RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 HOXD10P28358 340 aa10.35□□□□□ -0.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 GJA8P48165 433 aa10.35□□□□□ -0.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 EVX2Q03828 476 aa10.35□□□□□ -0.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 IRF5Q13568 498 aa10.35□□□□□ -0.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa10.35□□□□□ -0.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 WDR18Q9BV38 432 aa10.35□□□□□ -0.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 UNC93B1Q9H1C4 597 aa10.35□□□□□ -0.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 ADCY3O60266 1144 aa10.34□□□□□ -0.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGSF3O75054 1194 aa10.34□□□□□ -0.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 GDF11O95390 407 aa10.34□□□□□ -0.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 BAG3O95817 575 aa10.34□□□□□ -0.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 PLCG2P16885 1265 aa10.34□□□□□ -0.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 CYP7A1P22680 504 aa10.34□□□□□ -0.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 MIGA1Q8NAN2 632 aa10.34□□□□□ -0.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLAIN1Q8ND83 568 aa10.34□□□□□ -0.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 PXYLP1Q8TE99 480 aa10.34□□□□□ -0.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 TBC1D2Q9BYX2 928 aa10.34□□□□□ -0.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa10.34□□□□□ -0.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 MORF4L1Q9UBU8 362 aa10.34□□□□□ -0.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 GJD2Q9UKL4 321 aa10.34□□□□□ -0.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa10.34□□□□□ -0.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 LAMA3Q16787 3333 aa10.33□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 LCTP09848 1927 aa10.33□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 IDH1O75874 414 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 INHAP05111 366 aa10.33□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 ASNSP08243 561 aa10.33□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 BACE1P56817 501 aa10.33□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 MTMR2Q13614 643 aa10.33□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 TATDN1Q6P1N9 297 aa10.33□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 AACSQ86V21 672 aa10.33□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAGEB6Q8N7X4 407 aa10.33□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 RHPN1Q8TCX5 695 aa10.33□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 GCC1Q96CN9 775 aa10.33□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 RNF208Q9H0X6 261 aa10.33□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 TXNRD2Q9NNW7 524 aa10.33□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 PNMA3Q9UL41 463 aa10.33□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 DNAH12Q6ZR08 3092 aa10.32□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 H0YGN5 161 aa10.32□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 SGPL1O95470 568 aa10.32□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP10.32□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRIM32Q13049 653 aa10.32□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa10.32□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRO3102Q9H379 93 aa10.32□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 AS3MTQ9HBK9 375 aa10.32□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 EMILIN3Q9NT22 766 aa10.32□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa10.32□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa10.31□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 GUCY1A2P33402 732 aa10.31□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 SHMT1P34896 483 aa10.31□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 PLCD1P51178 756 aa10.31□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 UBXN2AP68543 259 aa10.31□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 GABPAQ06546 454 aa10.31□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 ERC1Q8IUD2 1116 aa10.31□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 EHD4Q9H223 541 aa10.31□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 GINM1Q9NU53 330 aa10.31□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 PCDH10Q9P2E7 1040 aa10.31□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 RBPJLQ9UBG7 517 aa10.31□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 COG6Q9Y2V7 657 aa10.31□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 MYH6P13533 1939 aa10.31□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 C19orf81C9J6K1 198 aa10.3□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 USP17L10C9JJH3 530 aa10.3□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 SMIM22K7EJ46 135 aa10.3□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 CNMDO75829 334 aa10.3□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 GH2P01242 217 aa10.3□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 CHGBP05060 677 aa10.3□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 HERVK_113P62684 666 aa10.3□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 Q3C1V9 767 aa10.3□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLFNL1Q499Z3 407 aa10.3□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 NKX2-3Q8TAU0 364 aa10.3□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP10.3□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRIB2Q92519 343 aa10.3□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 USP6NLQ92738 828 aa10.3□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 COA7Q96BR5 231 aa10.3□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 C12orf42Q96LP6 360 aa10.3□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 DEFB118Q96PH6 123 aa10.3□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 PORCNQ9H237 461 aa10.3□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 HLA-DOAP06340 250 aa10.29□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 PDE6AP16499 860 aa10.29□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAP3K12Q12852 859 aa10.29□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP10.29□□□□□ -0.762e-7■■■■■ 32.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms