RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355765.10

PRPF39-201, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRPF39, Length 2,868 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-201ENST00000355765 AFMP43652 599 aa21.41■■□□□ 1.02
PRPF39-201ENST00000355765 TUBB4BP68371 445 aa21.41■■□□□ 1.02
PRPF39-201ENST00000355765 AMPD2Q01433 879 aa21.41■■□□□ 1.02
PRPF39-201ENST00000355765 TFR2Q9UP52 801 aa21.41■■□□□ 1.02
PRPF39-201ENST00000355765 BTBD18B2RXH4 712 aa21.4■■□□□ 1.02
PRPF39-201ENST00000355765 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PRPF39-201ENST00000355765 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PRPF39-201ENST00000355765 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PRPF39-201ENST00000355765 FAM169AQ9Y6X4 670 aa21.4■■□□□ 1.02
PRPF39-201ENST00000355765 MYH8P13535 1937 aa21.4■■□□□ 1.02
PRPF39-201ENST00000355765 NWD2Q9ULI1 1742 aa21.4■■□□□ 1.02
PRPF39-201ENST00000355765 USP14P54578 494 aa21.4■■□□□ 1.02
PRPF39-201ENST00000355765 CYB5R4Q7L1T6 521 aa21.4■■□□□ 1.02
PRPF39-201ENST00000355765 CCDC91Q7Z6B0 441 aa21.4■■□□□ 1.02
PRPF39-201ENST00000355765 MMS19Q96T76 1030 aa21.4■■□□□ 1.02
PRPF39-201ENST00000355765 WWC3Q9ULE0 1092 aa21.4■■□□□ 1.02
PRPF39-201ENST00000355765 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa21.4■■□□□ 1.02
PRPF39-201ENST00000355765 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PRPF39-201ENST00000355765 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
PRPF39-201ENST00000355765 PBX1P40424 430 aa21.39■■□□□ 1.02
PRPF39-201ENST00000355765 NT5DC1Q5TFE4 455 aa21.39■■□□□ 1.02
PRPF39-201ENST00000355765 MYBL2P10244 700 aa21.39■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 IARSP41252 1262 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 AMOTQ4VCS5 1084 aa21.39■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 SLC26A6Q9BXS9 759 aa21.39■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 VIPAS39Q9H9C1 493 aa21.39■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 KCNJ14Q9UNX9 436 aa21.39■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 LMO7Q8WWI1 1683 aa21.39■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 LTN1O94822 1766 aa21.38■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 CNGA4Q8IV77 575 aa21.38■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 CRACR2AQ9BSW2 395 aa21.38■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 COG1Q8WTW3 980 aa21.38■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 SPATA1Q5VX52 437 aa21.38■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 ZNF790Q6PG37 636 aa21.38■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 FAM76AQ8TAV0 307 aa21.38■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 NBPF3Q9H094 633 aa21.38■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 C4AP0C0L4 1744 aa21.37■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 C4BP0C0L5 1744 aa21.37■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 CPDO75976 1380 aa21.37■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 UBN2Q6ZU65 1347 aa21.37■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 CDKL5O76039 1030 aa21.37■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 TUBBP07437 444 aa21.37■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 IRAK1P51617 712 aa21.37■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 KCNV1Q6PIU1 500 aa21.37■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 APOA5Q6Q788 366 aa21.37■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 NFXL1Q6ZNB6 911 aa21.37■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 CXorf56Q9H5V9 222 aa21.37■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 SAMM50Q9Y512 469 aa21.37■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 EBAG9O00559 213 aa21.37■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 FILIP1LQ4L180 1135 aa21.37■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 PI16Q6UXB8 463 aa21.37■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa21.37■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 GOLGA6CA6NDK9 693 aa21.36■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 AGPSO00116 658 aa21.36■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 GOLGA6DP0CG33 693 aa21.36■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 NOSTRINQ8IVI9 506 aa21.36■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 CCDC82Q8N4S0 544 aa21.36■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 CHP1Q99653 195 aa21.36■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 VPS16Q9H269 839 aa21.36■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 ABHD10Q9NUJ1 306 aa21.36■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa21.36■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 GUCY1A2P33402 732 aa21.36■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 PSEN1P49768 467 aa21.36■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 MAP9Q49MG5 647 aa21.36■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 TMTC1Q8IUR5 882 aa21.36■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 TBC1D10CQ8IV04 446 aa21.36■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 BCAS4Q8TDM0 211 aa21.36■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 GOLGA8AA7E2F4 631 aa21.35■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 PTPREP23469 700 aa21.35■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 ADORA1P30542 326 aa21.35■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 CEP89Q96ST8 783 aa21.35■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 INCENPQ9NQS7 918 aa21.35■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 B4E1Z4 1266 aa21.35■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 SCARF1Q14162 830 aa21.35■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 TRIML1Q8N9V2 468 aa21.35■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 SELENOOQ9BVL4 669 aa21.35■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 GPAA1O43292 621 aa21.34■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 FOXO4P98177 505 aa21.34■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa21.34■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 STAMQ92783 540 aa21.34■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 CSRNP2Q9H175 543 aa21.34■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 ZBTB43O43298 467 aa21.34■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 CASP7P55210 303 aa21.34■■□□□ 1.01
PRPF39-201ENST00000355765 NR5A1Q13285 461 aa21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56 ms