RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480108.1

MMS19-216, Transcript of MMS19 homolog, cytosolic iron-sulfur assembly component, humanhuman

TSL 2

Gene MMS19, Length 677 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19-216ENST00000480108 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
MMS19-216ENST00000480108 TXNRD2Q9NNW7 524 aa14.68□□□□□ -0.06
MMS19-216ENST00000480108 MBIPQ9NS73 344 aa14.68□□□□□ -0.06
MMS19-216ENST00000480108 FLRT1Q9NZU1 646 aa14.68□□□□□ -0.06
MMS19-216ENST00000480108 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
MMS19-216ENST00000480108 SLURP2P0DP57 97 aa14.67□□□□□ -0.06
MMS19-216ENST00000480108 RGS3P49796 1198 aa14.67□□□□□ -0.06
MMS19-216ENST00000480108 HERVK_113P62684 666 aa14.67□□□□□ -0.06
MMS19-216ENST00000480108 FBXO33Q7Z6M2 555 aa14.67□□□□□ -0.06
MMS19-216ENST00000480108 SLC44A5Q8NCS7 719 aa14.67□□□□□ -0.06
MMS19-216ENST00000480108 CD320Q9NPF0 282 aa14.67□□□□□ -0.06
MMS19-216ENST00000480108 TMOD4Q9NZQ9 345 aa14.67□□□□□ -0.06
MMS19-216ENST00000480108 DOCK1Q14185 1865 aa14.67□□□□□ -0.06
MMS19-216ENST00000480108 APBB1O00213 710 aa14.66□□□□□ -0.06
MMS19-216ENST00000480108 ERVK-9P63128 1117 aa14.66□□□□□ -0.06
MMS19-216ENST00000480108 ERVK-24P63145 666 aa14.66□□□□□ -0.06
MMS19-216ENST00000480108 DIXDC1Q155Q3 683 aa14.66□□□□□ -0.06
MMS19-216ENST00000480108 Q3C1V9 767 aa14.66□□□□□ -0.06
MMS19-216ENST00000480108 C1orf53Q5VUE5 145 aa14.66□□□□□ -0.06
MMS19-216ENST00000480108 LMBR1LQ6UX01 489 aa14.66□□□□□ -0.06
MMS19-216ENST00000480108 WDFY4Q6ZS81 3184 aa14.66□□□□□ -0.06
MMS19-216ENST00000480108 DOCK2Q92608 1830 aa14.65□□□□□ -0.06
MMS19-216ENST00000480108 CASP7P55210 303 aa14.65□□□□□ -0.06
MMS19-216ENST00000480108 TRPV1Q8NER1 839 aa14.65□□□□□ -0.06
MMS19-216ENST00000480108 HLA-CQ95604 372 aa14.65□□□□□ -0.06
MMS19-216ENST00000480108 RBPJLQ9UBG7 517 aa14.65□□□□□ -0.06
MMS19-216ENST00000480108 CHD9Q3L8U1 2897 aa14.64□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 GBF1Q92538 1859 aa14.64□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 DCDC2CA8MYV0 355 aa14.64□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 ALADP13716 330 aa14.64□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 FOXO4P98177 505 aa14.64□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.071e-6■■■■□ 25.5
MMS19-216ENST00000480108 PPP2R2DQ66LE6 453 aa14.64□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 CCDC146Q8IYE0 955 aa14.64□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 STK31Q9BXU1 1019 aa14.64□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 AS3MTQ9HBK9 375 aa14.64□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 TRIM35Q9UPQ4 493 aa14.64□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa14.64□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 LOC285556D6RIA3 1793 aa14.64□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 ATRNL1Q5VV63 1379 aa14.63□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 USP17L5A8MUK1 530 aa14.63□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 ENTPD3O75355 529 aa14.63□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 PICALMQ13492 652 aa14.63□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 LRRC41Q15345 812 aa14.63□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 TMEM240Q5SV17 173 aa14.63□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 TBC1D2Q9BYX2 928 aa14.63□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 FAM196BA6NMK8 535 aa14.62□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 TIMP1P01033 207 aa14.62□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 ACRP10323 421 aa14.62□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 CCNA1P78396 465 aa14.62□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 MTMR2Q13614 643 aa14.62□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 USP34Q70CQ2 3546 aa14.62□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 ZNF365Q70YC5 407 aa14.62□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa14.62□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 GJD3Q8N144 294 aa14.62□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 WDR66Q8TBY9 1149 aa14.62□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa14.62□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 SLC15A5A6NIM6 579 aa14.61□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 CYBAP13498 195 aa14.61□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 MAP3K10Q02779 954 aa14.61□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 SH3D19Q5HYK7 790 aa14.61□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 MFSD5Q6N075 450 aa14.61□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 SEPT4O43236 478 aa14.6□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 PTPREP23469 700 aa14.6□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 FAAP100Q0VG06 881 aa14.6□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 C16orf59Q7L2K0 433 aa14.6□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 DPP9Q86TI2 863 aa14.6□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 TMEM199Q8N511 208 aa14.6□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 C8orf58Q8NAV2 365 aa14.6□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 MTCH2Q9Y6C9 303 aa14.6□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 MROH5Q6ZUA9 1318 aa14.6□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 CFAP54Q96N23 3096 aa14.6□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 RFXAPO00287 272 aa14.59□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 LDHBP07195 334 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 CSF2RAP15509 400 aa14.59□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 RABGGTBP53611 331 aa14.59□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 METTL24Q5JXM2 366 aa14.59□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 RASIP1Q5U651 963 aa14.59□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 LINS1Q8NG48 757 aa14.59□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 NPLOC4Q8TAT6 608 aa14.59□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 IDI2Q9BXS1 227 aa14.59□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 PHF24Q9UPV7 400 aa14.59□□□□□ -0.07
MMS19-216ENST00000480108 BACE1P56817 501 aa14.58□□□□□ -0.08
MMS19-216ENST00000480108 FAM47AQ5JRC9 791 aa14.58□□□□□ -0.08
MMS19-216ENST00000480108 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
MMS19-216ENST00000480108 RNF180Q86T96 592 aa14.58□□□□□ -0.08
MMS19-216ENST00000480108 CERS4Q9HA82 394 aa14.58□□□□□ -0.08
MMS19-216ENST00000480108 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa14.58□□□□□ -0.08
MMS19-216ENST00000480108 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
MMS19-216ENST00000480108 GFRA3O60609 400 aa14.57□□□□□ -0.08
MMS19-216ENST00000480108 KRT37O76014 449 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms