RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373166.7

TRAPPC3-204, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-204ENST00000373166 SOCS4Q8WXH5 440 aa23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC3-204ENST00000373166 NUDT12Q9BQG2 462 aa23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC3-204ENST00000373166 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC3-204ENST00000373166 BAG3O95817 575 aa23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC3-204ENST00000373166 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC3-204ENST00000373166 SYN1P17600 705 aa23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC3-204ENST00000373166 POLA2Q14181 598 aa23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC3-204ENST00000373166 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC3-204ENST00000373166 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC3-204ENST00000373166 DEFB123Q8N688 67 aa23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC3-204ENST00000373166 SSH3Q8TE77 659 aa23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC3-204ENST00000373166 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC3-204ENST00000373166 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC3-204ENST00000373166 C19orf81C9J6K1 198 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC3-204ENST00000373166 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC3-204ENST00000373166 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC3-204ENST00000373166 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC3-204ENST00000373166 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC3-204ENST00000373166 LRIT3Q3SXY7 679 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC3-204ENST00000373166 LOC285556D6RIA3 1793 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3-204ENST00000373166 PLCG2P16885 1265 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3-204ENST00000373166 MAPK4P31152 587 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3-204ENST00000373166 MCAMP43121 646 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3-204ENST00000373166 HERVK_113P62684 666 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3-204ENST00000373166 PDE3AQ14432 1141 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3-204ENST00000373166 TDHQ8IZJ6 230 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3-204ENST00000373166 TRIM34Q9BYJ4 488 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3-204ENST00000373166 DDX19BQ9UMR2 479 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3-204ENST00000373166 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 TXNRD2Q9NNW7 524 aa23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 GINM1Q9NU53 330 aa23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 COG6Q9Y2V7 657 aa23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 USP17L10C9JJH3 530 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 SURF6O75683 361 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 CEP85Q6P2H3 762 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 DOCK3Q8IZD9 2030 aa23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 PPP4CP60510 307 aa23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 RBPJLQ9UBG7 517 aa23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 PFASO15067 1338 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 PEX10O60683 326 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 JAG1P78504 1218 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 Q7L0L9 218 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 COL6A1P12109 1028 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 RGS2P41220 211 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 ERVK-9P63128 1117 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 ERVK-24P63145 666 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 USP6NLQ92738 828 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 DNAJC18Q9H819 358 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 FLT1P17948 1338 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 ALPK3Q96L96 1907 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 GDF11O95390 407 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 Q3C1V9 767 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 TTC39AQ5SRH9 613 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 GPR142Q7Z601 462 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 PLEKHH3Q7Z736 793 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 PAGR1Q9BTK6 254 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 SNRKQ9NRH2 765 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 MTMR10Q9NXD2 777 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 PALD1Q9ULE6 856 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCDC158Q5M9N0 1113 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC3-204ENST00000373166 LHX8Q68G74 356 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC3-204ENST00000373166 PORCNQ9H237 461 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC3-204ENST00000373166 GPR108Q9NPR9 543 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC3-204ENST00000373166 HLA-DOAP06340 250 aa23.38■■□□□ 1.33
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TRAPPC3-204ENST00000373166 CCL14Q16627 93 aa23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC3-204ENST00000373166 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC3-204ENST00000373166 MORN1Q5T089 497 aa23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC3-204ENST00000373166 USP17L2Q6R6M4 530 aa23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC3-204ENST00000373166 APBA2Q99767 749 aa23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC3-204ENST00000373166 EMILIN3Q9NT22 766 aa23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC3-204ENST00000373166 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC3-204ENST00000373166 IGSF3O75054 1194 aa23.37■■□□□ 1.33
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TRAPPC3-204ENST00000373166 TNNI3KQ59H18 835 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC3-204ENST00000373166 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC3-204ENST00000373166 ATAD5Q96QE3 1844 aa23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC3-204ENST00000373166 HMMRO75330 724 aa23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC3-204ENST00000373166 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC3-204ENST00000373166 LRRC26Q2I0M4 334 aa23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC3-204ENST00000373166 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC3-204ENST00000373166 ADGRA1Q86SQ6 560 aa23.36■■□□□ 1.33
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