RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362804.1

RNU6-862P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 862, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-862P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-862P-201ENST00000362804 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-862P-201ENST00000362804 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-862P-201ENST00000362804 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-862P-201ENST00000362804 SLFN12Q8IYM2 578 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-862P-201ENST00000362804 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-862P-201ENST00000362804 MFSD2AQ8NA29 543 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-862P-201ENST00000362804 FAM13CQ8NE31 585 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-862P-201ENST00000362804 WFDC12Q8WWY7 111 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-862P-201ENST00000362804 TMEM87BQ96K49 555 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-862P-201ENST00000362804 CCDC74BQ96LY2 380 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-862P-201ENST00000362804 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-862P-201ENST00000362804 CCDC113Q9H0I3 377 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-862P-201ENST00000362804 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-862P-201ENST00000362804 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-862P-201ENST00000362804 CNNM2Q9H8M5 875 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-862P-201ENST00000362804 CSADQ9Y600 493 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-862P-201ENST00000362804 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 TNFRSF10CO14798 259 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 LRIG2O94898 1065 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 CLSTN1O94985 981 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 CST3P01034 146 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 NAT2P11245 290 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 DRD2P14416 443 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 GBP1P32455 592 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 IREB2P48200 963 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 ADGRE1Q14246 886 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 NCAPHQ15003 741 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 ARSHQ5FYA8 562 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 SHISA2Q6UWI4 295 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 Q6ZS46 218 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 TTC6Q86TZ1 520 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 TXNRD3Q86VQ6 643 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 PHACTR4Q8IZ21 702 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 ATG4CQ96DT6 458 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 FOXQ1Q9C009 403 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 ACSS3Q9H6R3 686 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 TJP2Q9UDY2 1190 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 KLHL3Q9UH77 587 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 CORINQ9Y5Q5 1042 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 ACTL7BQ9Y614 415 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 A0A1W2PQH9 124 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 RGS13O14921 159 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 DHX15O43143 795 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 DDAH1O94760 285 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 ALX3O95076 343 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 CYP7A1P22680 504 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 LORP23490 312 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 RXRBP28702 533 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 NOS3P29474 1203 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 ETV3P41162 512 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 PREPP48147 710 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 RNF4P78317 190 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 SERINC3Q13530 473 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 MBTPS1Q14703 1052 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 DDR2Q16832 855 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 OVOS1Q6IE37 1185 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 PAOXQ6QHF9 649 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 UNC5AQ6ZN44 842 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 CLEC10AQ8IUN9 316 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 ISL2Q96A47 359 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 COX4I2Q96KJ9 171 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 MYRFLQ96LU7 910 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 EPN3Q9H201 632 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 TLDC2A0PJX2 215 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 IQCA1LA6NCM1 817 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 UPK3BL1B0FP48 263 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 UPK3BL2E5RIL1 263 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 AGRPO00253 132 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 PDPK1O15530 556 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 CLEC3AO75596 197 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 NEFMP07197 916 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 BMP3P12645 472 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 RAB6AP20340 208 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 COL8A1P27658 744 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
RNU6-862P-201ENST00000362804 NTF4P34130 210 aa2.81□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms