RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439407.1

LMCD1-AS1-202, LMCD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene LMCD1-AS1, Length 576 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 FAM151AQ8WW52 585 aa7.88□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 GTF3C6Q969F1 213 aa7.88□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 DDX11Q96FC9 970 aa7.88□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KAT14Q9H8E8 782 aa7.88□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 LY9Q9HBG7 655 aa7.88□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KIF3AQ9Y496 699 aa7.88□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 LAMA4Q16363 1823 aa7.87□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa7.87□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 COL4A5P29400 1685 aa7.87□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa7.87□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SHTN1A0MZ66 631 aa7.87□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 WNT10BO00744 389 aa7.87□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 DTNBO60941 627 aa7.87□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CDKL5O76039 1030 aa7.87□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 DDNO94850 711 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CALM1P0DP23 149 aa7.87□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CALM2P0DP24 149 aa7.87□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CALM3P0DP25 149 aa7.87□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 RXRAP19793 462 aa7.87□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 RASA1P20936 1047 aa7.87□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PDCP20941 246 aa7.87□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 EVCP57679 992 aa7.87□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TNFAIP1Q13829 316 aa7.87□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa7.87□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SGMS1Q86VZ5 419 aa7.87□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 MICU3Q86XE3 530 aa7.87□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 DGKHQ86XP1 1220 aa7.87□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ZNF654Q8IZM8 581 aa7.87□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CCDC17Q96LX7 622 aa7.87□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 MYL10Q9BUA6 226 aa7.87□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP7.87□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SENP2Q9HC62 589 aa7.87□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CABP5Q9NP86 173 aa7.87□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa7.87□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 STX8Q9UNK0 236 aa7.87□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 MTMR7Q9Y216 660 aa7.87□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 MYH1P12882 1939 aa7.87□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 EP400Q96L91 3159 aa7.87□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 H3BQV1 296 aa7.86□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NMT2O60551 498 aa7.86□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 AKR1B1P15121 316 aa7.86□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ADD1P35611 737 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ATP2B2Q01814 1243 aa7.86□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 GABPAQ06546 454 aa7.86□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PPP2R5BQ15173 497 aa7.86□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SEC23AQ15436 765 aa7.86□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 RTN1Q16799 776 aa7.86□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa7.86□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 IFFO2Q5TF58 517 aa7.86□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 FKBP1CQ5VVH2 108 aa7.86□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 APOA5Q6Q788 366 aa7.86□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa7.86□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 FAM83AQ86UY5 434 aa7.86□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 FANCBQ8NB91 859 aa7.86□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CSRNP1Q96S65 589 aa7.86□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 EHD4Q9H223 541 aa7.86□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 GPRC5DQ9NZD1 345 aa7.86□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 HACL1Q9UJ83 578 aa7.86□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TAOK2Q9UL54 1235 aa7.86□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NAV1Q8NEY1 1877 aa7.85□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ROBO3Q96MS0 1386 aa7.85□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PTPDC1A2A3K4 754 aa7.85□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 FAM196BA6NMK8 535 aa7.85□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 STX6O43752 255 aa7.85□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 JAK2O60674 1132 aa7.85□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PPFIA3O75145 1194 aa7.85□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TOP1P11387 765 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 EPS15P42566 896 aa7.85□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 FOSBP53539 338 aa7.85□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ST3GAL1Q11201 340 aa7.85□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 RASA3Q14644 834 aa7.85□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ABCB5Q2M3G0 1257 aa7.85□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TRIM22Q8IYM9 498 aa7.85□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CCDC82Q8N4S0 544 aa7.85□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ANKS1AQ92625 1134 aa7.85□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TMEM47Q9BQJ4 181 aa7.85□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TMEM39BQ9GZU3 492 aa7.85□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 IL17RBQ9NRM6 502 aa7.85□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CLIP2Q9UDT6 1046 aa7.85□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 HPS5Q9UPZ3 1129 aa7.85□□□□□ -1.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PSME4Q14997 1843 aa7.85□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms