RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465846.6

HOXB-AS3-203, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 434 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-203ENST00000465846 EN2P19622 333 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-203ENST00000465846 USP5P45974 858 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FCGRTP55899 365 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PNMA3Q9UL41 463 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GDF11O95390 407 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MYCP01106 439 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-203ENST00000465846 JAG1P78504 1218 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RAET1EQ8TD07 263 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-203ENST00000465846 BCL11AQ9H165 835 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NAV1Q8NEY1 1877 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PRKCZQ05513 592 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SH3D19Q5HYK7 790 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-203ENST00000465846 WDR18Q9BV38 432 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GOLIM4O00461 696 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PDE6AP16499 860 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MTMR2Q13614 643 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GINM1Q9NU53 330 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GRK4P32298 578 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FAM110CQ1W6H9 321 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-203ENST00000465846 BACE1P56817 501 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-203ENST00000465846 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-203ENST00000465846 EHD4Q9H223 541 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GABRQQ9UN88 632 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ZNF532Q9HCE3 1301 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TMOD4Q9NZQ9 345 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MTFR1Q15390 333 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TATDN1Q6P1N9 297 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TTC6Q86TZ1 520 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-203ENST00000465846 BOLA2Q9H3K6 86 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PAG1Q9NWQ8 432 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-203ENST00000465846 USP17L10C9JJH3 530 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GH2P01242 217 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ATP5JP18859 108 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SLAIN1Q8ND83 568 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-203ENST00000465846 C19orf81C9J6K1 198 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FLT3LGP49771 235 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-203ENST00000465846 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-203ENST00000465846 HAUS7Q99871 368 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MYH7P12883 1935 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DOCK3Q8IZD9 2030 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-203ENST00000465846 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PLCD1P51178 756 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LCORLQ8N3X6 602 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-203ENST00000465846 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ADCY3O60266 1144 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-203ENST00000465846 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SHMT1P34896 483 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ADD2P35612 726 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-203ENST00000465846 UBXN2AP68543 259 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-203ENST00000465846 IRF5Q13568 498 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SDR42E1Q8WUS8 393 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-203ENST00000465846 COA7Q96BR5 231 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CCL5P13501 91 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SLFNL1Q499Z3 407 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-203ENST00000465846 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SHISA4Q96DD7 197 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ARMT1Q9H993 441 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-203ENST00000465846 EMILIN3Q9NT22 766 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MCM9Q9NXL9 1143 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MORF4L1Q9UBU8 362 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ELNP15502 786 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-203ENST00000465846 HERVK_113P62684 666 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-203ENST00000465846 EVX2Q03828 476 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GABPAQ06546 454 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ABCB5Q2M3G0 1257 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-203ENST00000465846 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FEZ1Q99689 392 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MBD4O95243 580 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PXYLP1Q8TE99 480 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-203ENST00000465846 C12orf42Q96LP6 360 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RNF208Q9H0X6 261 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-203ENST00000465846 INHAP05111 366 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GJB1P08034 283 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NKX2-3Q8TAU0 364 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DCTPP1Q9H773 170 aa22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms