RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410499.1

RNU6-141P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 141, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-141P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-141P-201ENST00000410499 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-141P-201ENST00000410499 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP0.52□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 IRF6O14896 467 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 EPB42P16452 691 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 PROZP22891 400 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 MT3P25713 68 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 ARL4DP49703 201 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 NCKAP1LP55160 1127 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 CABP4P57796 275 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 USP4Q13107 963 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 NR0B2Q15466 257 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP0.52□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 IER5Q5VY09 327 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 TOP6BLQ8N6T0 577 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP0.52□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 C11orf16Q9NQ32 467 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 MUC5ACP98088 5654 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 ZBBXA8MT70 800 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 PATE3B3GLJ2 98 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 PLSCR1O15162 318 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP0.51□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 YBX1P67809 324 aaKnown RBP0.51□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 DIXDC1Q155Q3 683 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 AKAP4Q5JQC9 854 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 TBCELQ5QJ74 424 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 LCE3EQ5T5B0 92 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP0.51□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 PNMA1Q8ND90 353 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP0.51□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 MTMR4Q9NYA4 1195 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 FAM177BA6PVY3 158 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 FBXO45P0C2W1 286 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 INPP5BP32019 993 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 FSTL1Q12841 308 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 ULK2Q8IYT8 1036 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 ANKS1AQ92625 1134 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 ZBTB9Q96C00 473 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 GPR160Q9UJ42 338 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 FITM1A5D6W6 292 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 H3BS24 57 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 MSL3P1P0C860 447 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 HTRA3P83110 453 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 SNX17Q15036 470 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 SPRED3Q2MJR0 410 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 TUSC1Q2TAM9 212 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 TSGA10IPQ3SY00 556 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 NPNTQ6UXI9 565 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 SLC9A9Q8IVB4 645 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 LGI4Q8N135 537 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 FIBCD1Q8N539 461 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 BEGAINQ9BUH8 593 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 ZNF623O75123 536 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 C1SP09871 688 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 ZGLP1P0C6A0 271 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 MAKP20794 623 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 POTEAQ6S8J7 498 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 OXR1Q8N573 874 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 EXTL1Q92935 676 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 GNAT3A8MTJ3 354 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 ESR1P03372 595 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 TKTP29401 623 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 EPHA4P54764 986 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 LRFN4Q6PJG9 635 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 SIRT2Q8IXJ6 389 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 Q8TCH9 128 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 ZNF778Q96MU6 729 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 PBX4Q9BYU1 374 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 NRSN2Q9GZP1 204 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 BCS1LQ9Y276 419 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-141P-201ENST00000410499 ZAR1LA6NP61 321 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-141P-201ENST00000410499 TGFBR3LH3BV60 316 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-141P-201ENST00000410499 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-141P-201ENST00000410499 LAMTOR5O43504 91 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-141P-201ENST00000410499 EFEMP2O95967 443 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-141P-201ENST00000410499 CTSBP07858 339 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-141P-201ENST00000410499 HIF1AQ16665 826 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-141P-201ENST00000410499 CDKAL1Q5VV42 579 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-141P-201ENST00000410499 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-141P-201ENST00000410499 GSG1LQ6UXU4 331 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-141P-201ENST00000410499 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-141P-201ENST00000410499 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-141P-201ENST00000410499 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-141P-201ENST00000410499 SLC29A3Q9BZD2 475 aa0.46□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms