RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254730.10

EEFSEC-201, Transcript of eukaryotic elongation factor, selenocysteine-tRNA specific, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EEFSEC, Length 2,232 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSEC-201ENST00000254730 BICD2Q8TD16 824 aa25.18■■□□□ 1.62
EEFSEC-201ENST00000254730 EYA3Q99504 573 aa25.18■■□□□ 1.62
EEFSEC-201ENST00000254730 FLT1P17948 1338 aa25.18■■□□□ 1.62
EEFSEC-201ENST00000254730 TROAPQ12815 778 aa25.17■■□□□ 1.62
EEFSEC-201ENST00000254730 AMOTL1Q8IY63 956 aa25.17■■□□□ 1.62
EEFSEC-201ENST00000254730 TRIM22Q8IYM9 498 aa25.17■■□□□ 1.62
EEFSEC-201ENST00000254730 RTEL1Q9NZ71 1219 aa25.17■■□□□ 1.62
EEFSEC-201ENST00000254730 CLIC4Q9Y696 253 aa25.17■■□□□ 1.62
EEFSEC-201ENST00000254730 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
EEFSEC-201ENST00000254730 FBXO41Q8TF61 875 aa25.17■■□□□ 1.62
EEFSEC-201ENST00000254730 DBNDD1Q9H9R9 158 aa25.17■■□□□ 1.62
EEFSEC-201ENST00000254730 TFAP4Q01664 338 aa25.16■■□□□ 1.62
EEFSEC-201ENST00000254730 TRIM29Q14134 588 aa25.16■■□□□ 1.62
EEFSEC-201ENST00000254730 RCSD1Q6JBY9 416 aa25.16■■□□□ 1.62
EEFSEC-201ENST00000254730 WASF1Q92558 559 aa25.16■■□□□ 1.62
EEFSEC-201ENST00000254730 DACT1Q9NYF0 836 aa25.16■■□□□ 1.62
EEFSEC-201ENST00000254730 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa25.16■■□□□ 1.62
EEFSEC-201ENST00000254730 G3V3G9 751 aa25.16■■□□□ 1.62
EEFSEC-201ENST00000254730 DDAH1O94760 285 aa25.16■■□□□ 1.62
EEFSEC-201ENST00000254730 PLEKHA8P1O95397 391 aa25.16■■□□□ 1.62
EEFSEC-201ENST00000254730 DCAF8Q5TAQ9 597 aa25.16■■□□□ 1.62
EEFSEC-201ENST00000254730 KCNQ5Q9NR82 932 aa25.16■■□□□ 1.62
EEFSEC-201ENST00000254730 DEXIO95424 95 aa25.15■■□□□ 1.62
EEFSEC-201ENST00000254730 FUT2Q10981 343 aa25.15■■□□□ 1.62
EEFSEC-201ENST00000254730 PPP2R5BQ15173 497 aa25.15■■□□□ 1.62
EEFSEC-201ENST00000254730 IL17RBQ9NRM6 502 aa25.15■■□□□ 1.62
EEFSEC-201ENST00000254730 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
EEFSEC-201ENST00000254730 BAG6P46379 1132 aa25.14■■□□□ 1.62
EEFSEC-201ENST00000254730 CNKSR1Q969H4 720 aa25.14■■□□□ 1.62
EEFSEC-201ENST00000254730 MKNK2Q9HBH9 465 aa25.14■■□□□ 1.62
EEFSEC-201ENST00000254730 NR1I2O75469 434 aa25.14■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 CALM1P0DP23 149 aa25.14■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 CALM2P0DP24 149 aa25.14■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 CALM3P0DP25 149 aa25.14■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 LINC00301Q8NCQ3 95 aa25.13■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 RNF214Q8ND24 703 aa25.13■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 NUP62CLQ9H1M0 184 aa25.13■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 SNED1Q8TER0 1413 aa25.13■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 SCNN1DP51172 638 aa25.13■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 C7orf43Q8WVR3 580 aa25.13■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 FUCA2Q9BTY2 467 aa25.13■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa25.13■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 POLR3EQ9NVU0 708 aa25.13■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 KCNJ14Q9UNX9 436 aa25.13■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 RASA1P20936 1047 aa25.12■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP25.12■■□□□ 1.611e-6■■■■■ 28.8
EEFSEC-201ENST00000254730 CAMK4Q16566 473 aa25.12■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP25.12■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 USP17L3A6NCW0 530 aa25.12■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 USP17L4A6NCW7 530 aa25.12■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 MMP1P03956 469 aa25.12■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 ME1P48163 572 aa25.12■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 TMTC3Q6ZXV5 915 aa25.12■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 USP17L1Q7RTZ2 530 aa25.12■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 PCDHA7Q9UN72 937 aa25.12■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 MYH8P13535 1937 aa25.11■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 STK38Q15208 465 aa25.11■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 C16orf86Q6ZW13 317 aa25.11■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 SHISA4Q96DD7 197 aa25.11■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 CLSTN2Q9H4D0 955 aa25.11■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 C10orf71Q711Q0 1435 aa25.11■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa25.1■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 YEATS4O95619 227 aa25.1■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 CDK8P49336 464 aa25.1■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 PKN1Q16512 942 aa25.1■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 ANO1Q5XXA6 986 aa25.1■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 PODNQ7Z5L7 613 aa25.1■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 TSPY3P0CV98 308 aa25.1■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 TSPY8P0CW00 308 aa25.1■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 NT5C2P49902 561 aa25.1■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa25.09■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 ECE2O60344 883 aa25.09■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 PICALMQ13492 652 aa25.09■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 ANKS1AQ92625 1134 aa25.09■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 BTBD18B2RXH4 712 aa25.09■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 DGKHQ86XP1 1220 aa25.09■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 KAT14Q9H8E8 782 aa25.09■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 MAP3K11Q16584 847 aa25.08■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 TNMDQ9H2S6 317 aa25.08■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa25.08■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 V9GY48 417 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
EEFSEC-201ENST00000254730 SPTLC2O15270 562 aa25.08■■□□□ 1.6
EEFSEC-201ENST00000254730 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
EEFSEC-201ENST00000254730 AOC3Q16853 763 aa25.08■■□□□ 1.6
EEFSEC-201ENST00000254730 KCNG4Q8TDN1 519 aa25.08■■□□□ 1.6
EEFSEC-201ENST00000254730 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
EEFSEC-201ENST00000254730 FSIP1Q8NA03 581 aa25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.1 ms