RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 SWAP70Q9UH65 585 aa12.27□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 TTC6Q86TZ1 520 aa12.27□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 TMTC1Q8IUR5 882 aa12.27□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM87BQ96K49 555 aa12.27□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 VCX3BQ9H321 246 aa12.27□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 POLKQ9UBT6 870 aa12.27□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 DEXIO95424 95 aa12.27□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT24Q2M2I5 525 aa12.27□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa12.27□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 DIP2AQ14689 1571 aa12.27□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP6V1AP38606 617 aa12.27□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 FYB2Q5VWT5 728 aa12.27□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 CNNM4Q6P4Q7 775 aa12.27□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 KIFAP3Q92845 792 aa12.27□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa12.27□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM184BQ9ULE4 1060 aa12.27□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa12.27□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa12.27□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM135BQ49AJ0 1406 aa12.27□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 MBD4O95243 580 aa12.26□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 ELF2Q15723 593 aa12.26□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 WDR44Q5JSH3 913 aa12.26□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 MIPOL1Q8TD10 442 aa12.26□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 NOX5Q96PH1 765 aa12.26□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 CLSTN2Q9H4D0 955 aa12.26□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 LDHBP07195 334 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 RPS6KB1P23443 525 aa12.26□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 GEN1Q17RS7 908 aa12.26□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 HELLSQ9NRZ9 838 aa12.26□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 GOLGA6BA6NDN3 693 aa12.26□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 NUP58Q9BVL2 599 aa12.26□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 CTNND2Q9UQB3 1225 aa12.26□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 B4E1Z4 1266 aa12.25□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF75DP51815 510 aa12.25□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 VPS52Q8N1B4 723 aa12.25□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa12.25□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 MYRIPQ8NFW9 859 aa12.25□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 IMPACTQ9P2X3 320 aa12.25□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa12.25□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A1W2PP64 1363 aa12.25□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 ARHGAP25P42331 645 aa12.25□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 SP4Q02446 784 aa12.25□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 PPFIA1Q13136 1202 aa12.25□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 WDR66Q8TBY9 1149 aa12.25□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 MCUR1Q96AQ8 359 aa12.25□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM31Q9BZY9 425 aa12.25□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP7BP35670 1465 aa12.25□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 CUTAO60888 179 aa12.25□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT5P13647 590 aa12.25□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF445P59923 1031 aa12.25□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 KIFC2Q96AC6 838 aa12.25□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 VEZTQ9HBM0 779 aa12.25□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 CBX8Q9HC52 389 aa12.25□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 NALCNQ8IZF0 1738 aa12.25□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 E7EVH7 732 aa12.25□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 TIMM10P62072 90 aa12.25□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 PAK2Q13177 524 aa12.25□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa12.25□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 UBL4BQ8N7F7 174 aa12.25□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 VTI1AQ96AJ9 217 aa12.25□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 ASIC3Q9UHC3 531 aa12.25□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 CEP104O60308 925 aa12.24□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 GAS8O95995 478 aa12.24□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 PAK1Q13153 545 aa12.24□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 NYXQ9GZU5 481 aa12.24□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP12.24□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa12.24□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 INSRP06213 1382 aa12.24□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 RASA3Q14644 834 aa12.24□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 HAUS3Q68CZ6 603 aa12.24□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 HGSO14964 777 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa12.24□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 CCT6BQ92526 530 aa12.24□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 KIF3CO14782 793 aa12.23□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF202O95125 648 aa12.23□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 CA8P35219 290 aa12.23□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 CEP85LQ5SZL2 805 aa12.23□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 ARHGAP24Q8N264 748 aa12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms