-208ENST00000484908 JAG1P78504 1218 aa21.83■■□□□ 1.09
ATP6AP1-208ENST00000484908 MTMR2Q13614 643 aa21.83■■□□□ 1.09
ATP6AP1-208ENST00000484908 TMOD4Q9NZQ9 345 aa21.83■■□□□ 1.09
ATP6AP1-208ENST00000484908 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa21.83■■□□□ 1.09
ATP6AP1-208ENST00000484908 HMMRO75330 724 aa21.82■■□□□ 1.08
ATP6AP1-208ENST00000484908 KIF1BPQ96EK5 621 aa21.82■■□□□ 1.08
ATP6AP1-208ENST00000484908 USP17L10C9JJH3 530 aa21.81■■□□□ 1.08
ATP6AP1-208ENST00000484908 ELNP15502 786 aa21.81■■□□□ 1.08
ATP6AP1-208ENST00000484908 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
ATP6AP1-208ENST00000484908 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
ATP6AP1-208ENST00000484908 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
ATP6AP1-208ENST00000484908 UNC93B1Q9H1C4 597 aa21.81■■□□□ 1.08
ATP6AP1-208ENST00000484908 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa21.81■■□□□ 1.08
ATP6AP1-208ENST00000484908 COG6Q9Y2V7 657 aa21.81■■□□□ 1.08
ATP6AP1-208ENST00000484908 INHAP05111 366 aa21.8■■□□□ 1.08
ATP6AP1-208ENST00000484908 CAPN2P17655 700 aa21.8■■□□□ 1.08
ATP6AP1-208ENST00000484908 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
ATP6AP1-208ENST00000484908 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
ATP6AP1-208ENST00000484908 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
ATP6AP1-208ENST00000484908 TATDN1Q6P1N9 297 aa21.8■■□□□ 1.08
ATP6AP1-208ENST00000484908 TTC6Q86TZ1 520 aa21.8■■□□□ 1.08
ATP6AP1-208ENST00000484908 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
ATP6AP1-208ENST00000484908 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP21.8■■□□□ 1.08
ATP6AP1-208ENST00000484908 EHD4Q9H223 541 aa21.8■■□□□ 1.08
ATP6AP1-208ENST00000484908 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
ATP6AP1-208ENST00000484908 MORF4L1Q9UBU8 362 aa21.8■■□□□ 1.08
ATP6AP1-208ENST00000484908 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
ATP6AP1-208ENST00000484908 PCDH10Q9P2E7 1040 aa21.79■■□□□ 1.08
ATP6AP1-208ENST00000484908 SERPINB13Q9UIV8 391 aa21.79■■□□□ 1.08
ATP6AP1-208ENST00000484908 TAOK2Q9UL54 1235 aa21.79■■□□□ 1.08
ATP6AP1-208ENST00000484908 SGPL1O95470 568 aa21.78■■□□□ 1.08
ATP6AP1-208ENST00000484908 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa21.78■■□□□ 1.08
ATP6AP1-208ENST00000484908 SIRT2Q8IXJ6 389 aa21.78■■□□□ 1.08
ATP6AP1-208ENST00000484908 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
ATP6AP1-208ENST00000484908 NAV1Q8NEY1 1877 aa21.77■■□□□ 1.08
ATP6AP1-208ENST00000484908 APBB1O00213 710 aa21.77■■□□□ 1.08
ATP6AP1-208ENST00000484908 RAB11FIP3O75154 756 aa21.77■■□□□ 1.08
ATP6AP1-208ENST00000484908 GH2P01242 217 aa21.77■■□□□ 1.08
ATP6AP1-208ENST00000484908 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
ATP6AP1-208ENST00000484908 USP17L2Q6R6M4 530 aa21.77■■□□□ 1.08
ATP6AP1-208ENST00000484908 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
ATP6AP1-208ENST00000484908 PLXNB2O15031 1838 aa21.76■■□□□ 1.07
ATP6AP1-208ENST00000484908 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa21.76■■□□□ 1.07
ATP6AP1-208ENST00000484908 PDE6AP16499 860 aa21.76■■□□□ 1.07
ATP6AP1-208ENST00000484908 HERVK_113P62684 666 aa21.76■■□□□ 1.07
ATP6AP1-208ENST00000484908 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa21.76■■□□□ 1.07
