RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472398.5

TTC3-214, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 1 (best)

Gene TTC3, Length 2,305 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-214	ENST00000472398	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	TSPY2	A6NKD2	308 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	VSTM5	A8MXK1	200 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398		F8W031	263 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	KLF4	O43474	513 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	LGR5	O75473	907 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	TSPY3	P0CV98	308 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	TSPY8	P0CW00	308 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	KCNA6	P17658	529 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	MAGEA8	P43361	318 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	MAPK8	P45983	427 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	GTF2A2	P52657	109 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	TSPY1	Q01534	308 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	MZT2A	Q6P582	158 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	JMY	Q8N9B5	988 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	BHMT	Q93088	406 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	ASIC4	Q96FT7	647 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	GSDMA	Q96QA5	445 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	FANCF	Q9NPI8	374 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	DONSON	Q9NYP3	566 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	TRIM64B	A6NI03	449 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	APAF1	O14727	1248 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	IGHA2	P01877	340 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	SLC5A1	P13866	664 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	ALDH1B1	P30837	517 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	SEPHS1	P49903	392 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	NEK2	P51955	445 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	MLC1	Q15049	377 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	ABTB2	Q8N961	1025 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	ADAM32	Q8TC27	787 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	C17orf50	Q8WW18	174 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	BAP1	Q92560	729 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	KIFC2	Q96AC6	838 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	FAM81B	Q96LP2	452 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	CSRNP2	Q9H175	543 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	FNIP2	Q9P278	1114 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	CFAP45	Q9UL16	551 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	ESPN	B1AK53	854 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	CPLX1	O14810	134 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	GFPT2	O94808	682 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	CAP2	P40123	477 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	SH3BP2	P78314	561 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	GABRE	P78334	506 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	TRIM32	Q13049	653 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	TCIRG1	Q13488	830 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	MTMR1	Q13613	665 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	RAB33A	Q14088	237 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	GALE	Q14376	348 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	INF2	Q27J81	1249 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	NACC2	Q96BF6	587 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	TRIM11	Q96F44	468 aa		3.76	□□□□□ -1.81

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