RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 CYTH3O43739 400 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 PHEXP78562 749 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 TLK2Q86UE8 772 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 STX12Q86Y82 276 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 FAM133AQ8N9E0 248 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 RFWD2Q8NHY2 731 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 SPATA32Q96LK8 384 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 ANO2Q9NQ90 1003 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 TMED5Q9Y3A6 229 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 GOLGA8IPA6NC78 632 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 SFI1A8K8P3 1242 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 MAP3K7O43318 606 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 ADCY3O60266 1144 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 TAF12Q16514 161 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 ANO6Q4KMQ2 910 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 NUDCD3Q8IVD9 361 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 CALML6Q8TD86 181 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 ABCF3Q9NUQ8 709 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 GOLGA8AA7E2F4 631 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 GOLGA8BA8MQT2 603 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 NDUFB5O43674 189 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM37O94972 964 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 BAG2O95816 211 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF24P17028 368 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 VAV2P52735 878 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 GRM1Q13255 1194 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 STK38Q15208 465 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC102BQ68D86 513 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 DHRS1Q96LJ7 313 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 DACH1Q9UI36 760 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 LZTS1Q9Y250 596 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 M0R2C6 588 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 MYO1FO00160 1098 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 SERPINB3P29508 390 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 RAB27AP51159 221 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 SLC7A5Q01650 507 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 STX1AQ16623 288 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 KLC3Q6P597 504 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 BRAPQ7Z569 592 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 C11orf74Q86VG3 221 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 DDHD1Q8NEL9 900 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 ATXN10Q9UBB4 475 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 KIF15Q9NS87 1388 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM64A6NGJ6 449 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM64BA6NI03 449 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 RASSF2P50749 326 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 C10orf88Q9H8K7 445 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 SUN2Q9UH99 717 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 BICDL2A1A5D9 508 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 A6NJR5 290 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 ETF1P62495 437 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 CNGA3Q16281 694 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 VSIG1Q86XK7 387 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 HAUS8Q9BT25 410 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 IP6K2Q9UHH9 426 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF180Q9UJW8 692 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 PLEKHG3A1L390 1219 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 TBC1D12O60347 775 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 MMEP08473 750 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 TOMM20Q15388 145 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 LETM2Q2VYF4 491 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 ALDH1L2Q3SY69 923 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 LLGL2Q6P1M3 1020 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM154Q6P9G4 183 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 VPS36Q86VN1 386 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 PANK1Q8TE04 598 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 CDCA7LQ96GN5 454 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 EHMT1Q9H9B1 1298 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF304Q9HCX3 659 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 LMBRD1Q9NUN5 540 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 SYT1P21579 422 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 POSTNQ15063 836 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-209ENST00000442510 C11orf91Q3C1V1 193 aa6.19□□□□□ -1.42
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