ATP6AP1-208ENST00000484908 HTATIP2Q9BUP3 242 aa21.76■■□□□ 1.07
ATP6AP1-208ENST00000484908 RCAN3Q9UKA8 241 aa21.76■■□□□ 1.07
ATP6AP1-208ENST00000484908 GJD2Q9UKL4 321 aa21.76■■□□□ 1.07
ATP6AP1-208ENST00000484908 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
ATP6AP1-208ENST00000484908 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
ATP6AP1-208ENST00000484908 DPF3Q92784 378 aa21.75■■□□□ 1.07
ATP6AP1-208ENST00000484908 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
ATP6AP1-208ENST00000484908 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
ATP6AP1-208ENST00000484908 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
ATP6AP1-208ENST00000484908 EMILIN3Q9NT22 766 aa21.75■■□□□ 1.07
ATP6AP1-208ENST00000484908 GOLIM4O00461 696 aa21.74■■□□□ 1.07
ATP6AP1-208ENST00000484908 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
ATP6AP1-208ENST00000484908 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa21.74■■□□□ 1.07
ATP6AP1-208ENST00000484908 C12orf42Q96LP6 360 aa21.74■■□□□ 1.07
ATP6AP1-208ENST00000484908 DEFB118Q96PH6 123 aa21.74■■□□□ 1.07
ATP6AP1-208ENST00000484908 H0YGN5 161 aa21.73■■□□□ 1.07
ATP6AP1-208ENST00000484908 TFRCP02786 760 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
ATP6AP1-208ENST00000484908 HMGCRP04035 888 aa21.73■■□□□ 1.07
ATP6AP1-208ENST00000484908 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
ATP6AP1-208ENST00000484908 PLCD1P51178 756 aa21.73■■□□□ 1.07
ATP6AP1-208ENST00000484908 USP14P54578 494 aa21.73■■□□□ 1.07
ATP6AP1-208ENST00000484908 ABCB5Q2M3G0 1257 aa21.73■■□□□ 1.07
ATP6AP1-208ENST00000484908 TXNRD2Q9NNW7 524 aa21.73■■□□□ 1.07
ATP6AP1-208ENST00000484908 CABP5Q9NP86 173 aa21.73■■□□□ 1.07
ATP6AP1-208ENST00000484908 RBPJLQ9UBG7 517 aa21.73■■□□□ 1.07
ATP6AP1-208ENST00000484908 ZNF532Q9HCE3 1301 aa21.73■■□□□ 1.07
ATP6AP1-208ENST00000484908 SHMT1P34896 483 aa21.72■■□□□ 1.07
ATP6AP1-208ENST00000484908 RAB3GAP1Q15042 981 aa21.72■■□□□ 1.07
ATP6AP1-208ENST00000484908 FEZ1Q99689 392 aa21.72■■□□□ 1.07
ATP6AP1-208ENST00000484908 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
ATP6AP1-208ENST00000484908 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa21.71■■□□□ 1.07
ATP6AP1-208ENST00000484908 MAPK4P31152 587 aa21.71■■□□□ 1.07
ATP6AP1-208ENST00000484908 ERVK-9P63128 1117 aa21.71■■□□□ 1.07
ATP6AP1-208ENST00000484908 ERVK-24P63145 666 aa21.71■■□□□ 1.07
ATP6AP1-208ENST00000484908 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa21.71■■□□□ 1.07
ATP6AP1-208ENST00000484908 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP21.71■■□□□ 1.07
ATP6AP1-208ENST00000484908 BCL11AQ9H165 835 aa21.71■■□□□ 1.07
ATP6AP1-208ENST00000484908 MCM9Q9NXL9 1143 aa21.71■■□□□ 1.07
ATP6AP1-208ENST00000484908 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa21.7■■□□□ 1.07
ATP6AP1-208ENST00000484908 USP17L15C9J2P7 530 aa21.7■■□□□ 1.06
ATP6AP1-208ENST00000484908 USP17L13C9JLJ4 530 aa21.7■■□□□ 1.06
ATP6AP1-208ENST00000484908 USP17L11C9JVI0 530 aa21.7■■□□□ 1.06
ATP6AP1-208ENST00000484908 USP17L18D6R9N7 530 aa21.7■■□□□ 1.06
ATP6AP1-208ENST00000484908 USP17L22D6RA61 530 aa21.7■■□□□ 1.06
ATP6AP1-208ENST00000484908 USP17L17D6RBQ6 530 aa21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms