RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 C19orf81C9J6K1 198 aa14.26□□□□□ -0.13
PRAME-210ENST00000442481 SURF6O75683 361 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
PRAME-210ENST00000442481 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa14.26□□□□□ -0.13
PRAME-210ENST00000442481 MAPK4P31152 587 aa14.26□□□□□ -0.13
PRAME-210ENST00000442481 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
PRAME-210ENST00000442481 ATP8B2P98198 1209 aa14.26□□□□□ -0.13
PRAME-210ENST00000442481 TRIM32Q13049 653 aa14.26□□□□□ -0.13
PRAME-210ENST00000442481 C20orf194Q5TEA3 1177 aa14.26□□□□□ -0.13
PRAME-210ENST00000442481 TEX11Q8IYF3 940 aa14.26□□□□□ -0.13
PRAME-210ENST00000442481 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa14.26□□□□□ -0.13
PRAME-210ENST00000442481 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
PRAME-210ENST00000442481 WDR18Q9BV38 432 aa14.26□□□□□ -0.13
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PRAME-210ENST00000442481 A0A0C4DFX4 3053 aa14.26□□□□□ -0.13
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PRAME-210ENST00000442481 BACE1P56817 501 aa14.25□□□□□ -0.13
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PRAME-210ENST00000442481 TDHQ8IZJ6 230 aa14.25□□□□□ -0.13
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PRAME-210ENST00000442481 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
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PRAME-210ENST00000442481 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
PRAME-210ENST00000442481 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
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PRAME-210ENST00000442481 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
PRAME-210ENST00000442481 MTMR2Q13614 643 aa14.24□□□□□ -0.13
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PRAME-210ENST00000442481 CERS3Q8IU89 383 aa14.24□□□□□ -0.13
PRAME-210ENST00000442481 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
PRAME-210ENST00000442481 DEFB123Q8N688 67 aa14.24□□□□□ -0.13
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PRAME-210ENST00000442481 USP17L10C9JJH3 530 aa14.23□□□□□ -0.13
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PRAME-210ENST00000442481 CYP2B6P20813 491 aa14.23□□□□□ -0.13
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PRAME-210ENST00000442481 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa14.23□□□□□ -0.13
PRAME-210ENST00000442481 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
PRAME-210ENST00000442481 SSH3Q8TE77 659 aa14.23□□□□□ -0.13
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PRAME-210ENST00000442481 HERVK_113P62684 666 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-210ENST00000442481 CCNA1P78396 465 aa14.22□□□□□ -0.13
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PRAME-210ENST00000442481 CCDC158Q5M9N0 1113 aa14.22□□□□□ -0.13
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PRAME-210ENST00000442481 TRIB2Q92519 343 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-210ENST00000442481 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa14.22□□□□□ -0.13
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PRAME-210ENST00000442481 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
PRAME-210ENST00000442481 APBA2Q99767 749 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-210ENST00000442481 MTMR10Q9NXD2 777 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-210ENST00000442481 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-210ENST00000442481 PFASO15067 1338 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-210ENST00000442481 MSCO60682 206 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-210ENST00000442481 PEX10O60683 326 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-210ENST00000442481 HMMRO75330 724 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-210ENST00000442481 PPP4CP60510 307 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-210ENST00000442481 ERVK-9P63128 1117 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-210ENST00000442481 ERVK-24P63145 666 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-210ENST00000442481 TTC39AQ5SRH9 613 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-210ENST00000442481 USP17L2Q6R6M4 530 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-210ENST00000442481 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-210ENST00000442481 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
PRAME-210ENST00000442481 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
PRAME-210ENST00000442481 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa14.2□□□□□ -0.14
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PRAME-210ENST00000442481 USP14P54578 494 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-210ENST00000442481 TNNI3KQ59H18 835 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-210ENST00000442481 MFSD14CQ5VZR4 134 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-210ENST00000442481 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
PRAME-210ENST00000442481 PI16Q6UXB8 463 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-210ENST00000442481 GPR142Q7Z601 462 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-210ENST00000442481 PLEKHH3Q7Z736 793 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-210ENST00000442481 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
PRAME-210ENST00000442481 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-210ENST00000442481 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
PRAME-210ENST00000442481 GPR108Q9NPR9 543 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-210ENST00000442481 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-210ENST00000442481 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-210ENST00000442481 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-210ENST00000442481 FLT1P17948 1338 aa14.18□□□□□ -0.14
PRAME-210ENST00000442481 UNC80Q8N2C7 3258 aa14.18□□□□□ -0.14
PRAME-210ENST00000442481 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
PRAME-210ENST00000442481 FEZ1Q99689 392 aa14.18□□□□□ -0.14
PRAME-210ENST00000442481 PAGR1Q9BTK6 254 aa14.18□□□□□ -0.14
PRAME-210ENST00000442481 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa14.18□□□□□ -0.14
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