RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 GJB4Q9NTQ9 266 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 POLR3EQ9NVU0 708 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 ABCF2Q9UG63 623 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 POLLQ9UGP5 575 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1W2PQ27 194 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1W2PQ64 194 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1W2PQD8 194 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 USP17L12C9JPN9 530 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 USP17L21D6R901 530 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 UBE2Q2LH0YL09 131 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 YEATS4O95619 227 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 NCLP19338 710 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 RHBDL3P58872 404 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 ST5P78524 1137 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 PTPAQ15257 358 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 C12orf60Q5U649 245 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 MYSM1Q5VVJ2 828 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF654Q8IZM8 581 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 NLGN1Q8N2Q7 840 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 TMTC2Q8N394 836 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 FAM184AQ8NB25 1140 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 LINC00301Q8NCQ3 95 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.355e-7■■□□□ 12.4
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PTPRC-210ENST00000462363 C8orf76Q96K31 380 aa6.59□□□□□ -1.35
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PTPRC-210ENST00000462363 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 MYH8P13535 1937 aa6.58□□□□□ -1.36
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PTPRC-210ENST00000462363 GOLGA8AA7E2F4 631 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 H3BQV1 296 aa6.58□□□□□ -1.36
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PTPRC-210ENST00000462363 KRT40Q6A162 431 aa6.58□□□□□ -1.36
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PTPRC-210ENST00000462363 FANCBQ8NB91 859 aa6.58□□□□□ -1.36
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PTPRC-210ENST00000462363 ESR2Q92731 530 aa6.58□□□□□ -1.36
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PTPRC-210ENST00000462363 PLIN4Q96Q06 1357 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 AP5Z1O43299 807 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 PPFIA3O75145 1194 aa6.57□□□□□ -1.36
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PTPRC-210ENST00000462363 UFL1O94874 794 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 LDHBP07195 334 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 NPR1P16066 1061 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 GUCY1A2P33402 732 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 IARSP41252 1262 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 SLC39A14Q15043 492 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 DIXDC1Q155Q3 683 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 RTN1Q16799 776 aa6.57□□□□□ -1.36
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