RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359238.6

SNX11-201, Transcript of sorting nexin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX11, Length 2,315 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11-201ENST00000359238 CEP135Q66GS9 1140 aa21.47■■□□□ 1.03
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SNX11-201ENST00000359238 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa21.47■■□□□ 1.03
SNX11-201ENST00000359238 LAMB1P07942 1786 aa21.47■■□□□ 1.03
SNX11-201ENST00000359238 SLX4Q8IY92 1834 aa21.47■■□□□ 1.03
SNX11-201ENST00000359238 USP17L8P0C7I0 530 aa21.47■■□□□ 1.03
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SNX11-201ENST00000359238 KRT85P78386 507 aa21.41■■□□□ 1.02
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SNX11-201ENST00000359238 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa21.41■■□□□ 1.02
SNX11-201ENST00000359238 C7orf43Q8WVR3 580 aa21.41■■□□□ 1.02
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SNX11-201ENST00000359238 MCM9Q9NXL9 1143 aa21.41■■□□□ 1.02
SNX11-201ENST00000359238 CLIP2Q9UDT6 1046 aa21.41■■□□□ 1.02
SNX11-201ENST00000359238 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
SNX11-201ENST00000359238 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.02
SNX11-201ENST00000359238 GOLGA8AA7E2F4 631 aa21.41■■□□□ 1.02
SNX11-201ENST00000359238 KIF28PB7ZC32 967 aa21.41■■□□□ 1.02
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SNX11-201ENST00000359238 GUCY1A2P33402 732 aa21.41■■□□□ 1.02
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SNX11-201ENST00000359238 SLC12A7Q9Y666 1083 aa21.41■■□□□ 1.02
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SNX11-201ENST00000359238 WTAPQ15007 396 aa21.4■■□□□ 1.02
SNX11-201ENST00000359238 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
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SNX11-201ENST00000359238 ZNF592Q92610 1267 aa21.4■■□□□ 1.02
SNX11-201ENST00000359238 EYA3Q99504 573 aa21.4■■□□□ 1.02
SNX11-201ENST00000359238 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa21.4■■□□□ 1.02
SNX11-201ENST00000359238 NAV1Q8NEY1 1877 aa21.4■■□□□ 1.02
SNX11-201ENST00000359238 FGRP09769 529 aa21.4■■□□□ 1.02
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SNX11-201ENST00000359238 FAM205AQ6ZU69 1335 aa21.4■■□□□ 1.02
SNX11-201ENST00000359238 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
SNX11-201ENST00000359238 CCDC69A6NI79 296 aa21.39■■□□□ 1.02
SNX11-201ENST00000359238 BTDP43251 543 aa21.39■■□□□ 1.02
SNX11-201ENST00000359238 PLCD1P51178 756 aa21.39■■□□□ 1.02
SNX11-201ENST00000359238 GSTO1P78417 241 aa21.39■■□□□ 1.02
SNX11-201ENST00000359238 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa21.39■■□□□ 1.02
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