RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466222.6

CAPN3-209, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 2

Gene CAPN3, Length 1,934 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-209ENST00000466222 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 ROBO3Q96MS0 1386 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 PPFIA3O75145 1194 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 RXRAP19793 462 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 RASA1P20936 1047 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 CCT2P78371 535 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 TFAP4Q01664 338 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 GABPAQ06546 454 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 TTC6Q86TZ1 520 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 FBXL16Q8N461 479 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 MYL10Q9BUA6 226 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 TIAM2Q8IVF5 1701 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 TSPY2A6NKD2 308 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 NCLP19338 710 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 TRPM4Q8TD43 1214 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 DNAJC18Q9H819 358 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 GPRC5DQ9NZD1 345 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 CNTNAP1P78357 1384 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 TNKSO95271 1327 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 WDR19Q8NEZ3 1342 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 SCRN1Q12765 414 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 TMEM87BQ96K49 555 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 TMEM39BQ9GZU3 492 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 IL17RBQ9NRM6 502 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 SERPINB13Q9UIV8 391 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPN3-209ENST00000466222 PCP11498 1178 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 UBAC1Q9BSL1 405 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 SEC23AQ15436 765 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 TMOD2Q9NZR1 351 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 HPS5Q9UPZ3 1129 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 ENTPD3O75355 529 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 EVCP57679 992 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 NFXL1Q6ZNB6 911 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 GPT2Q8TD30 523 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 H7C1D1 291 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 MYO1BO43795 1136 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 NPM3O75607 178 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 HLA-DOAP06340 250 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 SHMT1P34896 483 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 HS1BP3Q53T59 392 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 GTF3C6Q969F1 213 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 CSRNP1Q96S65 589 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 PSME4Q14997 1843 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 GOLGA8BA8MQT2 603 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 WTAPQ15007 396 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 PI4KBQ9UBF8 816 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 PFKFB2O60825 505 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 TSPY3P0CV98 308 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 TSPY8P0CW00 308 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 LIFRP42702 1097 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 APOA5Q6Q788 366 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 IQCA1Q86XH1 822 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 FAM151AQ8WW52 585 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 HACL1Q9UJ83 578 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 LAMA4Q16363 1823 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 ERICH2A1L162 156 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 GRIN3BO60391 1043 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 JAK2O60674 1132 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 SART3Q15020 963 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 RCSD1Q6JBY9 416 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 LRSAM1Q6UWE0 723 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 SGMS1Q86VZ5 419 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 MICU3Q86XE3 530 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP21.72■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 AKR1B1P15121 316 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 RASA3Q14644 834 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 CLEC10AQ8IUN9 316 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 CHMP4CQ96CF2 233 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
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CAPN3-209ENST00000466222 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
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CAPN3-209ENST00000466222 SLC12A7Q9Y666 1083 aa21.71■■□□□ 1.07
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CAPN3-209ENST00000466222 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 MIGA2Q7L4E1 593 aa21.7■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF287Q9HBT7 754 aa21.7■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 PGAP2Q9UHJ9 254 aa21.7■■□□□ 1.07
CAPN3-209ENST00000466222 ATRNL1Q5VV63 1379 aa21.7■■□□□ 1.07
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