RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471643.1

RALGPS1-211, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 3

Gene RALGPS1, Length 681 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-211ENST00000471643 MECOMQ03112 1051 aa18.05■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 PDE3AQ14432 1141 aa18.05■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 USP38Q8NB14 1042 aa18.05■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 APBA2Q99767 749 aa18.05■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 SIL1Q9H173 461 aa18.05■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 ABCF2Q9UG63 623 aa18.05■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 TNFRSF10AO00220 468 aa18.04■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 PLEKHH3Q7Z736 793 aa18.04■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 SLF2Q8IX21 1173 aa18.04■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 LPAR1Q92633 364 aa18.04■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 DNM1LO00429 736 aa18.03■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 CIAO1O76071 339 aa18.03■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 TJAP1Q5JTD0 557 aa18.03■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 BADQ92934 168 aa18.03■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 AS3MTQ9HBK9 375 aa18.03■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 CEP126Q9P2H0 1117 aa18.03■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa18.03■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 REV3LO60673 3130 aa18.02■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 IGHA2P01877 340 aa18.02■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 MAP2K5Q13163 448 aa18.02■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 TRPV1Q8NER1 839 aa18.02■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 TMOD4Q9NZQ9 345 aa18.02■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 FBXO3Q9UK99 471 aa18.02■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa18.02■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 CNMDO75829 334 aa18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 PAGR1Q9BTK6 254 aa18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 DNAJC18Q9H819 358 aa18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa18.01■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 SIPA1L1O43166 1804 aa18■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 TIMM10P62072 90 aa18■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa18■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa18■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 TRIM43BA6NCK2 446 aa17.99■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 C19orf81C9J6K1 198 aa17.99■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 CYP2C19P33261 490 aa17.99■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 GRIN2CQ14957 1233 aa17.99■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 SNX17Q15036 470 aa17.99■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 MFSD14CQ5VZR4 134 aa17.99■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 PDLIM7Q9NR12 457 aa17.99■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 EMILIN3Q9NT22 766 aa17.99■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 RLFQ13129 1914 aa17.99■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 USP17L10C9JJH3 530 aa17.98■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 MSCO60682 206 aa17.98■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 ASNSP08243 561 aa17.98■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 HOXC6P09630 235 aa17.98■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 PTPREP23469 700 aa17.98■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 ITGB8P26012 769 aa17.98■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 CNGA1P29973 690 aa17.98■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 PLA2G5P39877 138 aa17.98■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 IL15P40933 162 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 EPHB4P54760 987 aa17.98■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 ERICH6Q7L0X2 663 aa17.98■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 NPLOC4Q8TAT6 608 aa17.98■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 TMEM265A0A087WTH1 108 aa17.97■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 TRIM60Q495X7 471 aa17.97■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 PI4KBQ9UBF8 816 aa17.97■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 PTPRCP08575 1304 aa17.97■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 CHD7Q9P2D1 2997 aa17.96■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 CYBAP13498 195 aa17.96■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 PI16Q6UXB8 463 aa17.96■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa17.96■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 HMG20BQ9P0W2 317 aa17.96■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa17.96■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
RALGPS1-211ENST00000471643 SLC15A5A6NIM6 579 aa17.95■□□□□ 0.46
RALGPS1-211ENST00000471643 GDF11O95390 407 aa17.95■□□□□ 0.46
RALGPS1-211ENST00000471643 ATP2B2Q01814 1243 aa17.95■□□□□ 0.46
RALGPS1-211ENST00000471643 GRB14Q14449 540 aa17.95■□□□□ 0.46
RALGPS1-211ENST00000471643 TEX11Q8IYF3 940 aa17.95■□□□□ 0.46
RALGPS1-211ENST00000471643 XAGE2Q96GT9 111 aa17.95■□□□□ 0.46
RALGPS1-211ENST00000471643 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa17.95■□□□□ 0.46
RALGPS1-211ENST00000471643 ANO1Q5XXA6 986 aa17.94■□□□□ 0.46
RALGPS1-211ENST00000471643 ARRDC4Q8NCT1 418 aa17.94■□□□□ 0.46
RALGPS1-211ENST00000471643 BTBD7Q9P203 1132 aa17.94■□□□□ 0.46
RALGPS1-211ENST00000471643 A0A1B0GUL7 405 aa17.93■□□□□ 0.46
RALGPS1-211ENST00000471643 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
RALGPS1-211ENST00000471643 LDHCP07864 332 aa17.93■□□□□ 0.46
RALGPS1-211ENST00000471643 GSTO1P78417 241 aa17.93■□□□□ 0.46
RALGPS1-211ENST00000471643 C1orf53Q5VUE5 145 aa17.93■□□□□ 0.46
RALGPS1-211ENST00000471643 USP17L2Q6R6M4 530 aa17.93■□□□□ 0.46
RALGPS1-211ENST00000471643 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
RALGPS1-211ENST00000471643 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
RALGPS1-211ENST00000471643 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms