RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000226382.3

PHOX2B-201, Transcript of paired like homeobox 2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PHOX2B, Length 3,030 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2B-201ENST00000226382 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
PHOX2B-201ENST00000226382 CD44P16070 742 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PHOX2B-201ENST00000226382 VSNL1P62760 191 aa23.46■■□□□ 1.35
PHOX2B-201ENST00000226382 NTRK3Q16288 839 aa23.46■■□□□ 1.35
PHOX2B-201ENST00000226382 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa23.46■■□□□ 1.35
PHOX2B-201ENST00000226382 VPS16Q9H269 839 aa23.46■■□□□ 1.35
PHOX2B-201ENST00000226382 BLZF1Q9H2G9 400 aa23.46■■□□□ 1.35
PHOX2B-201ENST00000226382 TRIM10Q9UDY6 481 aa23.46■■□□□ 1.35
PHOX2B-201ENST00000226382 MEGF6O75095 1541 aa23.45■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 ENC1O14682 589 aa23.45■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 PRDM1O75626 825 aa23.45■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 ZNF18P17022 549 aa23.45■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 FCHSD1Q86WN1 690 aa23.45■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 GPR108Q9NPR9 543 aa23.45■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 GPIHBP1Q8IV16 184 aa23.45■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP23.45■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 LY9Q9HBG7 655 aa23.45■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 C5P01031 1676 aa23.45■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa23.44■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 SMIM22K7EJ46 135 aa23.44■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 PHKA1P46020 1223 aa23.44■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 SLF1Q9BQI6 1058 aa23.44■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 UBXN6Q9BZV1 441 aa23.44■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 ARMT1Q9H993 441 aa23.44■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 LEKR1Q6ZMV7 388 aa23.44■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa23.44■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 AKAP2Q9Y2D5 859 aa23.44■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 NAPBQ9H115 298 aa23.43■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 A0A087X0B3 334 aa23.43■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 CCDC151A5D8V7 595 aa23.43■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 CPDO75976 1380 aa23.43■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 NR1I3Q14994 352 aa23.43■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 MIGA1Q8NAN2 632 aa23.43■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 MLKLQ8NB16 471 aa23.43■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 CCDC172P0C7W6 258 aa23.42■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 TACC3Q9Y6A5 838 aa23.42■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 ADD2P35612 726 aa23.42■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 MORC3Q14149 939 aa23.42■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 ANKLE2Q86XL3 938 aa23.42■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 CAPZA3Q96KX2 299 aa23.42■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 GREM2Q9H772 168 aa23.42■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 VPS54Q9P1Q0 977 aa23.42■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 CDC23Q9UJX2 597 aa23.42■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 GUCA1BQ9UMX6 200 aa23.42■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 MBD4O95243 580 aa23.41■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 HDAC6Q9UBN7 1215 aa23.41■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 CTAGE9A4FU28 777 aa23.41■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 CTNND2Q9UQB3 1225 aa23.41■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 PDE6AP16499 860 aa23.41■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 FBXL16Q8N461 479 aa23.41■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 MAGEB6Q8N7X4 407 aa23.41■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa23.4■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 MMP1P03956 469 aa23.4■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 TRIM22Q8IYM9 498 aa23.4■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 TAB2Q9NYJ8 693 aa23.4■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 SRGAP2O75044 1071 aa23.4■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 PTPREP23469 700 aa23.4■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 ACTN2P35609 894 aa23.4■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 HSP90B2PQ58FF3 399 aa23.4■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 HDXQ7Z353 690 aa23.4■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 WNT7AO00755 349 aa23.39■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 N4BP3O15049 544 aa23.39■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 ATP8B1O43520 1251 aa23.39■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 ITGA6P23229 1130 aa23.39■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 ZNF174Q15697 407 aa23.39■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 RTN1Q16799 776 aa23.39■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 DACH1Q9UI36 760 aa23.39■■□□□ 1.34
PHOX2B-201ENST00000226382 TDO2P48775 406 aa23.39■■□□□ 1.33
PHOX2B-201ENST00000226382 PLCD1P51178 756 aa23.39■■□□□ 1.33
PHOX2B-201ENST00000226382 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
PHOX2B-201ENST00000226382 FKBP15Q5T1M5 1219 aa23.39■■□□□ 1.33
PHOX2B-201ENST00000226382 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
PHOX2B-201ENST00000226382 MINDY4BA8MYZ0 360 aa23.38■■□□□ 1.33
PHOX2B-201ENST00000226382 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PHOX2B-201ENST00000226382 EXOC4Q96A65 974 aa23.38■■□□□ 1.33
PHOX2B-201ENST00000226382 DRC1Q96MC2 740 aa23.38■■□□□ 1.33
PHOX2B-201ENST00000226382 DPYDQ12882 1025 aa23.38■■□□□ 1.33
PHOX2B-201ENST00000226382 CASP8Q14790 479 aa23.38■■□□□ 1.33
PHOX2B-201ENST00000226382 GOLGA5Q8TBA6 731 aa23.38■■□□□ 1.33
PHOX2B-201ENST00000226382 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PHOX2B-201ENST00000226382 A0A1B0GTH6 734 aa23.38■■□□□ 1.33
PHOX2B-201ENST00000226382 CTAGE15A4D2H0 777 aa23.38■■□□□ 1.33
PHOX2B-201ENST00000226382 CIAO1O76071 339 aa23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms