RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216840.10

RABGGTA-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-201ENST00000216840 TEX11Q8IYF3 940 aa19.99■□□□□ 0.79
RABGGTA-201ENST00000216840 CCDC82Q8N4S0 544 aa19.99■□□□□ 0.79
RABGGTA-201ENST00000216840 LINC00301Q8NCQ3 95 aa19.99■□□□□ 0.79
RABGGTA-201ENST00000216840 RNF214Q8ND24 703 aa19.99■□□□□ 0.79
RABGGTA-201ENST00000216840 TSPY2A6NKD2 308 aa19.99■□□□□ 0.79
RABGGTA-201ENST00000216840 H0YIN7 160 aa19.99■□□□□ 0.79
RABGGTA-201ENST00000216840 CALM1P0DP23 149 aa19.99■□□□□ 0.79
RABGGTA-201ENST00000216840 CALM2P0DP24 149 aa19.99■□□□□ 0.79
RABGGTA-201ENST00000216840 CALM3P0DP25 149 aa19.99■□□□□ 0.79
RABGGTA-201ENST00000216840 DOK7Q18PE1 504 aa19.99■□□□□ 0.79
RABGGTA-201ENST00000216840 CLSTN2Q9H4D0 955 aa19.99■□□□□ 0.79
RABGGTA-201ENST00000216840 TAOK2Q9UL54 1235 aa19.99■□□□□ 0.79
RABGGTA-201ENST00000216840 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa19.99■□□□□ 0.79
RABGGTA-201ENST00000216840 YEATS4O95619 227 aa19.98■□□□□ 0.79
RABGGTA-201ENST00000216840 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP19.98■□□□□ 0.792e-6■■■□□ 16.9
RABGGTA-201ENST00000216840 FUT2Q10981 343 aa19.98■□□□□ 0.79
RABGGTA-201ENST00000216840 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
RABGGTA-201ENST00000216840 CERS5Q8N5B7 392 aa19.98■□□□□ 0.79
RABGGTA-201ENST00000216840 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
RABGGTA-201ENST00000216840 PPP1R9BQ96SB3 815 aa19.98■□□□□ 0.79
RABGGTA-201ENST00000216840 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
RABGGTA-201ENST00000216840 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
RABGGTA-201ENST00000216840 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
RABGGTA-201ENST00000216840 ME1P48163 572 aa19.98■□□□□ 0.79
RABGGTA-201ENST00000216840 PLCD1P51178 756 aa19.98■□□□□ 0.79
RABGGTA-201ENST00000216840 CCDC173Q0VFZ6 552 aa19.98■□□□□ 0.79
RABGGTA-201ENST00000216840 CAMK4Q16566 473 aa19.98■□□□□ 0.79
RABGGTA-201ENST00000216840 FBXW7Q969H0 707 aa19.98■□□□□ 0.79
RABGGTA-201ENST00000216840 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP19.98■□□□□ 0.79
RABGGTA-201ENST00000216840 PCDHA7Q9UN72 937 aa19.98■□□□□ 0.79
RABGGTA-201ENST00000216840 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa19.98■□□□□ 0.79
RABGGTA-201ENST00000216840 TFAP4Q01664 338 aa19.97■□□□□ 0.79
RABGGTA-201ENST00000216840 STK38Q15208 465 aa19.97■□□□□ 0.79
RABGGTA-201ENST00000216840 MAP3K11Q16584 847 aa19.97■□□□□ 0.79
RABGGTA-201ENST00000216840 ANO1Q5XXA6 986 aa19.97■□□□□ 0.79
RABGGTA-201ENST00000216840 RCSD1Q6JBY9 416 aa19.97■□□□□ 0.79
RABGGTA-201ENST00000216840 EYA3Q99504 573 aa19.97■□□□□ 0.79
RABGGTA-201ENST00000216840 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa19.97■□□□□ 0.79
RABGGTA-201ENST00000216840 FLT1P17948 1338 aa19.97■□□□□ 0.79
RABGGTA-201ENST00000216840 MMP1P03956 469 aa19.96■□□□□ 0.79
RABGGTA-201ENST00000216840 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
RABGGTA-201ENST00000216840 KCNG4Q8TDN1 519 aa19.96■□□□□ 0.79
RABGGTA-201ENST00000216840 TNMDQ9H2S6 317 aa19.96■□□□□ 0.79
RABGGTA-201ENST00000216840 MKNK2Q9HBH9 465 aa19.96■□□□□ 0.79
RABGGTA-201ENST00000216840 IL17RBQ9NRM6 502 aa19.96■□□□□ 0.79
RABGGTA-201ENST00000216840 PLEKHA8P1O95397 391 aa19.96■□□□□ 0.79
RABGGTA-201ENST00000216840 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
RABGGTA-201ENST00000216840 SPTLC2O15270 562 aa19.95■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 CHRNA5P30532 468 aa19.95■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 ADALQ6DHV7 355 aa19.95■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 SLC44A5Q8NCS7 719 aa19.95■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 ANKS1AQ92625 1134 aa19.95■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 MXD3Q9BW11 206 aa19.95■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 KCNJ14Q9UNX9 436 aa19.95■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 PKN1Q16512 942 aa19.95■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 TMTC3Q6ZXV5 915 aa19.95■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 A0A1W2PQ27 194 aa19.94■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 A0A1W2PQ64 194 aa19.94■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 A0A1W2PQD8 194 aa19.94■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 F8W031 263 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 G3V3G9 751 aa19.94■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 DCAF8Q5TAQ9 597 aa19.94■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 DGKHQ86XP1 1220 aa19.94■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 ENGASEQ8NFI3 743 aa19.94■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa19.94■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa19.94■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 BTBD18B2RXH4 712 aa19.93■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 CCDC192P0DO97 292 aa19.93■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 RASA1P20936 1047 aa19.93■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 SLC39A14Q15043 492 aa19.93■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP19.93■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa19.93■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 C16orf86Q6ZW13 317 aa19.93■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 CKAP2LQ8IYA6 745 aa19.93■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 FSIP1Q8NA03 581 aa19.93■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 CCDC178Q5BJE1 867 aa19.93■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 NOSTRINQ8IVI9 506 aa19.93■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 CNKSR1Q969H4 720 aa19.93■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 SHISA4Q96DD7 197 aa19.93■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 USP17L3A6NCW0 530 aa19.92■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 USP17L4A6NCW7 530 aa19.92■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 TSPY3P0CV98 308 aa19.92■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 TSPY8P0CW00 308 aa19.92■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 CDK8P49336 464 aa19.92■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 FAM160A1Q05DH4 1040 aa19.92■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 UVSSAQ2YD98 709 aa19.92■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 USP17L1Q7RTZ2 530 aa19.92■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 PODNQ7Z5L7 613 aa19.92■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 MAP3K14Q99558 947 aa19.92■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
RABGGTA-201ENST00000216840 KAT14Q9H8E8 782 aa19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.6 ms