RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 NFXL1Q6ZNB6 911 aa24.33■■□□□ 1.49
PACSIN3-201ENST00000298838 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa24.33■■□□□ 1.49
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM83AQ86UY5 434 aa24.33■■□□□ 1.49
PACSIN3-201ENST00000298838 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM151AQ8WW52 585 aa24.33■■□□□ 1.49
PACSIN3-201ENST00000298838 GTF3C6Q969F1 213 aa24.33■■□□□ 1.49
PACSIN3-201ENST00000298838 BRPF3Q9ULD4 1205 aa24.33■■□□□ 1.49
PACSIN3-201ENST00000298838 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
PACSIN3-201ENST00000298838 PFKFB2O60825 505 aa24.33■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 DDNO94850 711 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 CNTNAP1P78357 1384 aa24.33■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC69A6NI79 296 aa24.32■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 GOLGA8BA8MQT2 603 aa24.32■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 ST3GAL1Q11201 340 aa24.32■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 TNFAIP1Q13829 316 aa24.32■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 SEC23AQ15436 765 aa24.32■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 CSRNP1Q96S65 589 aa24.32■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 TRIM34Q9BYJ4 488 aa24.32■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 TNNI2P48788 182 aa24.31■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 SENP2Q9HC62 589 aa24.31■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC178Q5BJE1 867 aa24.31■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 DPY19L2Q6NUT2 758 aa24.31■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 APOA5Q6Q788 366 aa24.31■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 CHMP4CQ96CF2 233 aa24.31■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC12A7Q9Y666 1083 aa24.31■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 DDIT3P35638 169 aa24.3■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 SCRN1Q12765 414 aa24.3■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa24.3■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 NMT2O60551 498 aa24.29■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa24.29■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 SHMT1P34896 483 aa24.28■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 EPS15P42566 896 aa24.28■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 NEDD1Q8NHV4 660 aa24.28■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 SMC3Q9UQE7 1217 aa24.28■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 PLIN4Q96Q06 1357 aa24.28■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 ZBTB43O43298 467 aa24.28■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 CCT2P78371 535 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 MICU3Q86XE3 530 aa24.28■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 TRPM4Q8TD43 1214 aa24.28■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 DNAJC18Q9H819 358 aa24.28■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 IL17RBQ9NRM6 502 aa24.28■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 HPS5Q9UPZ3 1129 aa24.28■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 DGKHQ86XP1 1220 aa24.27■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM39BQ9GZU3 492 aa24.27■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 CHMP5Q9NZZ3 219 aa24.27■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 HACL1Q9UJ83 578 aa24.27■■□□□ 1.48
PACSIN3-201ENST00000298838 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP24.26■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 RCAN1P53805 252 aa24.26■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa24.26■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF654Q8IZM8 581 aa24.26■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC17Q96LX7 622 aa24.26■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM196BA6NMK8 535 aa24.25■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 RASA3Q14644 834 aa24.25■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 TATDN1Q6P1N9 297 aa24.25■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 AKR1B1P15121 316 aa24.24■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 RCSD1Q6JBY9 416 aa24.24■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 CATIPQ7Z7H3 387 aa24.24■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 MYL10Q9BUA6 226 aa24.24■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 NID2Q14112 1375 aa24.24■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 GOLGA8AA7E2F4 631 aa24.24■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 SLURP2P0DP57 97 aa24.24■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 RXRAP19793 462 aa24.24■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 ANKS1AQ92625 1134 aa24.24■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 STX8Q9UNK0 236 aa24.24■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 CPLX1O14810 134 aa24.23■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 GJB2P29033 226 aa24.23■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 KAT14Q9H8E8 782 aa24.23■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP24.23■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 GLTPD2A6NH11 291 aa24.22■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 DDAH1O94760 285 aa24.22■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 CEP95Q96GE4 821 aa24.22■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 DEFB129Q9H1M3 183 aa24.22■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 PGAP2Q9UHJ9 254 aa24.22■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 TBC1D12O60347 775 aa24.21■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 CALM1P0DP23 149 aa24.21■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 CALM2P0DP24 149 aa24.21■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 CALM3P0DP25 149 aa24.21■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa24.21■■□□□ 1.47
PACSIN3-201ENST00000298838 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
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