RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262498.7

CFAP20-201, Transcript of cilia and flagella associated protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CFAP20, Length 1,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP20-201ENST00000262498 ZNF384Q8TF68 577 aa14.83□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 PHKA1P46020 1223 aa14.82□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa14.82□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 COL9A1P20849 921 aa14.81□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 PICALMQ13492 652 aa14.81□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 SHHQ15465 462 aa14.81□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 Q3C1V9 767 aa14.81□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 C9orf50Q5SZB4 431 aa14.81□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 MORN1Q5T089 497 aa14.81□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 MYLIPQ8WY64 445 aa14.81□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 NUDT12Q9BQG2 462 aa14.81□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 USP44Q9H0E7 712 aa14.81□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa14.81□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 TNNQ9UQP3 1299 aa14.81□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 CAP2P40123 477 aa14.8□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 SOCS4Q8WXH5 440 aa14.8□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 PORCNQ9H237 461 aa14.8□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 RBPJLQ9UBG7 517 aa14.8□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 BDP1A6H8Y1 2624 aa14.79□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 MYO9BQ13459 2157 aa14.79□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 NPM3O75607 178 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 BTDP43251 543 aa14.79□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 JAG1P78504 1218 aa14.79□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP14.79□□□□□ -0.047e-7■■■■■ 46.3
CFAP20-201ENST00000262498 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP14.79□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 DENND2AQ9ULE3 1009 aa14.79□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 REV3LO60673 3130 aa14.79□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa14.78□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 SEMA3EO15041 775 aa14.78□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 HERVK_113P62684 666 aa14.78□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 RASGRF1Q13972 1273 aa14.78□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 ATP2B3Q16720 1220 aa14.78□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 TBC1D2Q9BYX2 928 aa14.78□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 FLRT1Q9NZU1 646 aa14.78□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 FOCADQ5VW36 1801 aa14.78□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa14.78□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 USP17L5A8MUK1 530 aa14.77□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 IGHA2P01877 340 aa14.77□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 ADORA1P30542 326 aa14.77□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 MTMR2Q13614 643 aa14.77□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 GPR142Q7Z601 462 aa14.77□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 USP38Q8NB14 1042 aa14.77□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa14.77□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 WDR18Q9BV38 432 aa14.77□□□□□ -0.04
CFAP20-201ENST00000262498 CHD9Q3L8U1 2897 aa14.77□□□□□ -0.05
CFAP20-201ENST00000262498 MAPK4P31152 587 aa14.76□□□□□ -0.05
CFAP20-201ENST00000262498 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CFAP20-201ENST00000262498 BACE1P56817 501 aa14.76□□□□□ -0.05
CFAP20-201ENST00000262498 RTP1P59025 263 aa14.76□□□□□ -0.05
CFAP20-201ENST00000262498 ERVK-9P63128 1117 aa14.76□□□□□ -0.05
CFAP20-201ENST00000262498 ERVK-24P63145 666 aa14.76□□□□□ -0.05
CFAP20-201ENST00000262498 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CFAP20-201ENST00000262498 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CFAP20-201ENST00000262498 CCDC102BQ68D86 513 aa14.76□□□□□ -0.05
CFAP20-201ENST00000262498 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CFAP20-201ENST00000262498 APBA2Q99767 749 aa14.76□□□□□ -0.05
CFAP20-201ENST00000262498 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa14.76□□□□□ -0.05
CFAP20-201ENST00000262498 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CFAP20-201ENST00000262498 XIRP2A4UGR9 3374 aa14.76□□□□□ -0.05
CFAP20-201ENST00000262498 RGS2P41220 211 aa14.75□□□□□ -0.05
CFAP20-201ENST00000262498 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CFAP20-201ENST00000262498 MECOMQ03112 1051 aa14.75□□□□□ -0.05
CFAP20-201ENST00000262498 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CFAP20-201ENST00000262498 DNAJC18Q9H819 358 aa14.75□□□□□ -0.05
CFAP20-201ENST00000262498 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CFAP20-201ENST00000262498 CIAO1O76071 339 aa14.74□□□□□ -0.05
CFAP20-201ENST00000262498 FOSL2P15408 326 aa14.74□□□□□ -0.05
CFAP20-201ENST00000262498 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CFAP20-201ENST00000262498 TRPV1Q8NER1 839 aa14.74□□□□□ -0.05
CFAP20-201ENST00000262498 SIL1Q9H173 461 aa14.74□□□□□ -0.05
CFAP20-201ENST00000262498 ABCF2Q9UG63 623 aa14.74□□□□□ -0.05
CFAP20-201ENST00000262498 SMCHD1A6NHR9 2005 aa14.74□□□□□ -0.05
CFAP20-201ENST00000262498 CHD7Q9P2D1 2997 aa14.74□□□□□ -0.05
CFAP20-201ENST00000262498 TNFRSF10AO00220 468 aa14.73□□□□□ -0.05
CFAP20-201ENST00000262498 DNM1LO00429 736 aa14.73□□□□□ -0.05
CFAP20-201ENST00000262498 CNMDO75829 334 aa14.73□□□□□ -0.05
CFAP20-201ENST00000262498 MAP2K5Q13163 448 aa14.73□□□□□ -0.05
CFAP20-201ENST00000262498 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CFAP20-201ENST00000262498 SNX17Q15036 470 aa14.73□□□□□ -0.05
CFAP20-201ENST00000262498 PLEKHH3Q7Z736 793 aa14.73□□□□□ -0.05
CFAP20-201ENST00000262498 LPAR1Q92633 364 aa14.73□□□□□ -0.05
CFAP20-201ENST00000262498 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CFAP20-201ENST00000262498 FBXO3Q9UK99 471 aa14.73□□□□□ -0.05
CFAP20-201ENST00000262498 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CFAP20-201ENST00000262498 TJAP1Q5JTD0 557 aa14.73□□□□□ -0.05
CFAP20-201ENST00000262498 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa14.73□□□□□ -0.05
CFAP20-201ENST00000262498 BADQ92934 168 aa14.73□□□□□ -0.05
CFAP20-201ENST00000262498 AS3MTQ9HBK9 375 aa14.73□□□□□ -0.05
CFAP20-201ENST00000262498 CEP126Q9P2H0 1117 aa14.73□□□□□ -0.05
CFAP20-201ENST00000262498 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa14.73□□□□□ -0.05
CFAP20-201ENST00000262498 TRIM43BA6NCK2 446 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms