RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP25.55■■□□□ 1.68
LIMS1-208ENST00000428064 KIF1BPQ96EK5 621 aa25.55■■□□□ 1.68
LIMS1-208ENST00000428064 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
LIMS1-208ENST00000428064 EHD4Q9H223 541 aa25.55■■□□□ 1.68
LIMS1-208ENST00000428064 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
LIMS1-208ENST00000428064 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa25.55■■□□□ 1.68
LIMS1-208ENST00000428064 ADCY3O60266 1144 aa25.54■■□□□ 1.68
LIMS1-208ENST00000428064 CAPN2P17655 700 aa25.54■■□□□ 1.68
LIMS1-208ENST00000428064 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
LIMS1-208ENST00000428064 JAG1P78504 1218 aa25.54■■□□□ 1.68
LIMS1-208ENST00000428064 MTMR2Q13614 643 aa25.54■■□□□ 1.68
LIMS1-208ENST00000428064 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
LIMS1-208ENST00000428064 MIGA1Q8NAN2 632 aa25.54■■□□□ 1.68
LIMS1-208ENST00000428064 COA7Q96BR5 231 aa25.54■■□□□ 1.68
LIMS1-208ENST00000428064 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa25.54■■□□□ 1.68
LIMS1-208ENST00000428064 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
LIMS1-208ENST00000428064 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa25.54■■□□□ 1.68
LIMS1-208ENST00000428064 USP5P45974 858 aa25.53■■□□□ 1.68
LIMS1-208ENST00000428064 TATDN1Q6P1N9 297 aa25.53■■□□□ 1.68
LIMS1-208ENST00000428064 TMOD4Q9NZQ9 345 aa25.53■■□□□ 1.68
LIMS1-208ENST00000428064 MORF4L1Q9UBU8 362 aa25.53■■□□□ 1.68
LIMS1-208ENST00000428064 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
LIMS1-208ENST00000428064 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa25.52■■□□□ 1.68
LIMS1-208ENST00000428064 SIRT2Q8IXJ6 389 aa25.52■■□□□ 1.68
LIMS1-208ENST00000428064 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
LIMS1-208ENST00000428064 RNF208Q9H0X6 261 aa25.52■■□□□ 1.68
LIMS1-208ENST00000428064 COG6Q9Y2V7 657 aa25.52■■□□□ 1.68
LIMS1-208ENST00000428064 NAV1Q8NEY1 1877 aa25.51■■□□□ 1.67
LIMS1-208ENST00000428064 USP17L10C9JJH3 530 aa25.51■■□□□ 1.67
LIMS1-208ENST00000428064 RAB11FIP3O75154 756 aa25.51■■□□□ 1.67
LIMS1-208ENST00000428064 GDF11O95390 407 aa25.51■■□□□ 1.67
LIMS1-208ENST00000428064 SERPINB13Q9UIV8 391 aa25.51■■□□□ 1.67
LIMS1-208ENST00000428064 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
LIMS1-208ENST00000428064 TTC6Q86TZ1 520 aa25.5■■□□□ 1.67
LIMS1-208ENST00000428064 INHAP05111 366 aa25.49■■□□□ 1.67
LIMS1-208ENST00000428064 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
LIMS1-208ENST00000428064 UNC93B1Q9H1C4 597 aa25.49■■□□□ 1.67
LIMS1-208ENST00000428064 RCAN3Q9UKA8 241 aa25.49■■□□□ 1.67
LIMS1-208ENST00000428064 DOCK3Q8IZD9 2030 aa25.48■■□□□ 1.67
LIMS1-208ENST00000428064 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
LIMS1-208ENST00000428064 ELNP15502 786 aa25.48■■□□□ 1.67
LIMS1-208ENST00000428064 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
LIMS1-208ENST00000428064 PCDH10Q9P2E7 1040 aa25.48■■□□□ 1.67
LIMS1-208ENST00000428064 PLXNB2O15031 1838 aa25.47■■□□□ 1.67
LIMS1-208ENST00000428064 PDE6AP16499 860 aa25.47■■□□□ 1.67
LIMS1-208ENST00000428064 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
LIMS1-208ENST00000428064 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
LIMS1-208ENST00000428064 C12orf42Q96LP6 360 aa25.47■■□□□ 1.67
LIMS1-208ENST00000428064 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
LIMS1-208ENST00000428064 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa25.46■■□□□ 1.67
LIMS1-208ENST00000428064 SGPL1O95470 568 aa25.46■■□□□ 1.67
LIMS1-208ENST00000428064 GH2P01242 217 aa25.46■■□□□ 1.67
LIMS1-208ENST00000428064 HERVK_113P62684 666 aa25.46■■□□□ 1.67
LIMS1-208ENST00000428064 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa25.46■■□□□ 1.67
LIMS1-208ENST00000428064 USP17L2Q6R6M4 530 aa25.46■■□□□ 1.67
LIMS1-208ENST00000428064 GJD2Q9UKL4 321 aa25.46■■□□□ 1.67
LIMS1-208ENST00000428064 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa25.45■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 EMILIN3Q9NT22 766 aa25.45■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 GOLIM4O00461 696 aa25.44■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 PDE3AQ14432 1141 aa25.44■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 HTATIP2Q9BUP3 242 aa25.44■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 TAOK2Q9UL54 1235 aa25.44■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF532Q9HCE3 1301 aa25.43■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 APBB1O00213 710 aa25.43■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 HMGCRP04035 888 aa25.43■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 SHMT1P34896 483 aa25.43■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 PLCD1P51178 756 aa25.43■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 USP14P54578 494 aa25.43■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 GABPAQ06546 454 aa25.43■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa25.43■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa25.43■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 ATP5JP18859 108 aa25.42■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 ABCB5Q2M3G0 1257 aa25.42■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 SOCS4Q8WXH5 440 aa25.42■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa25.42■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 TXNRD2Q9NNW7 524 aa25.42■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 CABP5Q9NP86 173 aa25.41■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 PAG1Q9NWQ8 432 aa25.41■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 RBPJLQ9UBG7 517 aa25.41■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 H0YGN5 161 aa25.4■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 MAPK4P31152 587 aa25.4■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 ERVK-9P63128 1117 aa25.4■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 ERVK-24P63145 666 aa25.4■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 RAB3GAP1Q15042 981 aa25.4■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 DEFB118Q96PH6 123 aa25.4■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 FEZ1Q99689 392 aa25.4■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 MYH7P12883 1935 aa25.39■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 USP17L15C9J2P7 530 aa25.39■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 USP17L13C9JLJ4 530 aa25.39■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 USP17L11C9JVI0 530 aa25.39■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 USP17L18D6R9N7 530 aa25.39■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 USP17L22D6RA61 530 aa25.39■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 USP17L17D6RBQ6 530 aa25.39■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 USP17L19D6RCP7 530 aa25.39■■□□□ 1.66
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