RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328839.3

PPP4R4-202, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP4R4, Length 876 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4-202ENST00000328839 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
PPP4R4-202ENST00000328839 DEFB118Q96PH6 123 aa30.6■■■□□ 2.49
PPP4R4-202ENST00000328839 WDR18Q9BV38 432 aa30.6■■■□□ 2.49
PPP4R4-202ENST00000328839 BACE1P56817 501 aa30.59■■■□□ 2.49
PPP4R4-202ENST00000328839 JAG1P78504 1218 aa30.58■■■□□ 2.49
PPP4R4-202ENST00000328839 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
PPP4R4-202ENST00000328839 MIER1Q8N108 512 aa30.58■■■□□ 2.49
PPP4R4-202ENST00000328839 MIGA1Q8NAN2 632 aa30.58■■■□□ 2.49
PPP4R4-202ENST00000328839 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa30.58■■■□□ 2.49
PPP4R4-202ENST00000328839 IGSF3O75054 1194 aa30.57■■■□□ 2.48
PPP4R4-202ENST00000328839 USP5P45974 858 aa30.56■■■□□ 2.48
PPP4R4-202ENST00000328839 CEP85Q6P2H3 762 aa30.56■■■□□ 2.48
PPP4R4-202ENST00000328839 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
PPP4R4-202ENST00000328839 MAGEB6Q8N7X4 407 aa30.56■■■□□ 2.48
PPP4R4-202ENST00000328839 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa30.56■■■□□ 2.48
PPP4R4-202ENST00000328839 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa30.56■■■□□ 2.48
PPP4R4-202ENST00000328839 PLXNB2O15031 1838 aa30.55■■■□□ 2.48
PPP4R4-202ENST00000328839 USP17L10C9JJH3 530 aa30.55■■■□□ 2.48
PPP4R4-202ENST00000328839 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
PPP4R4-202ENST00000328839 C19orf81C9J6K1 198 aa30.54■■■□□ 2.48
PPP4R4-202ENST00000328839 AACSQ86V21 672 aa30.54■■■□□ 2.48
PPP4R4-202ENST00000328839 NR2E3Q9Y5X4 410 aa30.54■■■□□ 2.48
PPP4R4-202ENST00000328839 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa30.53■■■□□ 2.48
PPP4R4-202ENST00000328839 HMGCRP04035 888 aa30.53■■■□□ 2.48
PPP4R4-202ENST00000328839 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
PPP4R4-202ENST00000328839 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP30.53■■■□□ 2.48
PPP4R4-202ENST00000328839 GINM1Q9NU53 330 aa30.53■■■□□ 2.48
PPP4R4-202ENST00000328839 MORF4L1Q9UBU8 362 aa30.53■■■□□ 2.48
PPP4R4-202ENST00000328839 PEX10O60683 326 aa30.52■■■□□ 2.48
PPP4R4-202ENST00000328839 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
PPP4R4-202ENST00000328839 ERC1Q8IUD2 1116 aa30.52■■■□□ 2.48
PPP4R4-202ENST00000328839 PANK1Q8TE04 598 aa30.52■■■□□ 2.48
PPP4R4-202ENST00000328839 ANTXR1Q9H6X2 564 aa30.52■■■□□ 2.48
PPP4R4-202ENST00000328839 HERVK_113P62684 666 aa30.51■■■□□ 2.47
PPP4R4-202ENST00000328839 MAP3K12Q12852 859 aa30.51■■■□□ 2.47
PPP4R4-202ENST00000328839 CERS3Q8IU89 383 aa30.51■■■□□ 2.47
PPP4R4-202ENST00000328839 GJD2Q9UKL4 321 aa30.51■■■□□ 2.47
PPP4R4-202ENST00000328839 GH2P01242 217 aa30.5■■■□□ 2.47
PPP4R4-202ENST00000328839 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa30.5■■■□□ 2.47
PPP4R4-202ENST00000328839 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
PPP4R4-202ENST00000328839 EVI5O60447 810 aa30.49■■■□□ 2.47
PPP4R4-202ENST00000328839 CAPN2P17655 700 aa30.49■■■□□ 2.47
PPP4R4-202ENST00000328839 TXNRD2Q9NNW7 524 aa30.49■■■□□ 2.47
PPP4R4-202ENST00000328839 NAV1Q8NEY1 1877 aa30.48■■■□□ 2.47
PPP4R4-202ENST00000328839 ALPK3Q96L96 1907 aa30.48■■■□□ 2.47
PPP4R4-202ENST00000328839 CYP2B6P20813 491 aa30.48■■■□□ 2.47
PPP4R4-202ENST00000328839 TRIM32Q13049 653 aa30.48■■■□□ 2.47
PPP4R4-202ENST00000328839 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
PPP4R4-202ENST00000328839 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
PPP4R4-202ENST00000328839 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
PPP4R4-202ENST00000328839 FEZ1Q99689 392 aa30.48■■■□□ 2.47
PPP4R4-202ENST00000328839 PAGR1Q9BTK6 254 aa30.48■■■□□ 2.47
PPP4R4-202ENST00000328839 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa30.48■■■□□ 2.47
PPP4R4-202ENST00000328839 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa30.48■■■□□ 2.47
PPP4R4-202ENST00000328839 USP17L2Q6R6M4 530 aa30.47■■■□□ 2.47
PPP4R4-202ENST00000328839 BCL11AQ9H165 835 aa30.47■■■□□ 2.47
PPP4R4-202ENST00000328839 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
PPP4R4-202ENST00000328839 EMILIN3Q9NT22 766 aa30.47■■■□□ 2.47
PPP4R4-202ENST00000328839 SERPINB13Q9UIV8 391 aa30.47■■■□□ 2.47
PPP4R4-202ENST00000328839 RPTORQ8N122 1335 aa30.47■■■□□ 2.47
PPP4R4-202ENST00000328839 PDE3AQ14432 1141 aa30.46■■■□□ 2.47
PPP4R4-202ENST00000328839 RAB3GAP1Q15042 981 aa30.46■■■□□ 2.47
PPP4R4-202ENST00000328839 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
PPP4R4-202ENST00000328839 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
PPP4R4-202ENST00000328839 TRIB2Q92519 343 aa30.46■■■□□ 2.47
PPP4R4-202ENST00000328839 NUDT12Q9BQG2 462 aa30.46■■■□□ 2.47
PPP4R4-202ENST00000328839 ZBED9Q6R2W3 1325 aa30.46■■■□□ 2.47
PPP4R4-202ENST00000328839 APBB1O00213 710 aa30.45■■■□□ 2.47
PPP4R4-202ENST00000328839 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa30.45■■■□□ 2.47
PPP4R4-202ENST00000328839 NECAB2Q7Z6G3 386 aa30.45■■■□□ 2.47
PPP4R4-202ENST00000328839 TTC6Q86TZ1 520 aa30.45■■■□□ 2.47
PPP4R4-202ENST00000328839 RBPJLQ9UBG7 517 aa30.45■■■□□ 2.47
PPP4R4-202ENST00000328839 ERVK-9P63128 1117 aa30.44■■■□□ 2.46
PPP4R4-202ENST00000328839 ERVK-24P63145 666 aa30.44■■■□□ 2.46
PPP4R4-202ENST00000328839 TATDN1Q6P1N9 297 aa30.44■■■□□ 2.46
PPP4R4-202ENST00000328839 RHPN1Q8TCX5 695 aa30.44■■■□□ 2.46
PPP4R4-202ENST00000328839 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
PPP4R4-202ENST00000328839 SOCS4Q8WXH5 440 aa30.44■■■□□ 2.46
PPP4R4-202ENST00000328839 EHD4Q9H223 541 aa30.44■■■□□ 2.46
PPP4R4-202ENST00000328839 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
PPP4R4-202ENST00000328839 MAPK4P31152 587 aa30.43■■■□□ 2.46
PPP4R4-202ENST00000328839 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
PPP4R4-202ENST00000328839 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
PPP4R4-202ENST00000328839 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa30.42■■■□□ 2.46
PPP4R4-202ENST00000328839 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
PPP4R4-202ENST00000328839 ABCB5Q2M3G0 1257 aa30.42■■■□□ 2.46
PPP4R4-202ENST00000328839 Q3C1V9 767 aa30.42■■■□□ 2.46
PPP4R4-202ENST00000328839 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
PPP4R4-202ENST00000328839 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
PPP4R4-202ENST00000328839 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
PPP4R4-202ENST00000328839 ANKLE1Q8NAG6 615 aa30.41■■■□□ 2.46
PPP4R4-202ENST00000328839 PORCNQ9H237 461 aa30.41■■■□□ 2.46
PPP4R4-202ENST00000328839 CABP5Q9NP86 173 aa30.41■■■□□ 2.46
PPP4R4-202ENST00000328839 MS4A1P11836 297 aa30.4■■■□□ 2.46
PPP4R4-202ENST00000328839 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa30.4■■■□□ 2.46
PPP4R4-202ENST00000328839 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
PPP4R4-202ENST00000328839 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
PPP4R4-202ENST00000328839 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
PPP4R4-202ENST00000328839 USP17L15C9J2P7 530 aa30.39■■■□□ 2.46
PPP4R4-202ENST00000328839 USP17L13C9JLJ4 530 aa30.39■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77 ms