RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 PRDM1O75626 825 aa23.67■■□□□ 1.38
ACTB-210ENST00000477812 C1QTNF8P60827 252 aa23.67■■□□□ 1.38
ACTB-210ENST00000477812 STOX1Q6ZVD7 989 aa23.67■■□□□ 1.38
ACTB-210ENST00000477812 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa23.67■■□□□ 1.38
ACTB-210ENST00000477812 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
ACTB-210ENST00000477812 CREBZFQ9NS37 354 aa23.67■■□□□ 1.38
ACTB-210ENST00000477812 PDE4BQ07343 736 aa23.66■■□□□ 1.38
ACTB-210ENST00000477812 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
ACTB-210ENST00000477812 SCYL3Q8IZE3 742 aa23.66■■□□□ 1.38
ACTB-210ENST00000477812 ATAD5Q96QE3 1844 aa23.66■■□□□ 1.38
ACTB-210ENST00000477812 PLIN4Q96Q06 1357 aa23.65■■□□□ 1.38
ACTB-210ENST00000477812 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
ACTB-210ENST00000477812 GDF11O95390 407 aa23.65■■□□□ 1.38
ACTB-210ENST00000477812 AKR1B1P15121 316 aa23.65■■□□□ 1.38
ACTB-210ENST00000477812 HUNKP57058 714 aa23.65■■□□□ 1.38
ACTB-210ENST00000477812 RASEFQ8IZ41 740 aa23.65■■□□□ 1.38
ACTB-210ENST00000477812 CCDC17Q96LX7 622 aa23.65■■□□□ 1.38
ACTB-210ENST00000477812 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP23.65■■□□□ 1.38
ACTB-210ENST00000477812 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
ACTB-210ENST00000477812 ZNF287Q9HBT7 754 aa23.65■■□□□ 1.38
ACTB-210ENST00000477812 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa23.65■■□□□ 1.38
ACTB-210ENST00000477812 GUCY1A2P33402 732 aa23.64■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 TSGA10IPQ3SY00 556 aa23.64■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 MFSD6Q6ZSS7 791 aa23.64■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 HHIPL1Q96JK4 782 aa23.64■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 MKNK2Q9HBH9 465 aa23.64■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 GINM1Q9NU53 330 aa23.64■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 CSADQ9Y600 493 aa23.64■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 E7EWF7 191 aa23.63■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 GH2P01242 217 aa23.63■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 ABCB5Q2M3G0 1257 aa23.63■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 RNF20Q5VTR2 975 aa23.63■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 BACH2Q9BYV9 841 aa23.63■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 ASNSP08243 561 aa23.62■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 PTPRAP18433 802 aa23.62■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 PHIPQ8WWQ0 1821 aa23.61■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa23.61■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 SPDYE5A6NIY4 337 aa23.61■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 RASSF10A6NK89 507 aa23.61■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 NT5C2P49902 561 aa23.61■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 TMEM179Q6ZVK1 233 aa23.61■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa23.61■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 CNNM2Q9H8M5 875 aa23.61■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 ELP3Q9H9T3 547 aa23.61■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 SNX14Q9Y5W7 946 aa23.61■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 B4E1Z4 1266 aa23.6■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 HSPA6P17066 643 aa23.6■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 FAM47AQ5JRC9 791 aa23.6■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 NEDD1Q8NHV4 660 aa23.6■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 PICK1Q9NRD5 415 aa23.6■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 GJA5P36382 358 aa23.59■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 TFAP4Q01664 338 aa23.59■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 SEPT2Q15019 361 aa23.59■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 RGMBQ6NW40 437 aa23.59■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 ERO1BQ86YB8 467 aa23.59■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 RASAL3Q86YV0 1011 aa23.59■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 IL17RAQ96F46 866 aa23.59■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 HTRA3P83110 453 aa23.58■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 ADCK5Q3MIX3 580 aa23.58■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 CLEC10AQ8IUN9 316 aa23.58■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 SIAH1Q8IUQ4 282 aa23.58■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 ESR2Q92731 530 aa23.58■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 SLC10A4Q96EP9 437 aa23.58■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 KRT23Q9C075 422 aa23.58■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 TOMM22Q9NS69 142 aa23.58■■□□□ 1.37
ACTB-210ENST00000477812 TSPY2A6NKD2 308 aa23.57■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 KDM4AO75164 1064 aa23.57■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 SLC10A3P09131 477 aa23.57■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 NOVP48745 357 aa23.57■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 NCOA7Q8NI08 942 aa23.57■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 OPTNQ96CV9 577 aa23.57■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 WNK4Q96J92 1243 aa23.57■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 CABP5Q9NP86 173 aa23.57■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 IL17RBQ9NRM6 502 aa23.57■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 ZSWIM5Q9P217 1185 aa23.57■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 USP17L5A8MUK1 530 aa23.56■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 TSPY3P0CV98 308 aa23.56■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 TSPY8P0CW00 308 aa23.56■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 PPATQ06203 517 aa23.56■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 KRT32Q14532 448 aa23.56■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 RAB3GAP1Q15042 981 aa23.56■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 CYB5R4Q7L1T6 521 aa23.56■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 OTUD5Q96G74 571 aa23.56■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 WDR18Q9BV38 432 aa23.56■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa23.56■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa23.56■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 NMT2O60551 498 aa23.55■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 MCCP23508 829 aa23.55■■□□□ 1.36
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