RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 HOOK2Q96ED9 719 aa8.49□□□□□ -1.05
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RABGEF1-206ENST00000461017 MCOLN1Q9GZU1 580 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-206ENST00000461017 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
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RABGEF1-206ENST00000461017 TAOK2Q9UL54 1235 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-206ENST00000461017 ZHX2Q9Y6X8 837 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-206ENST00000461017 M0R2C6 588 aa8.48□□□□□ -1.05
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RABGEF1-206ENST00000461017 CAP2P40123 477 aa8.48□□□□□ -1.05
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RABGEF1-206ENST00000461017 PDE1AP54750 535 aa8.48□□□□□ -1.05
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RABGEF1-206ENST00000461017 SLC44A5Q8NCS7 719 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-206ENST00000461017 GCC1Q96CN9 775 aa8.48□□□□□ -1.05
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RABGEF1-206ENST00000461017 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
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RABGEF1-206ENST00000461017 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
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RABGEF1-206ENST00000461017 FOXP2O15409 715 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-206ENST00000461017 MX1P20591 662 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-206ENST00000461017 CTGFP29279 349 aa8.47□□□□□ -1.05
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RABGEF1-206ENST00000461017 TATDN1Q6P1N9 297 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-206ENST00000461017 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
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RABGEF1-206ENST00000461017 CD99L2Q8TCZ2 262 aa8.47□□□□□ -1.05
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RABGEF1-206ENST00000461017 ADGRA2Q96PE1 1338 aa8.47□□□□□ -1.05
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RABGEF1-206ENST00000461017 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
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RABGEF1-206ENST00000461017 USP17L21D6R901 530 aa8.45□□□□□ -1.06
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RABGEF1-206ENST00000461017 MCM9Q9NXL9 1143 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-206ENST00000461017 CPA4Q9UI42 421 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-206ENST00000461017 SERPINB13Q9UIV8 391 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-206ENST00000461017 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-206ENST00000461017 TACC3Q9Y6A5 838 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-206ENST00000461017 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-206ENST00000461017 SMCHD1A6NHR9 2005 aa8.44□□□□□ -1.06
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