RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468600.1

SSB-208, Transcript of Sjogren syndrome antigen B, humanhuman

TSL 2

Gene SSB, Length 290 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSB-208ENST00000468600 RING1Q06587 406 aa6.79□□□□□ -1.32
SSB-208ENST00000468600 PI16Q6UXB8 463 aa6.79□□□□□ -1.32
SSB-208ENST00000468600 ABHD4Q8TB40 342 aa6.79□□□□□ -1.32
SSB-208ENST00000468600 ZNF507Q8TCN5 953 aa6.79□□□□□ -1.32
SSB-208ENST00000468600 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
SSB-208ENST00000468600 PARD6AQ9NPB6 346 aa6.79□□□□□ -1.32
SSB-208ENST00000468600 PCDHA4Q9UN74 947 aa6.79□□□□□ -1.32
SSB-208ENST00000468600 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SSB-208ENST00000468600 PRR33A8MZF0 331 aa6.78□□□□□ -1.32
SSB-208ENST00000468600 LINC00310P59036 64 aa6.78□□□□□ -1.32
SSB-208ENST00000468600 FGD1P98174 961 aa6.78□□□□□ -1.32
SSB-208ENST00000468600 LRRC14Q15048 493 aa6.78□□□□□ -1.32
SSB-208ENST00000468600 LLGL2Q6P1M3 1020 aa6.78□□□□□ -1.32
SSB-208ENST00000468600 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa6.78□□□□□ -1.32
SSB-208ENST00000468600 TMC7Q7Z402 723 aa6.78□□□□□ -1.32
SSB-208ENST00000468600 THAP5Q7Z6K1 395 aa6.78□□□□□ -1.32
SSB-208ENST00000468600 MIPEPQ99797 713 aa6.78□□□□□ -1.32
SSB-208ENST00000468600 CEP44Q9C0F1 390 aa6.78□□□□□ -1.32
SSB-208ENST00000468600 NUAK1O60285 661 aa6.77□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 SLITRK5O94991 958 aa6.77□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 GLDCP23378 1020 aa6.77□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 NXPE4Q6UWF7 544 aa6.77□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 TPTE2Q6XPS3 522 aa6.77□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 TTC6Q86TZ1 520 aa6.77□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa6.77□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 SLC26A8Q96RN1 970 aa6.77□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 SLAMF8Q9P0V8 285 aa6.77□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 DCTN4Q9UJW0 460 aa6.77□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 DSC3Q14574 896 aa6.76□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa6.76□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa6.75□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 BMP6P22004 513 aa6.75□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 GSTT1P30711 240 aa6.75□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 SCARA3Q6AZY7 606 aa6.75□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 GGNQ86UU5 652 aa6.75□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 MFSD2AQ8NA29 543 aa6.75□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 ST14Q9Y5Y6 855 aa6.75□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 ENC1O14682 589 aa6.74□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 TREHO43280 583 aa6.74□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 BRD1O95696 1058 aa6.74□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP6.74□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 C3orf58Q8NDZ4 430 aa6.74□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 MYLIPQ8WY64 445 aa6.74□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 KCNN1Q92952 543 aa6.74□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 UBE2FQ969M7 185 aa6.74□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 COX4I2Q96KJ9 171 aa6.74□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 ZSWIM5Q9P217 1185 aa6.74□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 TMEM59LQ9UK28 342 aa6.74□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 PPM1HQ9ULR3 514 aa6.74□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 CBX7O95931 251 aa6.73□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 CYP7A1P22680 504 aa6.73□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 NFKB2Q00653 900 aa6.73□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 PLCB3Q01970 1234 aa6.73□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 ARID3AQ99856 593 aa6.73□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa6.73□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa6.72□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 PAGE1O75459 146 aa6.72□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 SRFP11831 508 aa6.72□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 KIR3DL1P43629 444 aa6.72□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 ETF1P62495 437 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 LETMD1Q6P1Q0 360 aa6.72□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa6.72□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 HDXQ7Z353 690 aa6.72□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 ANKRD24Q8TF21 1146 aa6.72□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa6.72□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 FBRSQ9HAH7 460 aa6.72□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 CYP8B1Q9UNU6 501 aa6.72□□□□□ -1.33
SSB-208ENST00000468600 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa6.71□□□□□ -1.34
SSB-208ENST00000468600 FBXO24O75426 580 aa6.71□□□□□ -1.34
SSB-208ENST00000468600 SYN1P17600 705 aa6.71□□□□□ -1.34
SSB-208ENST00000468600 CAP2P40123 477 aa6.71□□□□□ -1.34
SSB-208ENST00000468600 HK2P52789 917 aa6.71□□□□□ -1.34
SSB-208ENST00000468600 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.34
SSB-208ENST00000468600 FBF1Q8TES7 1133 aa6.71□□□□□ -1.34
SSB-208ENST00000468600 KCNC2Q96PR1 638 aa6.71□□□□□ -1.34
SSB-208ENST00000468600 WNT10AQ9GZT5 417 aa6.71□□□□□ -1.34
SSB-208ENST00000468600 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa6.71□□□□□ -1.34
SSB-208ENST00000468600 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa6.71□□□□□ -1.34
SSB-208ENST00000468600 HPXP02790 462 aa6.7□□□□□ -1.34
SSB-208ENST00000468600 BMP7P18075 431 aa6.7□□□□□ -1.34
SSB-208ENST00000468600 RALGPS1Q5JS13 557 aa6.7□□□□□ -1.34
SSB-208ENST00000468600 LRFN4Q6PJG9 635 aa6.7□□□□□ -1.34
SSB-208ENST00000468600 HID1Q8IV36 788 aa6.7□□□□□ -1.34
SSB-208ENST00000468600 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SSB-208ENST00000468600 TNK2Q07912 1038 aa6.69□□□□□ -1.34
SSB-208ENST00000468600 INPP5AQ14642 412 aa6.69□□□□□ -1.34
SSB-208ENST00000468600 NKG7Q16617 165 aa6.69□□□□□ -1.34
SSB-208ENST00000468600 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SSB-208ENST00000468600 PCNX4Q63HM2 1172 aa6.69□□□□□ -1.34
SSB-208ENST00000468600 PLPPR2Q96GM1 343 aa6.69□□□□□ -1.34
SSB-208ENST00000468600 GIPC1O14908 333 aa6.68□□□□□ -1.34
SSB-208ENST00000468600 MAPK1P28482 360 aa6.68□□□□□ -1.34
SSB-208ENST00000468600 ERVFC1P60507 584 aa6.68□□□□□ -1.34
SSB-208ENST00000468600 NFIXQ14938 502 aa6.68□□□□□ -1.34
SSB-208ENST00000468600 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa6.68□□□□□ -1.34
SSB-208ENST00000468600 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
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