RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261889.9

SNX1-201, Transcript of sorting nexin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX1, Length 3,373 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1-201ENST00000261889 CD44P16070 742 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 ZSCAN26Q16670 478 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 LONRF2Q1L5Z9 754 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 VPS16Q9H269 839 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 VPS54Q9P1Q0 977 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 HDAC6Q9UBN7 1215 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 LAMB4A4D0S4 1761 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 MINDY4BA8MYZ0 360 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 SRGAP2O75044 1071 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 ZSWIM5Q9P217 1185 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 H7C1W4 665 aa14.84□□□□□ -0.03
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SNX1-201ENST00000261889 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP14.84□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 CASP14P31944 242 aa14.84□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 MAP3K14Q99558 947 aa14.84□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 CSRNP2Q9H175 543 aa14.84□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa14.84□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 JAG2Q9Y219 1238 aa14.84□□□□□ -0.03
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SNX1-201ENST00000261889 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 ADAM21Q9UKJ8 722 aa14.84□□□□□ -0.03
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SNX1-201ENST00000261889 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SNX1-201ENST00000261889 SLC12A7Q9Y666 1083 aa14.83□□□□□ -0.04
SNX1-201ENST00000261889 MBD4O95243 580 aa14.83□□□□□ -0.04
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SNX1-201ENST00000261889 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
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SNX1-201ENST00000261889 APPBP2Q92624 585 aa14.83□□□□□ -0.04
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SNX1-201ENST00000261889 ABCB6Q9NP58 842 aa14.83□□□□□ -0.04
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SNX1-201ENST00000261889 SLC35F6Q8N357 371 aa14.82□□□□□ -0.04
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SNX1-201ENST00000261889 RESP18Q5W5W9 173 aa14.82□□□□□ -0.04
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SNX1-201ENST00000261889 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa14.82□□□□□ -0.04
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SNX1-201ENST00000261889 TAB2Q9NYJ8 693 aa14.81□□□□□ -0.04
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SNX1-201ENST00000261889 ADAMTS2O95450 1211 aa14.81□□□□□ -0.04
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SNX1-201ENST00000261889 VSNL1P62760 191 aa14.81□□□□□ -0.04
SNX1-201ENST00000261889 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SNX1-201ENST00000261889 HPSEQ9Y251 543 aa14.81□□□□□ -0.04
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SNX1-201ENST00000261889 DNA2P51530 1060 aa14.81□□□□□ -0.04
SNX1-201ENST00000261889 MAP3K9P80192 1104 aa14.81□□□□□ -0.04
SNX1-201ENST00000261889 DRC1Q96MC2 740 aa14.81□□□□□ -0.04
SNX1-201ENST00000261889 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SNX1-201ENST00000261889 CTNND2Q9UQB3 1225 aa14.81□□□□□ -0.04
SNX1-201ENST00000261889 NAPBQ9H115 298 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX1-201ENST00000261889 KCPQ6ZWJ8 1503 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX1-201ENST00000261889 ZMYM6O95789 1325 aa14.8□□□□□ -0.04
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SNX1-201ENST00000261889 IL2RBP14784 551 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX1-201ENST00000261889 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX1-201ENST00000261889 LY9Q9HBG7 655 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX1-201ENST00000261889 ASAP1Q9ULH1 1129 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX1-201ENST00000261889 LY75O60449 1722 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX1-201ENST00000261889 PDE6AP16499 860 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX1-201ENST00000261889 GOLGA1Q92805 767 aa14.79□□□□□ -0.04
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