RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397343.2

PGAM1P4-201, Transcript of phosphoglycerate mutase 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene PGAM1P4, Length 750 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P4-201ENST00000397343 ZNF408Q9H9D4 720 aa14.66□□□□□ -0.06
PGAM1P4-201ENST00000397343 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa14.66□□□□□ -0.06
PGAM1P4-201ENST00000397343 ERICH2A1L162 156 aa14.65□□□□□ -0.06
PGAM1P4-201ENST00000397343 UNCXA6NJT0 531 aa14.65□□□□□ -0.06
PGAM1P4-201ENST00000397343 FAM196BA6NMK8 535 aa14.65□□□□□ -0.06
PGAM1P4-201ENST00000397343 B4E1Z4 1266 aa14.65□□□□□ -0.06
PGAM1P4-201ENST00000397343 SMIM22K7EJ46 135 aa14.65□□□□□ -0.06
PGAM1P4-201ENST00000397343 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PGAM1P4-201ENST00000397343 KDM4AO75164 1064 aa14.65□□□□□ -0.06
PGAM1P4-201ENST00000397343 USP2O75604 605 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PGAM1P4-201ENST00000397343 CELF2O95319 508 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PGAM1P4-201ENST00000397343 RASA1P20936 1047 aa14.65□□□□□ -0.06
PGAM1P4-201ENST00000397343 MAP3K9P80192 1104 aa14.65□□□□□ -0.06
PGAM1P4-201ENST00000397343 TFAP4Q01664 338 aa14.65□□□□□ -0.06
PGAM1P4-201ENST00000397343 EVX2Q03828 476 aa14.65□□□□□ -0.06
PGAM1P4-201ENST00000397343 PRKG1Q13976 671 aa14.65□□□□□ -0.06
PGAM1P4-201ENST00000397343 ABCB5Q2M3G0 1257 aa14.65□□□□□ -0.06
PGAM1P4-201ENST00000397343 IL17RAQ96F46 866 aa14.65□□□□□ -0.06
PGAM1P4-201ENST00000397343 WRNIP1Q96S55 665 aa14.65□□□□□ -0.06
PGAM1P4-201ENST00000397343 UBAC1Q9BSL1 405 aa14.65□□□□□ -0.06
PGAM1P4-201ENST00000397343 MTA3Q9BTC8 594 aa14.65□□□□□ -0.06
PGAM1P4-201ENST00000397343 DNAJC18Q9H819 358 aa14.65□□□□□ -0.06
PGAM1P4-201ENST00000397343 ZNF112Q9UJU3 913 aa14.65□□□□□ -0.06
PGAM1P4-201ENST00000397343 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PGAM1P4-201ENST00000397343 CSADQ9Y600 493 aa14.65□□□□□ -0.06
PGAM1P4-201ENST00000397343 NEDD4P46934 1319 aa14.65□□□□□ -0.06
PGAM1P4-201ENST00000397343 ECM29Q5VYK3 1845 aa14.64□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 TMEM88BA6NKF7 163 aa14.64□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 ASNSP08243 561 aa14.64□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 CASTP20810 708 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 CAP2P40123 477 aa14.64□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 MAP3K11Q16584 847 aa14.64□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 DLK2Q6UY11 383 aa14.64□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 STOX1Q6ZVD7 989 aa14.64□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 TMEM179Q6ZVK1 233 aa14.64□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 NEDD1Q8NHV4 660 aa14.64□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 INCENPQ9NQS7 918 aa14.64□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 PICK1Q9NRD5 415 aa14.64□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 TAF6LQ9Y6J9 622 aa14.64□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 NAV1Q8NEY1 1877 aa14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 PHF20L1A8MW92 1017 aa14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 FGD1P98174 961 aa14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 RABEP1Q15276 862 aa14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 ADCK5Q3MIX3 580 aa14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 FAM47AQ5JRC9 791 aa14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 CST9Q5W186 159 aa14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 RUFY3Q7L099 469 aa14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 KANSL2Q9H9L4 492 aa14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 ZSWIM5Q9P217 1185 aa14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 WDR19Q8NEZ3 1342 aa14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 THSD7BQ9C0I4 1608 aa14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 GDF11O95390 407 aa14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 GH2P01242 217 aa14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 AKR1B1P15121 316 aa14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 SCYL3Q8IZE3 742 aa14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 TMTC2Q8N394 836 aa14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 TMEM87BQ96K49 555 aa14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 TTC14Q96N46 770 aa14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 TACC3Q9Y6A5 838 aa14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 FOCADQ5VW36 1801 aa14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 MYH1P12882 1939 aa14.61□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 RASSF10A6NK89 507 aa14.61□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 PRC1O43663 620 aa14.61□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 SLURP2P0DP57 97 aa14.61□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 RPS6KB1P23443 525 aa14.61□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 NEK4P51957 841 aa14.61□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 RAB3GAP1Q15042 981 aa14.61□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 TBC1D2Q9BYX2 928 aa14.61□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 AS3MTQ9HBK9 375 aa14.61□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 PDRG1Q9NUG6 133 aa14.61□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa14.61□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 USP17L5A8MUK1 530 aa14.6□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 UBE2Q2LH0YL09 131 aa14.6□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 ST18O60284 1047 aa14.6□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 INPP5BP32019 993 aa14.6□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 ANKRD1Q15327 319 aa14.6□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 TMEM67Q5HYA8 995 aa14.6□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 LDLRAD1Q5T700 205 aa14.6□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 CYB5R4Q7L1T6 521 aa14.6□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 DGKHQ86XP1 1220 aa14.6□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 SLC10A4Q96EP9 437 aa14.6□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 SH2D4AQ9H788 454 aa14.6□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 PLIN4Q96Q06 1357 aa14.6□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa14.59□□□□□ -0.07
PGAM1P4-201ENST00000397343 TTLL1O95922 423 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms