RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 TCP10Q12799 353 aa23.26■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 STK32BQ9NY57 414 aa23.26■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 MED23Q9ULK4 1368 aa23.26■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 TUBB4BP68371 445 aa23.26■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.26■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 CHMP2AO43633 222 aa23.26■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 RHOXF2BP0C7M4 288 aa23.26■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 RAPGEF1Q13905 1077 aa23.26■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 RHOXF2Q9BQY4 288 aa23.26■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 NBPF14Q5TI25 921 aa23.25■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 USPL1Q5W0Q7 1092 aa23.25■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 GAS2L3Q86XJ1 694 aa23.25■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 SP4Q02446 784 aa23.25■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 PI4K2BQ8TCG2 481 aa23.25■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 CCDC91Q7Z6B0 441 aa23.25■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 IMPG2Q9BZV3 1241 aa23.25■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 BLZF1Q9H2G9 400 aa23.25■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 ATG3Q9NT62 314 aa23.25■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 PCDHA7Q9UN72 937 aa23.25■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 M0R2C6 588 aa23.24■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 TAB2Q9NYJ8 693 aa23.24■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 UBE4AQ14139 1066 aa23.24■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 CABP7Q86V35 215 aa23.24■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 RGS22Q8NE09 1264 aa23.24■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 PKNOX2Q96KN3 472 aa23.24■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 CALCRLQ16602 461 aa23.24■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 MICALCLQ6ZW33 695 aa23.24■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa23.24■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 SYNCQ9H7C4 482 aa23.24■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 BTBD18B2RXH4 712 aa23.24■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 CYP26C1Q6V0L0 522 aa23.24■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 ERO1AQ96HE7 468 aa23.23■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 BACH1O14867 736 aa23.23■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 EPB41P11171 864 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 CMA1P23946 247 aa23.23■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 B4DLN1 442 aa23.23■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 DYMQ7RTS9 669 aa23.23■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 USP40Q9NVE5 1235 aa23.23■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 NLRP10Q86W26 655 aa23.22■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 TSGA10Q9BZW7 698 aa23.22■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 ADGRB3O60242 1522 aa23.22■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 SMCO2A6NFE2 343 aa23.22■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 ALDH1B1P30837 517 aa23.22■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 EVCP57679 992 aa23.22■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 NCAPH2Q6IBW4 605 aa23.22■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa23.22■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 ABCA6Q8N139 1617 aa23.22■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa23.22■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 NELFBQ8WX92 580 aa23.22■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 LARGE2Q8N3Y3 721 aa23.22■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 PNMA1Q8ND90 353 aa23.22■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 TRERF1Q96PN7 1200 aa23.22■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 SEC31BQ9NQW1 1179 aa23.22■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 ARHGAP6O43182 974 aa23.21■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 RASAL2Q9UJF2 1139 aa23.21■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 MTX1Q13505 466 aa23.21■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 PI16Q6UXB8 463 aa23.21■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 BLIDQ8IZY5 108 aa23.21■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 CETN3O15182 167 aa23.21■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 PPP2R3AQ06190 1150 aa23.21■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 PPP1R9BQ96SB3 815 aa23.21■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 ATP2B4P23634 1241 aa23.2■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 KRT9P35527 623 aa23.2■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 ACTN2P35609 894 aa23.2■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 UIMC1Q96RL1 719 aa23.2■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 FAM107BQ9H098 131 aa23.2■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 CLIC4Q9Y696 253 aa23.2■■□□□ 1.31
NISCH-201ENST00000345716 USH1GQ495M9 461 aa23.2■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 PNPLA6Q8IY17 1366 aa23.2■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 FSD2A1L4K1 749 aa23.2■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 ZNF804BA4D1E1 1349 aa23.19■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 E9PCH4 1651 aa23.19■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 CYP27B1O15528 508 aa23.19■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 ADD2P35612 726 aa23.19■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 CCDC155Q8N6L0 562 aa23.19■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 GJA3Q9Y6H8 435 aa23.19■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 NF2P35240 595 aa23.19■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 PIGBQ92521 554 aa23.19■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa23.19■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 OSBP2Q969R2 916 aa23.19■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 TEKT1Q969V4 418 aa23.19■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 CLIC6Q96NY7 704 aa23.19■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 SCG2P13521 617 aa23.18■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 NDUFA8P51970 172 aa23.18■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 APOA5Q6Q788 366 aa23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms