RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 MKNK2Q9HBH9 465 aa26.57■■□□□ 1.84
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HOXD4-201ENST00000306324 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
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HOXD4-201ENST00000306324 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
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HOXD4-201ENST00000306324 ERO1BQ86YB8 467 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXD4-201ENST00000306324 WNK4Q96J92 1243 aa26.55■■□□□ 1.84
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HOXD4-201ENST00000306324 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
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HOXD4-201ENST00000306324 ASNSP08243 561 aa26.55■■□□□ 1.84
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HOXD4-201ENST00000306324 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
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HOXD4-201ENST00000306324 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa26.54■■□□□ 1.84
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HOXD4-201ENST00000306324 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
HOXD4-201ENST00000306324 AKR1B1P15121 316 aa26.52■■□□□ 1.84
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HOXD4-201ENST00000306324 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
HOXD4-201ENST00000306324 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXD4-201ENST00000306324 INCENPQ9NQS7 918 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXD4-201ENST00000306324 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
HOXD4-201ENST00000306324 ZHX2Q9Y6X8 837 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXD4-201ENST00000306324 PTPRFP10586 1907 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXD4-201ENST00000306324 RASA1P20936 1047 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXD4-201ENST00000306324 NOGQ13253 232 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXD4-201ENST00000306324 RAB3GAP1Q15042 981 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC17Q96LX7 622 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXD4-201ENST00000306324 NBPF3Q9H094 633 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXD4-201ENST00000306324 TOMM22Q9NS69 142 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXD4-201ENST00000306324 GINM1Q9NU53 330 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXD4-201ENST00000306324 IRF6O14896 467 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXD4-201ENST00000306324 PPIL2Q13356 520 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXD4-201ENST00000306324 TBC1D10CQ8IV04 446 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXD4-201ENST00000306324 USP17L5A8MUK1 530 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXD4-201ENST00000306324 AKNAD1Q5T1N1 836 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXD4-201ENST00000306324 MFSD6Q6ZSS7 791 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXD4-201ENST00000306324 ZIC5Q96T25 663 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXD4-201ENST00000306324 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP26.49■■□□□ 1.83
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HOXD4-201ENST00000306324 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
HOXD4-201ENST00000306324 SEPT2Q15019 361 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXD4-201ENST00000306324 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
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HOXD4-201ENST00000306324 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
HOXD4-201ENST00000306324 REC8O95072 547 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXD4-201ENST00000306324 CYP21A2P08686 494 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXD4-201ENST00000306324 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
HOXD4-201ENST00000306324 STAG1Q8WVM7 1258 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXD4-201ENST00000306324 AS3MTQ9HBK9 375 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXD4-201ENST00000306324 MYH4Q9Y623 1939 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXD4-201ENST00000306324 THSD7BQ9C0I4 1608 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXD4-201ENST00000306324 TRIM75PA6NK02 468 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXD4-201ENST00000306324 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
HOXD4-201ENST00000306324 GUCY1A2P33402 732 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXD4-201ENST00000306324 FAM47AQ5JRC9 791 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXD4-201ENST00000306324 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa26.47■■□□□ 1.83
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HOXD4-201ENST00000306324 FGRP09769 529 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXD4-201ENST00000306324 TSPY3P0CV98 308 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXD4-201ENST00000306324 TSPY8P0CW00 308 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXD4-201ENST00000306324 MAP2K2P36507 400 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXD4-201ENST00000306324 SPP2Q13103 211 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF280CQ8ND82 737 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXD4-201ENST00000306324 TSPY2A6NKD2 308 aa26.45■■□□□ 1.82
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HOXD4-201ENST00000306324 GTF2A2P52657 109 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXD4-201ENST00000306324 TFAP4Q01664 338 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXD4-201ENST00000306324 TBC1D2Q9BYX2 928 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXD4-201ENST00000306324 SNAPC2Q13487 334 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXD4-201ENST00000306324 CLEC10AQ8IUN9 316 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXD4-201ENST00000306324 KCNH4Q9UQ05 1017 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXD4-201ENST00000306324 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
HOXD4-201ENST00000306324 NECTIN1Q15223 517 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXD4-201ENST00000306324 WDR18Q9BV38 432 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXD4-201ENST00000306324 CXCL11O14625 94 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXD4-201ENST00000306324 ICA1Q05084 483 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXD4-201ENST00000306324 CREB3L3Q68CJ9 461 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXD4-201ENST00000306324 MS4A4AQ96JQ5 239 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXD4-201ENST00000306324 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP26.42■■□□□ 1.82
HOXD4-201ENST00000306324 TAF6LQ9Y6J9 622 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXD4-201ENST00000306324 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa26.42■■□□□ 1.82
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