RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439822.6

PLEKHB2-208, Transcript of pleckstrin homology domain containing B2, human

TSL 3 BASIC

Gene PLEKHB2, Length 4,177 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PLEKHB2-208	ENST00000439822	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	FAM205C	A6NFA0	338 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	FOXP2	O15409	715 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	YEATS4	O95619	227 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	CACNB3	P54284	484 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	XDH	P47989	1333 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	SKIL	P12757	684 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	UBASH3A	P57075	661 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	NBPF3	Q9H094	633 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	LIFR	P42702	1097 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	GPSM2	P81274	684 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	MXD3	Q9BW11	206 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	CASP1	P29466	404 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ZNF75D	P51815	510 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ATL3	Q6DD88	541 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	IFNAR1	P17181	557 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	UBA7	P41226	1012 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	SLC39A14	Q15043	492 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	LETM2	Q2VYF4	491 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ARID5B	Q14865	1188 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	SLF2	Q8IX21	1173 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	EYA3	Q99504	573 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	CALM1	P0DP23	149 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	CALM2	P0DP24	149 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	CALM3	P0DP25	149 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	MMP10	P09238	476 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	TNNT1	P13805	278 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	FAM196B	A6NMK8	535 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	LONRF3	Q496Y0	759 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	FOXN1	O15353	648 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	MMP1	P03956	469 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	TXNRD1	Q16881	649 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	TTC38	Q5R3I4	469 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	CD209	Q9NNX6	404 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ERCC3	P19447	782 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	USP40	Q9NVE5	1235 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	OFD1	O75665	1012 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	CMA1	P23946	247 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	EPSTI1	Q96J88	318 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	CSRNP2	Q9H175	543 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	TNNI2	P48788	182 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	13.52	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
PLEKHB2-208	ENST00000439822	CUTA	O60888	179 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PLEKHB2-208	ENST00000439822	IDE	P14735	1019 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PLEKHB2-208	ENST00000439822	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PLEKHB2-208	ENST00000439822	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PLEKHB2-208	ENST00000439822	PTGDR	Q13258	359 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PLEKHB2-208	ENST00000439822	HS1BP3	Q53T59	392 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PLEKHB2-208	ENST00000439822	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PLEKHB2-208	ENST00000439822	TPM1	P09493	284 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PLEKHB2-208	ENST00000439822	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PLEKHB2-208	ENST00000439822	GRIN1	Q05586	938 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ALX1	Q15699	326 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PLEKHB2-208	ENST00000439822	INF2	Q27J81	1249 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PLEKHB2-208	ENST00000439822	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PLEKHB2-208	ENST00000439822	KLRF2	D3W0D1	207 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PLEKHB2-208	ENST00000439822	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PLEKHB2-208	ENST00000439822	CLSTN1	O94985	981 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PLEKHB2-208	ENST00000439822	HLA-DOA	P06340	250 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PLEKHB2-208	ENST00000439822	AP5Z1	O43299	807 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PLEKHB2-208	ENST00000439822	STAT6	P42226	847 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PLEKHB2-208	ENST00000439822	PTPN14	Q15678	1187 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PLEKHB2-208	ENST00000439822	GRIK5	Q16478	980 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25

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