RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 CFAP73A6NFT4 308 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 PRC1O43663 620 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 SYT1P21579 422 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 NEDD9Q14511 834 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 CDAN1Q8IWY9 1227 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 TEX9Q8N6V9 391 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 MAST3O60307 1309 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 IKBKBO14920 756 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 RNF40O75150 1001 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 TMC6Q7Z403 805 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 EXOC7Q9UPT5 735 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 POTEB3A0JP26 581 aa5.47□□□□□ -1.53
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PTPRD-201ENST00000355233 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa5.47□□□□□ -1.53
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PTPRD-201ENST00000355233 POTEBQ6S5H4 581 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 SATB2Q9UPW6 733 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 IL15P40933 162 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
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PTPRD-201ENST00000355233 OGFOD1Q8N543 542 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 IMPG2Q9BZV3 1241 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 JADE2Q9NQC1 790 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 CALUO43852 315 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.53
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PTPRD-201ENST00000355233 CAMK4Q16566 473 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC42Q96M95 316 aa5.46□□□□□ -1.53
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PTPRD-201ENST00000355233 CLSTN2Q9H4D0 955 aa5.46□□□□□ -1.53
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PTPRD-201ENST00000355233 RFX1P22670 979 aa5.46□□□□□ -1.54
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PTPRD-201ENST00000355233 GJB2P29033 226 aa5.46□□□□□ -1.54
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PTPRD-201ENST00000355233 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 NT5C3AQ9H0P0 336 aa5.46□□□□□ -1.54
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