RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372478.4

C9orf50-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 50, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene C9orf50, Length 1,620 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf50-201ENST00000372478 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
C9orf50-201ENST00000372478 ZHX2Q9Y6X8 837 aa30.11■■■□□ 2.41
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C9orf50-201ENST00000372478 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
C9orf50-201ENST00000372478 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
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C9orf50-201ENST00000372478 WBP1LQ9NX94 342 aa30.1■■■□□ 2.41
C9orf50-201ENST00000372478 CDK8P49336 464 aa30.09■■■□□ 2.41
C9orf50-201ENST00000372478 SWAP70Q9UH65 585 aa30.09■■■□□ 2.41
C9orf50-201ENST00000372478 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa30.09■■■□□ 2.41
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C9orf50-201ENST00000372478 MS4A4AQ96JQ5 239 aa30.08■■■□□ 2.41
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C9orf50-201ENST00000372478 ASNSP08243 561 aa30.07■■■□□ 2.4
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C9orf50-201ENST00000372478 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
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C9orf50-201ENST00000372478 ABCB5Q2M3G0 1257 aa30.07■■■□□ 2.4
C9orf50-201ENST00000372478 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
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C9orf50-201ENST00000372478 TM4SF4P48230 202 aa30.06■■■□□ 2.4
C9orf50-201ENST00000372478 ALX1Q15699 326 aa30.06■■■□□ 2.4
C9orf50-201ENST00000372478 RUFY2Q8WXA3 655 aa30.06■■■□□ 2.4
C9orf50-201ENST00000372478 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa30.06■■■□□ 2.4
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C9orf50-201ENST00000372478 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa30.05■■■□□ 2.4
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C9orf50-201ENST00000372478 SNAPC2Q13487 334 aa30.05■■■□□ 2.4
C9orf50-201ENST00000372478 CCL15Q16663 113 aa30.05■■■□□ 2.4
C9orf50-201ENST00000372478 BRI3BPQ8WY22 251 aa30.05■■■□□ 2.4
C9orf50-201ENST00000372478 BEGAINQ9BUH8 593 aa30.05■■■□□ 2.4
C9orf50-201ENST00000372478 TAOK2Q9UL54 1235 aa30.05■■■□□ 2.4
C9orf50-201ENST00000372478 KCNH4Q9UQ05 1017 aa30.05■■■□□ 2.4
C9orf50-201ENST00000372478 TRIM75PA6NK02 468 aa30.04■■■□□ 2.4
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C9orf50-201ENST00000372478 PTPN18Q99952 460 aa30.04■■■□□ 2.4
C9orf50-201ENST00000372478 GINM1Q9NU53 330 aa30.04■■■□□ 2.4
C9orf50-201ENST00000372478 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP30.03■■■□□ 2.4
C9orf50-201ENST00000372478 AKR1B1P15121 316 aa30.03■■■□□ 2.4
C9orf50-201ENST00000372478 INHBEP58166 350 aa30.03■■■□□ 2.4
C9orf50-201ENST00000372478 SPP2Q13103 211 aa30.03■■■□□ 2.4
C9orf50-201ENST00000372478 RAB3GAP1Q15042 981 aa30.03■■■□□ 2.4
C9orf50-201ENST00000372478 CABP5Q9NP86 173 aa30.03■■■□□ 2.4
C9orf50-201ENST00000372478 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
C9orf50-201ENST00000372478 CXCL11O14625 94 aa30.02■■■□□ 2.4
C9orf50-201ENST00000372478 CETPP11597 493 aa30.02■■■□□ 2.4
C9orf50-201ENST00000372478 CTDSPL2Q05D32 466 aa30.02■■■□□ 2.4
C9orf50-201ENST00000372478 IFNL1Q8IU54 200 aa30.02■■■□□ 2.4
C9orf50-201ENST00000372478 MKNK2Q9HBH9 465 aa30.02■■■□□ 2.4
C9orf50-201ENST00000372478 RNF186Q9NXI6 227 aa30.02■■■□□ 2.4
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C9orf50-201ENST00000372478 GUCY1A2P33402 732 aa30■■■□□ 2.39
C9orf50-201ENST00000372478 SEPT2Q15019 361 aa30■■■□□ 2.39
C9orf50-201ENST00000372478 FOXN1O15353 648 aa30■■■□□ 2.39
C9orf50-201ENST00000372478 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
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C9orf50-201ENST00000372478 DSCC1Q9BVC3 393 aa30■■■□□ 2.39
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C9orf50-201ENST00000372478 CA12O43570 354 aa29.95■■■□□ 2.38
C9orf50-201ENST00000372478 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa29.95■■■□□ 2.38
C9orf50-201ENST00000372478 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.38
C9orf50-201ENST00000372478 ACER1Q8TDN7 264 aa29.95■■■□□ 2.38
C9orf50-201ENST00000372478 NBPF3Q9H094 633 aa29.95■■■□□ 2.38
C9orf50-201ENST00000372478 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP29.95■■■□□ 2.38
C9orf50-201ENST00000372478 LOC285556D6RIA3 1793 aa29.94■■■□□ 2.38
C9orf50-201ENST00000372478 BACE1P56817 501 aa29.94■■■□□ 2.38
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