RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 USP40Q9NVE5 1235 aa23.94■■□□□ 1.42
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PTPRJ-201ENST00000418331 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
PTPRJ-201ENST00000418331 ASAP1Q9ULH1 1129 aa23.94■■□□□ 1.42
PTPRJ-201ENST00000418331 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa23.94■■□□□ 1.42
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PTPRJ-201ENST00000418331 SIK1P57059 783 aa23.94■■□□□ 1.42
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PTPRJ-201ENST00000418331 TBC1D7Q9P0N9 293 aa23.89■■□□□ 1.41
PTPRJ-201ENST00000418331 PREX2Q70Z35 1606 aa23.88■■□□□ 1.41
PTPRJ-201ENST00000418331 ATP2C2O75185 946 aa23.88■■□□□ 1.41
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PTPRJ-201ENST00000418331 GIMAP7Q8NHV1 300 aa23.88■■□□□ 1.41
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