RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 C16orf86Q6ZW13 317 aa22.33■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 SLC44A5Q8NCS7 719 aa22.33■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 ZDHHC15Q96MV8 337 aa22.33■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 SLC26A6Q9BXS9 759 aa22.33■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 STK36Q9NRP7 1315 aa22.33■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 CALM1P0DP23 149 aa22.32■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 CALM2P0DP24 149 aa22.32■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 CALM3P0DP25 149 aa22.32■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 TROAPQ12815 778 aa22.32■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.32■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 GJB4Q9NTQ9 266 aa22.32■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 PIM2Q9P1W9 311 aa22.32■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 FOCADQ5VW36 1801 aa22.32■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 YDJCA8MPS7 323 aa22.31■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 DDAH1O94760 285 aa22.31■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 TSPY3P0CV98 308 aa22.31■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 TSPY8P0CW00 308 aa22.31■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 CDK8P49336 464 aa22.31■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 AIFM3Q96NN9 605 aa22.31■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 MYH1P12882 1939 aa22.31■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 RASA1P20936 1047 aa22.31■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.31■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 NBPF11Q86T75 865 aa22.31■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 TTC6Q86TZ1 520 aa22.31■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 DGKHQ86XP1 1220 aa22.31■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 TRIM22Q8IYM9 498 aa22.31■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.31■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 CCDC178Q5BJE1 867 aa22.3■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 CCDC82Q8N4S0 544 aa22.3■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa22.3■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 CFAP45Q9UL16 551 aa22.3■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 ELP1O95163 1332 aa22.3■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 SOGA3Q5TF21 947 aa22.29■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 WASF1Q92558 559 aa22.29■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 SPATA32Q96LK8 384 aa22.29■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 TMEM63CQ9P1W3 806 aa22.29■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa22.29■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 LARGE2Q8N3Y3 721 aa22.29■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 ANKS1AQ92625 1134 aa22.29■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 SERPINA10Q9UK55 444 aa22.29■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.28■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa22.28■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 VPS33BQ9H267 617 aa22.28■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 TRIM29Q14134 588 aa22.27■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 KRT40Q6A162 431 aa22.27■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 ATL3Q6DD88 541 aa22.27■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 KAT14Q9H8E8 782 aa22.27■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 DEXIO95424 95 aa22.27■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 GUCY1A2P33402 732 aa22.27■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.27■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.27■■□□□ 1.16
UPP1-201ENST00000331803 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.26■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 BRAPQ7Z569 592 aa22.26■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 FSD2A1L4K1 749 aa22.25■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 GABPAQ06546 454 aa22.25■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 NFIAQ12857 509 aa22.25■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.25■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.25■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 FUT2Q10981 343 aa22.25■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 KIF28PB7ZC32 967 aa22.24■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.24■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 ZNF445P59923 1031 aa22.24■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 TMTC3Q6ZXV5 915 aa22.24■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 PNMA1Q8ND90 353 aa22.24■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 USP28Q96RU2 1077 aa22.24■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 ECM29Q5VYK3 1845 aa22.24■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 MYH15Q9Y2K3 1946 aa22.24■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 RAD17O75943 681 aa22.23■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 SGIP1Q9BQI5 828 aa22.23■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 IDI2Q9BXS1 227 aa22.23■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.23■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 STX8Q9UNK0 236 aa22.23■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.5 ms