RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400183.6

USP25-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,341 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-204ENST00000400183 RASA3Q14644 834 aa20.61■□□□□ 0.89
USP25-204ENST00000400183 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
USP25-204ENST00000400183 ZAP70P43403 619 aa20.61■□□□□ 0.89
USP25-204ENST00000400183 POSTNQ15063 836 aa20.61■□□□□ 0.89
USP25-204ENST00000400183 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
USP25-204ENST00000400183 ARHGAP6O43182 974 aa20.6■□□□□ 0.89
USP25-204ENST00000400183 VIMP08670 466 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
USP25-204ENST00000400183 MAGEA1P43355 309 aa20.6■□□□□ 0.89
USP25-204ENST00000400183 CFAP57Q96MR6 1250 aa20.6■□□□□ 0.89
USP25-204ENST00000400183 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP20.6■□□□□ 0.89
USP25-204ENST00000400183 NOD1Q9Y239 953 aa20.6■□□□□ 0.89
USP25-204ENST00000400183 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
USP25-204ENST00000400183 CALCRLQ16602 461 aa20.6■□□□□ 0.89
USP25-204ENST00000400183 DSCC1Q9BVC3 393 aa20.6■□□□□ 0.89
USP25-204ENST00000400183 ZNF445P59923 1031 aa20.6■□□□□ 0.89
USP25-204ENST00000400183 DNAJC10Q8IXB1 793 aa20.6■□□□□ 0.89
USP25-204ENST00000400183 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa20.6■□□□□ 0.89
USP25-204ENST00000400183 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa20.59■□□□□ 0.89
USP25-204ENST00000400183 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa20.59■□□□□ 0.89
USP25-204ENST00000400183 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
USP25-204ENST00000400183 IFT20Q8IY31 132 aa20.59■□□□□ 0.89
USP25-204ENST00000400183 RNF34Q969K3 372 aa20.59■□□□□ 0.89
USP25-204ENST00000400183 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa20.59■□□□□ 0.89
USP25-204ENST00000400183 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
USP25-204ENST00000400183 EXOC3O60645 756 aa20.59■□□□□ 0.89
USP25-204ENST00000400183 CDAN1Q8IWY9 1227 aa20.59■□□□□ 0.89
USP25-204ENST00000400183 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa20.59■□□□□ 0.89
USP25-204ENST00000400183 TAB2Q9NYJ8 693 aa20.59■□□□□ 0.89
USP25-204ENST00000400183 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
USP25-204ENST00000400183 ZBED4O75132 1171 aa20.59■□□□□ 0.89
USP25-204ENST00000400183 HPDP32754 393 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
USP25-204ENST00000400183 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
USP25-204ENST00000400183 DYMQ7RTS9 669 aa20.59■□□□□ 0.89
USP25-204ENST00000400183 TM6SF1Q9BZW5 370 aa20.59■□□□□ 0.89
USP25-204ENST00000400183 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
USP25-204ENST00000400183 ATP5JP18859 108 aa20.58■□□□□ 0.89
USP25-204ENST00000400183 LARGE2Q8N3Y3 721 aa20.58■□□□□ 0.89
USP25-204ENST00000400183 PPFIBP2Q8ND30 876 aa20.58■□□□□ 0.89
USP25-204ENST00000400183 LMTK3Q96Q04 1460 aa20.58■□□□□ 0.89
USP25-204ENST00000400183 FLOT1O75955 427 aa20.58■□□□□ 0.89
USP25-204ENST00000400183 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
USP25-204ENST00000400183 CABP7Q86V35 215 aa20.58■□□□□ 0.89
USP25-204ENST00000400183 MYCT1Q8N699 235 aa20.58■□□□□ 0.89
USP25-204ENST00000400183 AFAP1L1Q8TED9 768 aa20.58■□□□□ 0.89
USP25-204ENST00000400183 BEND3Q5T5X7 828 aa20.58■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 CROCCP2Q86T23 111 aa20.58■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 PLCD3Q8N3E9 789 aa20.58■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 ORAI2Q96SN7 254 aa20.58■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 GMNNO75496 209 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 CDC37L1Q7L3B6 337 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 KCNJ14Q9UNX9 436 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 BICRAQ9NZM4 1560 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 SHANK2Q9UPX8 1470 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 TFAP4Q01664 338 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 CARD6Q9BX69 1037 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 AZI2Q9H6S1 392 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 H0YIN7 160 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 STK10O94804 968 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 KRBA2Q6ZNG9 492 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 CPXCR1Q8N123 301 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 SUPT20HQ8NEM7 779 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 GINS2Q9Y248 185 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 PDE6BP35913 854 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 KLHL30Q0D2K2 578 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 NSMFQ6X4W1 530 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 MAEAQ7L5Y9 396 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 E7EWF7 191 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 DAPK3O43293 454 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 BCRP11274 1271 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 NELFBQ8WX92 580 aa20.56■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 CCT6BQ92526 530 aa20.56■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 FYB2Q5VWT5 728 aa20.56■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 SWAP70Q9UH65 585 aa20.56■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 A6NNZ2 444 aa20.56■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 CEP104O60308 925 aa20.56■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 GEN1Q17RS7 908 aa20.56■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 TUBB8Q3ZCM7 444 aa20.56■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 DCUN1D2Q6PH85 259 aa20.56■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa20.56■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 JAK2O60674 1132 aa20.56■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 CFBP00751 764 aa20.56■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 ASIC3Q9UHC3 531 aa20.56■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 GCNT3O95395 438 aa20.55■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 STMN2Q93045 179 aa20.55■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 TSKSQ9UJT2 592 aa20.55■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 USH1GQ495M9 461 aa20.55■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 SYCE1Q8N0S2 351 aa20.55■□□□□ 0.88
USP25-204ENST00000400183 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms