RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481047.1

MDK-208, Transcript of midkine, human

TSL 2

Gene MDK, Length 775 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Exosome, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDK-208	ENST00000481047	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		27.86	■■■□□ 2.05
MDK-208	ENST00000481047	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		27.86	■■■□□ 2.05
MDK-208	ENST00000481047	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		27.86	■■■□□ 2.05
MDK-208	ENST00000481047	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		27.86	■■■□□ 2.05
MDK-208	ENST00000481047	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		27.86	■■■□□ 2.05
MDK-208	ENST00000481047	MYH7	P12883	1935 aa		27.85	■■■□□ 2.05
MDK-208	ENST00000481047	ERC2	O15083	957 aa		27.85	■■■□□ 2.05
MDK-208	ENST00000481047	MTMR2	Q13614	643 aa		27.85	■■■□□ 2.05
MDK-208	ENST00000481047	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		27.85	■■■□□ 2.05
MDK-208	ENST00000481047	TREML2	Q5T2D2	321 aa		27.85	■■■□□ 2.05
MDK-208	ENST00000481047	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		27.85	■■■□□ 2.05
MDK-208	ENST00000481047	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		27.85	■■■□□ 2.05
MDK-208	ENST00000481047	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		27.85	■■■□□ 2.05
MDK-208	ENST00000481047	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
MDK-208	ENST00000481047	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
MDK-208	ENST00000481047	GH2	P01242	217 aa		27.84	■■■□□ 2.05
MDK-208	ENST00000481047	BCR	P11274	1271 aa		27.84	■■■□□ 2.05
MDK-208	ENST00000481047	HOXD10	P28358	340 aa		27.84	■■■□□ 2.05
MDK-208	ENST00000481047	PSMC4	P43686	418 aa		27.84	■■■□□ 2.05
MDK-208	ENST00000481047	PRMT2	P55345	433 aa		27.84	■■■□□ 2.05
MDK-208	ENST00000481047	BACE1	P56817	501 aa		27.84	■■■□□ 2.05
MDK-208	ENST00000481047	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
MDK-208	ENST00000481047	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		27.84	■■■□□ 2.05
MDK-208	ENST00000481047	C19orf81	C9J6K1	198 aa		27.83	■■■□□ 2.05
MDK-208	ENST00000481047	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
MDK-208	ENST00000481047	OSBP	P22059	807 aa		27.83	■■■□□ 2.05
MDK-208	ENST00000481047	PLCD1	P51178	756 aa		27.83	■■■□□ 2.05
MDK-208	ENST00000481047	JAG1	P78504	1218 aa		27.83	■■■□□ 2.05
MDK-208	ENST00000481047	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		27.83	■■■□□ 2.05
MDK-208	ENST00000481047	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		27.83	■■■□□ 2.05
MDK-208	ENST00000481047	CABP5	Q9NP86	173 aa		27.83	■■■□□ 2.05
MDK-208	ENST00000481047	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		27.83	■■■□□ 2.05
MDK-208	ENST00000481047	USP17L10	C9JJH3	530 aa		27.82	■■■□□ 2.04
MDK-208	ENST00000481047	FCGRT	P55899	365 aa		27.82	■■■□□ 2.04
MDK-208	ENST00000481047	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		27.82	■■■□□ 2.04
MDK-208	ENST00000481047	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
MDK-208	ENST00000481047	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
MDK-208	ENST00000481047	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		27.82	■■■□□ 2.04
MDK-208	ENST00000481047	GCC1	Q96CN9	775 aa		27.82	■■■□□ 2.04
MDK-208	ENST00000481047	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
MDK-208	ENST00000481047	NBPF11	Q86T75	865 aa		27.81	■■■□□ 2.04
MDK-208	ENST00000481047	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		27.81	■■■□□ 2.04
MDK-208	ENST00000481047	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
MDK-208	ENST00000481047	SHMT1	P34896	483 aa		27.8	■■■□□ 2.04
MDK-208	ENST00000481047	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		27.8	■■■□□ 2.04
MDK-208	ENST00000481047	ARMC5	Q96C12	935 aa		27.8	■■■□□ 2.04
MDK-208	ENST00000481047	TRIM47	Q96LD4	638 aa		27.8	■■■□□ 2.04
MDK-208	ENST00000481047	FEZ1	Q99689	392 aa		27.8	■■■□□ 2.04
MDK-208	ENST00000481047	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		27.8	■■■□□ 2.04
MDK-208	ENST00000481047	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		27.8	■■■□□ 2.04
MDK-208	ENST00000481047	PRKAB2	O43741	272 aa		27.79	■■■□□ 2.04
MDK-208	ENST00000481047	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
MDK-208	ENST00000481047	MX1	P20591	662 aa		27.79	■■■□□ 2.04
MDK-208	ENST00000481047	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
MDK-208	ENST00000481047	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		27.79	■■■□□ 2.04
MDK-208	ENST00000481047	SRRD	Q9UH36	339 aa		27.79	■■■□□ 2.04
MDK-208	ENST00000481047	SWAP70	Q9UH65	585 aa		27.79	■■■□□ 2.04
MDK-208	ENST00000481047	CHGB	P05060	677 aa		27.78	■■■□□ 2.04
MDK-208	ENST00000481047	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
MDK-208	ENST00000481047	GABPA	Q06546	454 aa		27.78	■■■□□ 2.04
MDK-208	ENST00000481047	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		27.78	■■■□□ 2.04
MDK-208	ENST00000481047	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
MDK-208	ENST00000481047	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
MDK-208	ENST00000481047	MYPN	Q86TC9	1320 aa		27.77	■■■□□ 2.04
MDK-208	ENST00000481047	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
MDK-208	ENST00000481047	CTGF	P29279	349 aa		27.77	■■■□□ 2.04
MDK-208	ENST00000481047	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		27.77	■■■□□ 2.04
MDK-208	ENST00000481047	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		27.77	■■■□□ 2.04
MDK-208	ENST00000481047	RAET1E	Q8TD07	263 aa		27.77	■■■□□ 2.04
MDK-208	ENST00000481047	APPBP2	Q92624	585 aa		27.77	■■■□□ 2.04
MDK-208	ENST00000481047	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
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MDK-208	ENST00000481047	USP14	P54578	494 aa		27.76	■■■□□ 2.03
MDK-208	ENST00000481047	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		27.76	■■■□□ 2.03
MDK-208	ENST00000481047	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
MDK-208	ENST00000481047	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
MDK-208	ENST00000481047	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
MDK-208	ENST00000481047	ZNF333	Q96JL9	665 aa		27.74	■■■□□ 2.03
MDK-208	ENST00000481047	FSD1	Q9BTV5	496 aa		27.74	■■■□□ 2.03
MDK-208	ENST00000481047	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		27.74	■■■□□ 2.03
MDK-208	ENST00000481047	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
MDK-208	ENST00000481047	USP17L12	C9JPN9	530 aa		27.73	■■■□□ 2.03
MDK-208	ENST00000481047	USP17L21	D6R901	530 aa		27.73	■■■□□ 2.03
MDK-208	ENST00000481047	EVX2	Q03828	476 aa		27.73	■■■□□ 2.03
MDK-208	ENST00000481047	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
MDK-208	ENST00000481047	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
MDK-208	ENST00000481047	PRKCZ	Q05513	592 aa		27.72	■■■□□ 2.03
MDK-208	ENST00000481047	C12orf60	Q5U649	245 aa		27.72	■■■□□ 2.03
MDK-208	ENST00000481047	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		27.72	■■■□□ 2.03
MDK-208	ENST00000481047	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		27.72	■■■□□ 2.03
MDK-208	ENST00000481047	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		27.72	■■■□□ 2.03
MDK-208	ENST00000481047	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		27.72	■■■□□ 2.03
MDK-208	ENST00000481047	C12orf42	Q96LP6	360 aa		27.72	■■■□□ 2.03
MDK-208	ENST00000481047	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
MDK-208	ENST00000481047	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		27.72	■■■□□ 2.03
MDK-208	ENST00000481047	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		27.72	■■■□□ 2.03
MDK-208	ENST00000481047	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
MDK-208	ENST00000481047	MGAM	O43451	1857 aa		27.71	■■■□□ 2.03
MDK-208	ENST00000481047	GNAT2	P19087	354 aa		27.71	■■■□□ 2.03
MDK-208	ENST00000481047	SEPT2	Q15019	361 aa		27.71	■■■□□ 2.03

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