RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380232.3

IFNB1-201, Transcript of interferon beta 1, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene IFNB1, Length 859 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1-201ENST00000380232 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
IFNB1-201ENST00000380232 GAL3ST3Q96A11 431 aa9.57□□□□□ -0.88
IFNB1-201ENST00000380232 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
IFNB1-201ENST00000380232 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
IFNB1-201ENST00000380232 FHOD3Q2V2M9 1422 aa9.56□□□□□ -0.88
IFNB1-201ENST00000380232 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa9.55□□□□□ -0.88
IFNB1-201ENST00000380232 PSMD2Q13200 908 aa9.55□□□□□ -0.88
IFNB1-201ENST00000380232 MEI1Q5TIA1 1274 aa9.55□□□□□ -0.88
IFNB1-201ENST00000380232 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
IFNB1-201ENST00000380232 CDC37L1Q7L3B6 337 aa9.55□□□□□ -0.88
IFNB1-201ENST00000380232 NETO1Q8TDF5 533 aa9.55□□□□□ -0.88
IFNB1-201ENST00000380232 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
IFNB1-201ENST00000380232 PLPPR2Q96GM1 343 aa9.55□□□□□ -0.88
IFNB1-201ENST00000380232 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa9.55□□□□□ -0.88
IFNB1-201ENST00000380232 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
IFNB1-201ENST00000380232 DAB2P98082 770 aa9.54□□□□□ -0.88
IFNB1-201ENST00000380232 MAP3K11Q16584 847 aa9.54□□□□□ -0.88
IFNB1-201ENST00000380232 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
IFNB1-201ENST00000380232 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa9.54□□□□□ -0.88
IFNB1-201ENST00000380232 HDXQ7Z353 690 aa9.54□□□□□ -0.88
IFNB1-201ENST00000380232 SLC5A6Q9Y289 635 aa9.54□□□□□ -0.88
IFNB1-201ENST00000380232 CDK8P49336 464 aa9.53□□□□□ -0.88
IFNB1-201ENST00000380232 CYFIP1Q7L576 1253 aa9.53□□□□□ -0.88
IFNB1-201ENST00000380232 FAM161BQ96MY7 647 aa9.53□□□□□ -0.88
IFNB1-201ENST00000380232 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
IFNB1-201ENST00000380232 PRDM10Q9NQV6 1147 aa9.53□□□□□ -0.88
IFNB1-201ENST00000380232 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa9.53□□□□□ -0.88
IFNB1-201ENST00000380232 GLI2P10070 1586 aa9.53□□□□□ -0.88
IFNB1-201ENST00000380232 WDR7Q9Y4E6 1490 aa9.53□□□□□ -0.88
IFNB1-201ENST00000380232 LMNB1P20700 586 aa9.52□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 OXCT1P55809 520 aa9.52□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 RPS26P62854 115 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 BNIP3Q12983 259 aa9.52□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 SEPT6Q14141 434 aa9.52□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 SPRED2Q7Z698 418 aa9.52□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 FBXO33Q7Z6M2 555 aa9.52□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 STK11IPQ8N1F8 1099 aa9.52□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 KCT2Q8NC54 265 aa9.52□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 AGBL5Q8NDL9 886 aa9.52□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 ZNF507Q8TCN5 953 aa9.52□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 MAP3K1Q13233 1512 aa9.51□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 VPS8Q8N3P4 1428 aa9.51□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 ITIH2P19823 946 aa9.51□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 LIG3P49916 1009 aa9.51□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 ARMCX6Q7L4S7 300 aa9.51□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 WFDC3Q8IUB2 231 aa9.51□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 MISP3Q96FF7 219 aa9.51□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 FBRSQ9HAH7 460 aa9.51□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 MKNK2Q9HBH9 465 aa9.51□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 ABCC10Q5T3U5 1492 aa9.51□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 PAX4O43316 350 aa9.5□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 CEACAM5P06731 702 aa9.5□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 AGMOQ6ZNB7 445 aa9.5□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 FAM214BQ7L5A3 538 aa9.5□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 TMC4Q7Z404 712 aa9.5□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa9.5□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 PLAGL2Q9UPG8 496 aa9.5□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa9.5□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 ASXL2Q76L83 1435 aa9.49□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 CFAP43Q8NDM7 1665 aa9.49□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 TEX14Q8IWB6 1497 aa9.49□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 CTSHP09668 335 aa9.49□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 CCDC27Q2M243 656 aa9.49□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 CBLL1Q75N03 491 aa9.49□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 WNT10AQ9GZT5 417 aa9.49□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa9.49□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 DIP2BQ9P265 1576 aa9.49□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 CD96P40200 585 aa9.48□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 ETF1P62495 437 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 VAV3Q9UKW4 847 aa9.48□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 CFAP74Q9C0B2 1584 aa9.48□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 KIF14Q15058 1648 aa9.48□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 ATP10BO94823 1461 aa9.47□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 PLEKHD1A6NEE1 506 aa9.47□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 LRIG2O94898 1065 aa9.47□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 CD8BP10966 210 aa9.47□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 PRKCQQ04759 706 aa9.47□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP9.47□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 PLCL1Q15111 1095 aa9.47□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 NKG7Q16617 165 aa9.47□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 HRASLS5Q96KN8 279 aa9.47□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa9.47□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 TLR6Q9Y2C9 796 aa9.47□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 PHLDB1Q86UU1 1377 aa9.47□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 ARAP3Q8WWN8 1544 aa9.46□□□□□ -0.89
IFNB1-201ENST00000380232 TMEM265A0A087WTH1 108 aa9.46□□□□□ -0.9
IFNB1-201ENST00000380232 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP9.46□□□□□ -0.9
IFNB1-201ENST00000380232 EOMESO95936 686 aa9.46□□□□□ -0.9
IFNB1-201ENST00000380232 GRK4P32298 578 aa9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms