RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 DXOO77932 396 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 RAB15P59190 212 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 ME3Q16798 604 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 NBPF14Q5TI25 921 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 TMCO3Q6UWJ1 677 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 USP16Q9Y5T5 823 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 RFX7Q2KHR2 1363 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 FAM205CA6NFA0 338 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC69A6NI79 296 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 H3BQV1 296 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 SRGAP3O43295 1099 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 ALDH1L1O75891 902 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 NEXNQ0ZGT2 675 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 IQCB1Q15051 598 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 CAMK4Q16566 473 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 LINC01559Q495D7 138 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 MUM1L1Q5H9M0 696 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 IFFO2Q5TF58 517 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 C9orf131Q5VYM1 1079 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 FBXO33Q7Z6M2 555 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 CKAP2LQ8IYA6 745 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 C1orf216Q8TAB5 229 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 MAP4K1Q92918 833 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 DNAJC25Q9H1X3 360 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 ASAP1Q9ULH1 1129 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 MYH15Q9Y2K3 1946 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 NHSQ6T4R5 1651 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 PI4KAP2A4QPH2 592 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 STAU1O95793 577 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 AGERQ15109 404 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 CREB3L3Q68CJ9 461 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 CDC37L1Q7L3B6 337 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 FCHSD1Q86WN1 690 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 ARMC2Q8NEN0 867 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 RPS6KB1P23443 525 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 ARHGAP4P98171 946 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 ELF2Q15723 593 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 LINS1Q8NG48 757 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 UBXN4Q92575 508 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 FOXJ1Q92949 421 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 PRR14Q9BWN1 585 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 EFCC1Q9HA90 598 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 NRBP1Q9UHY1 535 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 TPCN1Q9ULQ1 816 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 EFCAB8A8MWE9 144 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 ZSCAN12O43309 604 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 CBFA2T2O43439 604 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 MYL6BP14649 208 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 CCZ1BP86790 482 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 FAM160A1Q05DH4 1040 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 C4orf48Q5BLP8 95 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC158Q5M9N0 1113 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 POTEAQ6S8J7 498 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 COPS6Q7L5N1 327 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 BAP1Q92560 729 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 ADCY9O60503 1353 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 LARGE1O95461 756 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 RECKO95980 971 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 PROSER3Q2NL68 480 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 BEND3Q5T5X7 828 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 LHX8Q68G74 356 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 SEPT12Q8IYM1 358 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 MNS1Q8NEH6 495 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 PLBD2Q8NHP8 589 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 XAGE3Q8WTP9 111 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 GTF3C6Q969F1 213 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 IL25Q9H293 177 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 WBP1LQ9NX94 342 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 PSD3Q9NYI0 1048 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 RCOR1Q9UKL0 485 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 TJP1Q07157 1748 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 SBF2Q86WG5 1849 aa8.27□□□□□ -1.08
CTPS1-201ENST00000372616 SOWAHBA6NEL2 793 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 SLC27A2O14975 620 aa8.27□□□□□ -1.09
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