RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481204.5

SKAP2-204, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SKAP2, Length 513 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2-204ENST00000481204 UNC93B1Q9H1C4 597 aa7.28□□□□□ -1.24
SKAP2-204ENST00000481204 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SKAP2-204ENST00000481204 RAI14Q9P0K7 980 aa7.28□□□□□ -1.24
SKAP2-204ENST00000481204 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa7.28□□□□□ -1.24
SKAP2-204ENST00000481204 LRP2BPQ9P2M1 347 aa7.28□□□□□ -1.24
SKAP2-204ENST00000481204 ABCF2Q9UG63 623 aa7.28□□□□□ -1.24
SKAP2-204ENST00000481204 CHD4Q14839 1912 aa7.28□□□□□ -1.24
SKAP2-204ENST00000481204 LRRC37AA6NMS7 1700 aa7.27□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 LTBP1Q14766 1721 aa7.27□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 E7EWF7 191 aa7.27□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 UFL1O94874 794 aa7.27□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 FGAP02671 866 aa7.27□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 APPP05067 770 aa7.27□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 CYP7A1P22680 504 aa7.27□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 PSMA5P28066 241 aa7.27□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 MAP3K12Q12852 859 aa7.27□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 RAB3GAP1Q15042 981 aa7.27□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 SLC15A2Q16348 729 aa7.27□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 GRIK5Q16478 980 aa7.27□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 ME3Q16798 604 aa7.27□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 LINC01559Q495D7 138 aa7.27□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 CAVIN4Q5BKX8 364 aa7.27□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa7.27□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 CHST3Q7LGC8 479 aa7.27□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 TICAM2Q86XR7 235 aa7.27□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 CCDC83Q8IWF9 413 aa7.27□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 LCORLQ8N3X6 602 aa7.27□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF384Q8TF68 577 aa7.27□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 LRRN4Q8WUT4 740 aa7.27□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 NEK1Q96PY6 1258 aa7.27□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 INCENPQ9NQS7 918 aa7.27□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 STK32BQ9NY57 414 aa7.27□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 DENND2AQ9ULE3 1009 aa7.27□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 TPCN1Q9ULQ1 816 aa7.27□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa7.27□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 ZDHHC9Q9Y397 364 aa7.27□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 TACC3Q9Y6A5 838 aa7.27□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 PARP3Q9Y6F1 533 aa7.27□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa7.27□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 QSER1Q2KHR3 1735 aa7.27□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 XDHP47989 1333 aa7.27□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 SMIM22K7EJ46 135 aa7.26□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 LCE2BO14633 110 aa7.26□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 CTHP32929 405 aa7.26□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 RFC5P40937 340 aa7.26□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 MCM2P49736 904 aa7.26□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 STK3Q13188 491 aa7.26□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 KRT32Q14532 448 aa7.26□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 TMCO4Q5TGY1 634 aa7.26□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 Q6ZUG5 572 aa7.26□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 TBC1D10CQ8IV04 446 aa7.26□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 FLAD1Q8NFF5 587 aa7.26□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 AIDAQ96BJ3 306 aa7.26□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 CRAMP1Q96RY5 1269 aa7.26□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 BRIP1Q9BX63 1249 aa7.26□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 POLLQ9UGP5 575 aa7.26□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 SLX4Q8IY92 1834 aa7.26□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 MAST2Q6P0Q8 1798 aa7.25□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 GSG1L2A8MUP6 293 aa7.25□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 BBOX1O75936 387 aa7.25□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 SRGNP10124 158 aa7.25□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 PRDX5P30044 214 aa7.25□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 CHRNA5P30532 468 aa7.25□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 MCM4P33991 863 aa7.25□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 PRR20EP86478 221 aa7.25□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 PRR20CP86479 221 aa7.25□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 PRR20DP86480 221 aa7.25□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 PRR20BP86481 221 aa7.25□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 PRR20AP86496 221 aa7.25□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 MECOMQ03112 1051 aa7.25□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 PDE4CQ08493 712 aa7.25□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 APOBRQ0VD83 1088 aa7.25□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 C2CD5Q86YS7 1000 aa7.25□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 STK11IPQ8N1F8 1099 aa7.25□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 RETREG2Q8NC44 543 aa7.25□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 BANK1Q8NDB2 785 aa7.25□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 TBC1D16Q8TBP0 767 aa7.25□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 BAP1Q92560 729 aa7.25□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 BRF1Q92994 677 aa7.25□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 CTNNA3Q9UI47 895 aa7.25□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 GGA1Q9UJY5 639 aa7.25□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 LEMD3Q9Y2U8 911 aa7.25□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 MYH2Q9UKX2 1941 aa7.25□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 DUOX1Q9NRD9 1551 aa7.25□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa7.24□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa7.24□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SKAP2-204ENST00000481204 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms