RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239223.3

DUSP1-201, Transcript of dual specificity phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DUSP1, Length 2,019 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1-201ENST00000239223 DNAJC18Q9H819 358 aa22.5■■□□□ 1.19
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DUSP1-201ENST00000239223 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 ERICH2A1L162 156 aa22.5■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 CCDC69A6NI79 296 aa22.5■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 ADD1P35611 737 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.5■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 IQCA1Q86XH1 822 aa22.5■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 WNT10BO00744 389 aa22.49■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 ZBTB43O43298 467 aa22.49■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 SYT1P21579 422 aa22.49■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 TTC6Q86TZ1 520 aa22.49■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.49■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.49■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 PTPDC1A2A3K4 754 aa22.48■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.48■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 SAMD7Q7Z3H4 446 aa22.48■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 CDAN1Q8IWY9 1227 aa22.48■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 MICALL2Q8IY33 904 aa22.48■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa22.48■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 CNTNAP1P78357 1384 aa22.48■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.48■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 MTMR14Q8NCE2 650 aa22.48■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 MTA3Q9BTC8 594 aa22.48■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 VEZTQ9HBM0 779 aa22.48■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 TSPY3P0CV98 308 aa22.47■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 TSPY8P0CW00 308 aa22.47■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 SHMT1P34896 483 aa22.47■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 NUCB2P80303 420 aa22.47■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 NFKBIBQ15653 356 aa22.47■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 GOLGA8AA7E2F4 631 aa22.47■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 BRD1O95696 1058 aa22.47■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.47■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 FDPSP14324 419 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 RPS12P25398 132 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.46■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 NUP133Q8WUM0 1156 aa22.46■■□□□ 1.19
DUSP1-201ENST00000239223 NPM3O75607 178 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
DUSP1-201ENST00000239223 HLA-DOAP06340 250 aa22.45■■□□□ 1.18
DUSP1-201ENST00000239223 AKR1B1P15121 316 aa22.45■■□□□ 1.18
DUSP1-201ENST00000239223 FOSBP53539 338 aa22.45■■□□□ 1.18
DUSP1-201ENST00000239223 RNF181Q9P0P0 153 aa22.45■■□□□ 1.18
DUSP1-201ENST00000239223 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.45■■□□□ 1.18
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DUSP1-201ENST00000239223 NTRK3Q16288 839 aa22.43■■□□□ 1.18
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DUSP1-201ENST00000239223 TMTC2Q8N394 836 aa22.43■■□□□ 1.18
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DUSP1-201ENST00000239223 TMEM39BQ9GZU3 492 aa22.43■■□□□ 1.18
DUSP1-201ENST00000239223 EHD4Q9H223 541 aa22.43■■□□□ 1.18
DUSP1-201ENST00000239223 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
DUSP1-201ENST00000239223 ZNF287Q9HBT7 754 aa22.43■■□□□ 1.18
DUSP1-201ENST00000239223 MTMR6Q9Y217 621 aa22.43■■□□□ 1.18
DUSP1-201ENST00000239223 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
DUSP1-201ENST00000239223 NID2Q14112 1375 aa22.43■■□□□ 1.18
DUSP1-201ENST00000239223 TROAPQ12815 778 aa22.43■■□□□ 1.18
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DUSP1-201ENST00000239223 CSRNP1Q96S65 589 aa22.43■■□□□ 1.18
DUSP1-201ENST00000239223 PI4KBQ9UBF8 816 aa22.43■■□□□ 1.18
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DUSP1-201ENST00000239223 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
DUSP1-201ENST00000239223 CPLX1O14810 134 aa22.42■■□□□ 1.18
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DUSP1-201ENST00000239223 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
DUSP1-201ENST00000239223 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.42■■□□□ 1.18
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DUSP1-201ENST00000239223 RTN1Q16799 776 aa22.41■■□□□ 1.18
DUSP1-201ENST00000239223 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.41■■□□□ 1.18
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DUSP1-201ENST00000239223 CCDC82Q8N4S0 544 aa22.41■■□□□ 1.18
DUSP1-201ENST00000239223 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa22.41■■□□□ 1.18
DUSP1-201ENST00000239223 DDNO94850 711 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
DUSP1-201ENST00000239223 FANCBQ8NB91 859 aa22.41■■□□□ 1.18
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DUSP1-201ENST00000239223 GJB4Q9NTQ9 266 aa22.41■■□□□ 1.18
DUSP1-201ENST00000239223 SWAP70Q9UH65 585 aa22.41■■□□□ 1.18
DUSP1-201ENST00000239223 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
DUSP1-201ENST00000239223 TCHHQ07283 1943 aa22.4■■□□□ 1.18
DUSP1-201ENST00000239223 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
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