RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	TDO2	P48775	406 aa		21.26	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	21.26	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	21.26	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		21.26	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	PTPN18	Q99952	460 aa		21.26	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	USP17L5	A8MUK1	530 aa		21.25	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		21.25	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	21.25	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	CTR9	Q6PD62	1173 aa		21.25	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		21.25	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	FAM227B	Q96M60	508 aa		21.25	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		21.25	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		21.25	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		21.25	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	PTPRF	P10586	1907 aa		21.25	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	CXCL11	O14625	94 aa		21.24	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	GH2	P01242	217 aa		21.24	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	SPP2	Q13103	211 aa		21.24	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	21.24	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	21.24	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	TTC22	Q5TAA0	569 aa		21.24	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	C12orf60	Q5U649	245 aa		21.24	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		21.24	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		21.24	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		21.24	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		21.24	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	21.24	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		21.24	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	21.23	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	SDS	P20132	328 aa		21.23	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	SHMT1	P34896	483 aa		21.23	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	JAG1	P78504	1218 aa		21.23	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		21.23	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		21.23	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		21.23	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	TICAM2	Q86XR7	235 aa		21.23	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		21.23	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		21.23	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		21.23	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		21.23	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	21.23	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	CABP5	Q9NP86	173 aa		21.23	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		21.23	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	SWAP70	Q9UH65	585 aa		21.23	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902		A0A0D9SFI3	127 aa		21.22	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		21.22	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	BTBD19	C9JJ37	291 aa		21.22	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	GPR25	O00155	361 aa		21.22	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	GABPA	Q06546	454 aa		21.22	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		21.22	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	21.22	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	21.22	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		21.22	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		21.22	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	NAPB	Q9H115	298 aa		21.22	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	21.22	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	GINM1	Q9NU53	330 aa		21.22	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	SMIM22	K7EJ46	135 aa		21.21	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	21.21	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	21.2	■□□□□ 0.98
USP19-210	ENST00000465902	HIP1	O00291	1037 aa		21.2	■□□□□ 0.98
USP19-210	ENST00000465902	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	21.2	■□□□□ 0.98
USP19-210	ENST00000465902	CDK8	P49336	464 aa		21.2	■□□□□ 0.98
USP19-210	ENST00000465902	CRHR2	Q13324	411 aa		21.2	■□□□□ 0.98
USP19-210	ENST00000465902	SBK1	Q52WX2	424 aa		21.2	■□□□□ 0.98
USP19-210	ENST00000465902	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	21.2	■□□□□ 0.98
USP19-210	ENST00000465902	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	21.2	■□□□□ 0.98
USP19-210	ENST00000465902	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		21.2	■□□□□ 0.98
USP19-210	ENST00000465902	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		21.2	■□□□□ 0.98
USP19-210	ENST00000465902	PDHX	O00330	501 aa		21.19	■□□□□ 0.98
USP19-210	ENST00000465902	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		21.19	■□□□□ 0.98
USP19-210	ENST00000465902	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		21.19	■□□□□ 0.98
USP19-210	ENST00000465902	HMGCS2	P54868	508 aa		21.18	■□□□□ 0.98
USP19-210	ENST00000465902	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	21.18	■□□□□ 0.98
USP19-210	ENST00000465902	MTMR2	Q13614	643 aa		21.18	■□□□□ 0.98
USP19-210	ENST00000465902	VPS53	Q5VIR6	699 aa		21.18	■□□□□ 0.98
USP19-210	ENST00000465902	FEZ1	Q99689	392 aa		21.18	■□□□□ 0.98
USP19-210	ENST00000465902	WDR18	Q9BV38	432 aa		21.18	■□□□□ 0.98
USP19-210	ENST00000465902	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		21.18	■□□□□ 0.98
USP19-210	ENST00000465902	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		21.18	■□□□□ 0.98
USP19-210	ENST00000465902	MOGS	Q13724	837 aa		21.17	■□□□□ 0.98
USP19-210	ENST00000465902	SEPT2	Q15019	361 aa		21.17	■□□□□ 0.98
USP19-210	ENST00000465902	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	21.17	■□□□□ 0.98
USP19-210	ENST00000465902	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	21.17	■□□□□ 0.98
USP19-210	ENST00000465902	SKAP1	Q86WV1	359 aa		21.17	■□□□□ 0.98
USP19-210	ENST00000465902	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	21.17	■□□□□ 0.98
USP19-210	ENST00000465902	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		21.17	■□□□□ 0.98
USP19-210	ENST00000465902	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		21.17	■□□□□ 0.98
USP19-210	ENST00000465902	USP17L10	C9JJH3	530 aa		21.16	■□□□□ 0.98
USP19-210	ENST00000465902	FKTN	O75072	461 aa		21.16	■□□□□ 0.98
USP19-210	ENST00000465902	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	21.16	■□□□□ 0.98
USP19-210	ENST00000465902	RGS19	P49795	217 aa		21.16	■□□□□ 0.98
USP19-210	ENST00000465902	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		21.16	■□□□□ 0.98
USP19-210	ENST00000465902	CCDC17	Q96LX7	622 aa		21.16	■□□□□ 0.98
USP19-210	ENST00000465902	AKR1B1	P15121	316 aa		21.15	■□□□□ 0.98
USP19-210	ENST00000465902	BACE1	P56817	501 aa		21.15	■□□□□ 0.98
USP19-210	ENST00000465902	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	21.15	■□□□□ 0.98
USP19-210	ENST00000465902	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		21.15	■□□□□ 0.98
USP19-210	ENST00000465902	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		21.15	■□□□□ 0.98
USP19-210	ENST00000465902	C19orf81	C9J6K1	198 aa		21.14	■□□□□ 0.97

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