RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452514.6

MEG3-211, Transcript of maternally expressed 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MEG3, Length 461 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEG3-211ENST00000452514 RUFY2Q8WXA3 655 aa21.27■■□□□ 1
MEG3-211ENST00000452514 SWAP70Q9UH65 585 aa21.27■■□□□ 1
MEG3-211ENST00000452514 PHIPQ8WWQ0 1821 aa21.27■□□□□ 0.99
MEG3-211ENST00000452514 MINDY4BA8MYZ0 360 aa21.26■□□□□ 0.99
MEG3-211ENST00000452514 SGSM2O43147 1006 aa21.25■□□□□ 0.99
MEG3-211ENST00000452514 FGAP02671 866 aa21.25■□□□□ 0.99
MEG3-211ENST00000452514 CDK8P49336 464 aa21.25■□□□□ 0.99
MEG3-211ENST00000452514 PPARAQ07869 468 aa21.25■□□□□ 0.99
MEG3-211ENST00000452514 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
MEG3-211ENST00000452514 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
MEG3-211ENST00000452514 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa21.25■□□□□ 0.99
MEG3-211ENST00000452514 MYH8P13535 1937 aa21.25■□□□□ 0.99
MEG3-211ENST00000452514 IRF6O14896 467 aa21.24■□□□□ 0.99
MEG3-211ENST00000452514 ASNSP08243 561 aa21.24■□□□□ 0.99
MEG3-211ENST00000452514 DSCC1Q9BVC3 393 aa21.24■□□□□ 0.99
MEG3-211ENST00000452514 GINM1Q9NU53 330 aa21.24■□□□□ 0.99
MEG3-211ENST00000452514 KCNH4Q9UQ05 1017 aa21.24■□□□□ 0.99
MEG3-211ENST00000452514 ZHX2Q9Y6X8 837 aa21.24■□□□□ 0.99
MEG3-211ENST00000452514 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
MEG3-211ENST00000452514 GH2P01242 217 aa21.23■□□□□ 0.99
MEG3-211ENST00000452514 MS4A4AQ96JQ5 239 aa21.23■□□□□ 0.99
MEG3-211ENST00000452514 CDC45O75419 566 aa21.22■□□□□ 0.99
MEG3-211ENST00000452514 ABCB5Q2M3G0 1257 aa21.22■□□□□ 0.99
MEG3-211ENST00000452514 STK11IPQ8N1F8 1099 aa21.22■□□□□ 0.99
MEG3-211ENST00000452514 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa21.22■□□□□ 0.99
MEG3-211ENST00000452514 ANAPC4Q9UJX5 808 aa21.22■□□□□ 0.99
MEG3-211ENST00000452514 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa21.22■□□□□ 0.99
MEG3-211ENST00000452514 LAMA4Q16363 1823 aa21.22■□□□□ 0.99
MEG3-211ENST00000452514 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
MEG3-211ENST00000452514 USP17L5A8MUK1 530 aa21.21■□□□□ 0.99
MEG3-211ENST00000452514 GTF2A2P52657 109 aa21.21■□□□□ 0.99
MEG3-211ENST00000452514 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
MEG3-211ENST00000452514 PTPRFP10586 1907 aa21.2■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 CXCL11O14625 94 aa21.2■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 AKR1B1P15121 316 aa21.2■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 RASA1P20936 1047 aa21.2■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 GUCY1A2P33402 732 aa21.2■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 TM4SF4P48230 202 aa21.2■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 CTDSPL2Q05D32 466 aa21.2■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 SREBF2Q12772 1141 aa21.2■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 SNAPC2Q13487 334 aa21.2■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 BRI3BPQ8WY22 251 aa21.2■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 CCDC17Q96LX7 622 aa21.2■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 TBC1D2Q9BYX2 928 aa21.2■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 WBP1LQ9NX94 342 aa21.2■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 TACC3Q9Y6A5 838 aa21.2■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 PTH1RQ03431 593 aa21.19■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 WDR18Q9BV38 432 aa21.19■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 NBPF3Q9H094 633 aa21.19■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 CABP5Q9NP86 173 aa21.19■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP21.19■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa21.18■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 TRIM75PA6NK02 468 aa21.18■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 PRDM1O75626 825 aa21.18■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 CETPP11597 493 aa21.18■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 INHBEP58166 350 aa21.18■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 HAND2P61296 217 aa21.18■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 PDE4BQ07343 736 aa21.18■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 SEPT2Q15019 361 aa21.18■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 CCL15Q16663 113 aa21.18■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 TMEM179Q6ZVK1 233 aa21.18■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 ZNF280CQ8ND82 737 aa21.18■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 PTPN18Q99952 460 aa21.18■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 MKNK2Q9HBH9 465 aa21.18■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 AS3MTQ9HBK9 375 aa21.18■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 ZNF287Q9HBT7 754 aa21.18■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP21.17■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 FGRP09769 529 aa21.17■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 SPP2Q13103 211 aa21.17■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 MOGSQ13724 837 aa21.17■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 RAB3GAP1Q15042 981 aa21.17■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 CASC1Q6TDU7 716 aa21.17■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 IFNL1Q8IU54 200 aa21.17■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 TBC1D10CQ8IV04 446 aa21.17■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 LOC285556D6RIA3 1793 aa21.16■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP21.16■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 INCENPQ9NQS7 918 aa21.16■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 CTNNA3Q9UI47 895 aa21.16■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 PLIN4Q96Q06 1357 aa21.15■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 CLEC10AQ8IUN9 316 aa21.15■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 RNF186Q9NXI6 227 aa21.15■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
MEG3-211ENST00000452514 BTBD19C9JJ37 291 aa21.14■□□□□ 0.97
MEG3-211ENST00000452514 ZNF213O14771 459 aa21.14■□□□□ 0.97
MEG3-211ENST00000452514 ORC4O43929 436 aa21.14■□□□□ 0.97
MEG3-211ENST00000452514 MTMR2Q13614 643 aa21.14■□□□□ 0.97
MEG3-211ENST00000452514 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
MEG3-211ENST00000452514 SH3D19Q5HYK7 790 aa21.14■□□□□ 0.97
MEG3-211ENST00000452514 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa21.14■□□□□ 0.97
MEG3-211ENST00000452514 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
MEG3-211ENST00000452514 ACER1Q8TDN7 264 aa21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms